Etawa羊酪蛋白水解物生物活性降压肽的虚拟筛选

S. Hermanto
{"title":"Etawa羊酪蛋白水解物生物活性降压肽的虚拟筛选","authors":"S. Hermanto","doi":"10.18860/AL.V5I2.3671","DOIUrl":null,"url":null,"abstract":"Penapisan peptida bioaktif dari hidrolisat kasein susu kambing Etawa yang berpotensi sebagai obat antihipertensi berdasarkan kajian in silico telah dilakukan. Protein yang digunakan adalah α-S1-kasein prekursor [ Capra hircus ] NCBI Reference Sequence : NP_001272624.1, α-S2-kasein prekursor [ C. hircus ] NCBI Reference Sequence : NP_001272514.1, β-kasein [ C. hircus ] NCBI Reference Sequence : AAA30906.1 dan κ-kasein prekursor [ C. hircus ] NCBI Reference Sequence : NP_001272516.1. Perancangan struktur peptida bioaktif dilakukan melalui simulasi hidrolisis enzimatik dengan menggunakan 3 jenis enzim proteolitik (tripsin, kimotripsin dan pepsin) dan dilanjutkan dengan preparasi struktur 3D ligan hasil pemotongan secara in silico . Virtual screening terhadap fragmen peptida dilakukan melalui penentuan nilai drug likeness dan protease inhibitor. Dari 104 fragmen peptida diperoleh 10 kandidat peptida bioaktif yang dilakukan simulasi molecular docking dengan mengeksplorasi daya inhibisi fragmen melalui perhitungan nilai (∆ G binding ) dan interaksi antara kandidat peptida bioaktif dengan residu asam amino pada sisi aktif enzim ACE ( Angiotensin Converting Enzyme) . Sebagai kontrol positif digunakan lisinopril yang merupakan inhibitor ACE komersil. Hasil penelitian menunjukkan dari 10 kandidat peptida bioaktif terdapat 6 peptida yang diduga bersifat antihipertensi dengan nilai ∆ G binding yang lebih rendah dari kontrol positif (lisinopril). Keenam peptida tersebut diharapkan dapat berfungsi sebagai obat alternatif antihipertensi.","PeriodicalId":31035,"journal":{"name":"Alchemy Journal of Chemistry","volume":"130 1","pages":"45-54"},"PeriodicalIF":0.0000,"publicationDate":"2016-11-01","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":"1","resultStr":"{\"title\":\"Virtual Screening Peptida Bioaktif Antihipertensi dari Hidrolisat Kasein Susu Kambing Etawa\",\"authors\":\"S. Hermanto\",\"doi\":\"10.18860/AL.V5I2.3671\",\"DOIUrl\":null,\"url\":null,\"abstract\":\"Penapisan peptida bioaktif dari hidrolisat kasein susu kambing Etawa yang berpotensi sebagai obat antihipertensi berdasarkan kajian in silico telah dilakukan. Protein yang digunakan adalah α-S1-kasein prekursor [ Capra hircus ] NCBI Reference Sequence : NP_001272624.1, α-S2-kasein prekursor [ C. hircus ] NCBI Reference Sequence : NP_001272514.1, β-kasein [ C. hircus ] NCBI Reference Sequence : AAA30906.1 dan κ-kasein prekursor [ C. hircus ] NCBI Reference Sequence : NP_001272516.1. Perancangan struktur peptida bioaktif dilakukan melalui simulasi hidrolisis enzimatik dengan menggunakan 3 jenis enzim proteolitik (tripsin, kimotripsin dan pepsin) dan dilanjutkan dengan preparasi struktur 3D ligan hasil pemotongan secara in silico . Virtual screening terhadap fragmen peptida dilakukan melalui penentuan nilai drug likeness dan protease inhibitor. Dari 104 fragmen peptida diperoleh 10 kandidat peptida bioaktif yang dilakukan simulasi molecular docking dengan mengeksplorasi daya inhibisi fragmen melalui perhitungan nilai (∆ G binding ) dan interaksi antara kandidat peptida bioaktif dengan residu asam amino pada sisi aktif enzim ACE ( Angiotensin Converting Enzyme) . Sebagai kontrol positif digunakan lisinopril yang merupakan inhibitor ACE komersil. Hasil penelitian menunjukkan dari 10 kandidat peptida bioaktif terdapat 6 peptida yang diduga bersifat antihipertensi dengan nilai ∆ G binding yang lebih rendah dari kontrol positif (lisinopril). Keenam peptida tersebut diharapkan dapat berfungsi sebagai obat alternatif antihipertensi.\",\"PeriodicalId\":31035,\"journal\":{\"name\":\"Alchemy Journal of Chemistry\",\"volume\":\"130 1\",\"pages\":\"45-54\"},\"PeriodicalIF\":0.0000,\"publicationDate\":\"2016-11-01\",\"publicationTypes\":\"Journal Article\",\"fieldsOfStudy\":null,\"isOpenAccess\":false,\"openAccessPdf\":\"\",\"citationCount\":\"1\",\"resultStr\":null,\"platform\":\"Semanticscholar\",\"paperid\":null,\"PeriodicalName\":\"Alchemy Journal of Chemistry\",\"FirstCategoryId\":\"1085\",\"ListUrlMain\":\"https://doi.org/10.18860/AL.V5I2.3671\",\"RegionNum\":0,\"RegionCategory\":null,\"ArticlePicture\":[],\"TitleCN\":null,\"AbstractTextCN\":null,\"PMCID\":null,\"EPubDate\":\"\",\"PubModel\":\"\",\"JCR\":\"\",\"JCRName\":\"\",\"Score\":null,\"Total\":0}","platform":"Semanticscholar","paperid":null,"PeriodicalName":"Alchemy Journal of Chemistry","FirstCategoryId":"1085","ListUrlMain":"https://doi.org/10.18860/AL.V5I2.3671","RegionNum":0,"RegionCategory":null,"ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":null,"EPubDate":"","PubModel":"","JCR":"","JCRName":"","Score":null,"Total":0}
引用次数: 1

