从蜕皮羽毛看库斯科和阿普里马克秃鹰线粒体DNA的遗传变异

IF 0.5 Q4 BIOLOGY
Ramón Gustavo Quispe Montoya, J. A. Ochoa, Holger Mayta Malpartida
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摘要

通过扩增和测序与12S核糖体控制区和亚基(D-loop-Arnr12S)以及细胞色素氧化酶I亚基(IOC)和NADH脱氢酶II亚基(ND2)基因相对应的线粒体DNA,评估了库斯科和阿普里马克地区秃鹰(安第斯秃鹰)的种群内遗传变异性。DNA是从圈养和野生标本的蜕皮羽毛中提取的。分析了遗传多样性的主要指标:单倍型多样性、核型多样性、平均核型差异数和多态位点数。对所分析的三个DNA区域进行PCR扩增的成功率为100%。从D-Loop-Arnr12S区域获得了600 PB的序列,表征了4种单倍型,从IOC基因获得了704 PB的序列,从ND2基因获得了1090 PB的序列,表征了5种单倍型。IOC基因表现出最大的单倍型多样性值(HD=0.468),D-Loop-Arnr12S基因区域表现出最大的核型多样性指数(π=0.00086),而IOC基因表现出最大的平均核型差异数(K=0.52615)。结果显示,研究地区安第斯秃鹰线粒体基因的遗传变异水平较低,这将表明遗传结构均匀的种群。
本文章由计算机程序翻译,如有差异,请以英文原文为准。
Variabilidad genética del ADN mitocondrial de Vultur gryphus (cóndor andino) en Cusco y Apurímac a partir de plumas de muda
La variabilidad genética intrapoblacional de Vultur gryphus (cóndores andinos) de las regiones de Cusco y Apurímac fue evaluada mediante amplificación y secuenciación del ADN mitocondrial correspondientes a la región control y subunidad ribosomal 12S (D-Loop-ARNr12S), y a los genes Citocromo Oxidasa subunidad I (COI) y NADH deshidrogenasa subunidad II (ND2). El ADN se extrajo a partir de cálamos de plumas de muda de ejemplares en cautiverio y silvestres. Se analizaron los principales índices de diversidad genética como son: la diversidad haplotípica, la diversidad nucleotídica, el número promedio de diferencias nucleotídicas y el número de sitios polimórficos. La tasa de éxito de amplificación mediante PCR fue de 100% para las tres regiones de ADN analizadas. Se secuenció 600 pb de la región D-Loop-ARNr12S caracterizándose cuatro haplotipos, 704 pb del gen COI caracterizándose seis haplotipos y 1090 pb del gen ND2 caracterizándose cinco haplotipos. El gen COI presentó el mayor valor de diversidad haplotípica (Hd = 0.468), la región del gen D-Loop-ARNr12S presentó el mayor índice de diversidad nucleotídica (π = 0.00086), mientras que el gen COI presentó el mayor número promedio de diferencias nucleotídicas (K = 0.52615). Los resultados muestran bajos niveles de variabilidad genética en los genes mitocondriales de los cóndores andinos de la zona de estudio, que indicarían una población con estructura genética homogénea.
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Revista Peruana de Biologia
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期刊介绍: The REVISTA PERUANA DE BIOLOGIA is a peer reviewed scientific journal, published by Instituto de Investigaciones de Ciencias Biológicas Antonio Raimondi, Facultad de Ciencias Biológicas, Universidad Nacional Mayor de San Marcos, Lima, Perú. It is publish on line and printed form in February, May, August, November. The REVISTA PERUANA DE BIOLOGIA publishes original research articles of outstanding scientific significance and relevance on topics of biodiversity, biotechnology, ecology, environmental management and biomedicine. The works may be submitted in English or Spanish. The articles will be reviewed by referees according to international standards of quality, creativity, originality and contribution to knowledge.
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