Polymorphisme du gène coronine du Plasmodium falciparum dans les populations naturelles du P. falcifarum au Mali

Introduction

L’émergence de la résistance aux combinaisons thérapeutiques à base d'artémisinine (CTA) découverte au Cambodge en Asie de Sud Est menace le contrôle du paludisme dans le monde entier. Pour cela, l'Organisation mondiale de la santé (OMS) recommande la surveillance serrée de l'efficacité de ces CTA pour chercher les marqueurs de résistance mais aussi ceux potentiels. De ce fait, trois mutations (G50E, R100K, E107V) du gène coronine du P. falciparum ont été associées à la résistance de la dihydroartémisinine in vitro dans les lignées sénégalaises en 2018. Malheureusement, la prévalence de ces mutations dans les populations naturelles du P. falciparum au Mali reste inconnue. Notre étude documentait la présence de ce marqueur potentiel de la résistance aux CTA au Mali.

Méthodes

Nous avons fait une analyse secondaire à partir de 178 séquences de génomes entiers des isolants du P. falciparum. Ces isolants ont été collectés dans deux sites du Mali, Bougoula-Hammeau et Faladjè, dans une étude longitudinale prospective conduite à partir d'octobre 2015 jusqu’à mars 2016 auprès des patients âgés de 6 ans et plus. L'objectif de cette étude était de comparer le temps de clairance parasitaire après un traitement par monothérapie à l'artésunate de cas de paludisme non compliqué dans deux régions différentes du Mali. Des échantillons prélevés au J0 avant l'instauration du traitement ont été envoyés au Wellcome Sanger Institute (Wellcome Genome Campus, Hinxton, Royaume-Uni) pour le séquençage du génome entier pour rechercher des marqueurs moléculaires de la résistance aux médicaments. Ces séquences ont été stockées et conservées dans le serveur du DELGEME au Mali. Sous l'autorisation du programme DELGEME, nous avons réanalysé ces données à l'aide des outils bio-informatiques pour documenter ce marqueur potentiel.

Résultats

Après l'exploitation de ces données, aucune des mutations du gène coronine associées à la résistance de la Dihydroartémisnine au Sénégal n'a été trouvée. Mais deux autres mutations non synonymes ((A151L, G505G) ont été isolées.

Conclusion

Ces résultats donnent une information de base sur le polymorphisme du gène coronine de P. falcifarum au Mali