摘要

从Etawa牛奶酪蛋白水解物中筛选出生物活性肽,进行了基于计算机研究的潜在降压药物。所使用的蛋白质是α-S1酪蛋白前体[Capira hircus]NCBI参考序列:NP_001272624.1,α-S2酪蛋白前体[C.hircus]NCBI参考顺序:NP_00127.2514.1,β-酪蛋白[C.hircus]NC BI参考顺序为AAA30906.1和κ-酪蛋白前体.C.hircus]NCBI参考顺序为NP_001272516.1。生物活性肽结构设计是通过使用3种类型的蛋白水解酶(tripsin、kimotripsin和胃蛋白酶)的酶水解模拟进行的,并继续制备3D结构配体,这是硅切割的结果。通过确定药物相似性和蛋白酶抑制剂值来进行针对肽片段的虚拟筛选。在104个肽片段中,获得了10个候选生物活性肽,它们通过分子对接进行模拟,通过计算值(∆G结合)探索片段的抑制能力,以及候选生物活性多肽与ACE酶(血管紧张素转换酶)活性侧氨基酸残基之间的相互作用。赖氨诺普利是一种商业ACE抑制剂,用作阳性对照。研究表明,在10种候选生物活性肽中,有6种预期的降压肽的∆G结合值低于阳性对照(赖诺普利)。这六种肽有望作为一种替代降压药物发挥作用。
本文章由计算机程序翻译,如有差异,请以英文原文为准。
Virtual Screening Peptida Bioaktif Antihipertensi dari Hidrolisat Kasein Susu Kambing Etawa
Penapisan peptida bioaktif dari hidrolisat kasein susu kambing Etawa yang berpotensi sebagai obat antihipertensi berdasarkan kajian in silico telah dilakukan. Protein yang digunakan adalah α-S1-kasein prekursor [ Capra hircus ] NCBI Reference Sequence : NP_001272624.1, α-S2-kasein prekursor [ C. hircus ] NCBI Reference Sequence : NP_001272514.1, β-kasein [ C. hircus ] NCBI Reference Sequence : AAA30906.1 dan κ-kasein prekursor [ C. hircus ] NCBI Reference Sequence : NP_001272516.1. Perancangan struktur peptida bioaktif dilakukan melalui simulasi hidrolisis enzimatik dengan menggunakan 3 jenis enzim proteolitik (tripsin, kimotripsin dan pepsin) dan dilanjutkan dengan preparasi struktur 3D ligan hasil pemotongan secara in silico . Virtual screening terhadap fragmen peptida dilakukan melalui penentuan nilai drug likeness dan protease inhibitor. Dari 104 fragmen peptida diperoleh 10 kandidat peptida bioaktif yang dilakukan simulasi molecular docking dengan mengeksplorasi daya inhibisi fragmen melalui perhitungan nilai (∆ G binding ) dan interaksi antara kandidat peptida bioaktif dengan residu asam amino pada sisi aktif enzim ACE ( Angiotensin Converting Enzyme) . Sebagai kontrol positif digunakan lisinopril yang merupakan inhibitor ACE komersil. Hasil penelitian menunjukkan dari 10 kandidat peptida bioaktif terdapat 6 peptida yang diduga bersifat antihipertensi dengan nilai ∆ G binding yang lebih rendah dari kontrol positif (lisinopril). Keenam peptida tersebut diharapkan dapat berfungsi sebagai obat alternatif antihipertensi.
求助全文
通过发布文献求助,成功后即可免费获取论文全文。 去求助
来源期刊
自引率
0.00%
发文量
6
审稿时长
8 weeks
×
引用
GB/T 7714-2015
复制
MLA
复制
APA
复制
导出至
BibTeX EndNote RefMan NoteFirst NoteExpress
×
提示
您的信息不完整,为了账户安全,请先补充。
现在去补充
×
提示
您因"违规操作"
具体请查看互助需知
我知道了
×
提示
确定
请完成安全验证×
copy
已复制链接
快去分享给好友吧!
我知道了
右上角分享
点击右上角分享
0
联系我们:info@booksci.cn Book学术提供免费学术资源搜索服务,方便国内外学者检索中英文文献。致力于提供最便捷和优质的服务体验。 Copyright © 2023 布克学术 All rights reserved.
京ICP备2023020795号-1
ghs 京公网安备 11010802042870号
Book学术文献互助
Book学术文献互助群
群 号:481959085
Book学术官方微信