从秘鲁库斯科马拉斯盐沼分离的芽孢杆菌sp. M62 l -天冬酰胺酶的生物信息学特性和生产

IF 0.5 Q4 BIOLOGY
Susana Calderón-Toledo, Ysamar Tapia-Bañez, Karim Jiménez-Aliaga, Cynthia Esquerre-Huallpa, A. I. Zavaleta
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摘要

该研究的目的是进行生物信息学表征,并优化从Maras盐碱地(CUSCO)分离的Bacillus sp.M62细胞外L-天冬酰胺酶的产生。为此,用0.0075%溴酚蓝修饰的M9培养基在37°C下旋转72小时,验证了L-天冬酰胺酶的产生。同时提取基因组DNA,扩增16S核糖体基因和ANSA3基因。通过生物信息学分析预测了ANSA3基因编码的氨基酸序列。在改良的M9培养基中,在不同的葡萄糖、L-天冬酰胺、NaCl和pH水平下评估了细胞内和细胞外L-天冬酰胺酶的产生。此外,通过定量Nessler法释放的铵来测定L-天冬酰胺酶和L-谷氨酰胺酶的酶活性。因此,Bacillus sp.M62产生了改良的M9培养基的病毒,与地衣芽孢杆菌具有高度的相似性和进化密切性,发现扩增的ANSA3基因编码319个AA,其中预测了一个活性位点模式序列(GFvitHGTDTM)和15个免疫原性位点。细胞外L-天冬酰胺酶的产量高于细胞内L-天冬酰胺酶的产量,从0.37 U/ml(0.24 U/mg)优化为2.15±0.39 U/ml(0.63 U/mg)。最后,发现Bacillus sp.m62具有最低L-谷氨酰胺酶活性的细胞外L-天冬酰胺酶。
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Caracterización bioinformática y producción de L-asparaginasa de Bacillus sp. M62 aislado de las salinas de Maras, Cusco, Perú
El objetivo del estudio fue realizar la caracterización bioinformática, así como optimizar la producción de L-asparaginasa extracelular de Bacillus sp. M62 aislada de las salinas de Maras (Cusco). Para ello, se verificó la producción de L-asparaginasa mediante el viraje del medio M9 modificado con azul de bromofenol 0.0075%, pH 7.4 a 37 °C por 72 h. A la vez, se extrajo el ADN genómico para amplificar los genes ribosómicos 16S y el gen ansA3. La secuencia aminoacídica codificada por el gen ansA3 se predijo mediante análisis bioinformático. La producción de L-asparaginasa intracelular y extracelular se evaluó a diferentes niveles de glucosa, L-asparagina, NaCl y pH en el medio M9 modificado. Adicionalmente, las actividades enzimáticas de L-asparaginasa y L-glutaminasa se determinaron mediante cuantificación del amonio liberado por el método de Nessler. Así, Bacillus sp. M62 produjo el viraje del medio M9 modificado, obtuvo alta similitud y cercanía evolutiva con Bacillus licheniformis, se encontró que el gen ansA3 amplificado codificaba para 319 aa, dentro de la cual se predijo una secuencia patrón del sitio activo (GFVITHGTDTM ) y 15 sitios inmunogénicos. La producción de L-asparaginasa extracelular fue superior a la intracelular, la que se optimizó de 0.37 U/mL (0.24 U/mg) a 2.15 ± 0.39 U/mL (0.63 U/mg). Finalmente, se encontró que Bacillus sp. M62 presenta L-asparaginasa extracelular con mínima actividad de L-glutaminasa.
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期刊介绍: The REVISTA PERUANA DE BIOLOGIA is a peer reviewed scientific journal, published by Instituto de Investigaciones de Ciencias Biológicas Antonio Raimondi, Facultad de Ciencias Biológicas, Universidad Nacional Mayor de San Marcos, Lima, Perú. It is publish on line and printed form in February, May, August, November. The REVISTA PERUANA DE BIOLOGIA publishes original research articles of outstanding scientific significance and relevance on topics of biodiversity, biotechnology, ecology, environmental management and biomedicine. The works may be submitted in English or Spanish. The articles will be reviewed by referees according to international standards of quality, creativity, originality and contribution to knowledge.
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