乍得恩贾梅纳国家参考医院分离出的沙门氏菌血清型的流行情况和特征描述

H. Abba, Ban-bo Bebanto Antipas, Edith Marguerite Nikiema, Jean Bienvenue Ouoba, K. Gamougame, Evariste Bako, Soutongnooma Caroline Bouda, Abdoulaye Kuan Traore, Bessimbaye Nadlou, Abdelsalam Adoum Doutoum, Nicolas Barro
{"title":"乍得恩贾梅纳国家参考医院分离出的沙门氏菌血清型的流行情况和特征描述","authors":"H. Abba, Ban-bo Bebanto Antipas, Edith Marguerite Nikiema, Jean Bienvenue Ouoba, K. Gamougame, Evariste Bako, Soutongnooma Caroline Bouda, Abdoulaye Kuan Traore, Bessimbaye Nadlou, Abdelsalam Adoum Doutoum, Nicolas Barro","doi":"10.4314/ijbcs.v17i6.7","DOIUrl":null,"url":null,"abstract":"Les Salmonelles se retrouvent parmi les agents pathogènes multirésistants qui suscitent une grande inquiétude au Centre Hospitalier de Référence Nationale (CHU-RN) de N’Djamena. Ils sont responsables des toxi-infections alimentaires et de la fièvre typhoïde. Le but de cette étude était d’actualiser la connaissance sur la présence, la diversité et l’antibiorésistance de Salmonella spp dans le milieu hospitalier au Tchad. Au total, 341 spécimens de selles des patients hospitalisés et externes ont été collectés entre août 2018 et févier 2019. L’identification des souches de Salmonella a été réalisée à l’aide de la galérie Api 20E et confirmée par l’automate compact VITEK® 2TM 15 au Tchad et sur le milieu XLT4 de l’institut Pasteur en France. Les isolats ont été caractérisés à l'aide d’un sérotypage en utilisant le Kit de Kauffmann-White. Les tests de sensibilité aux antimicrobiens ont été réalisés selon les directives de EUCAST. Les résultats montrent que le phénotype de résistance aux bêta-lactamases à spectre étendu (BLSE) a été signalé dans 42% des isolats. Environ 2% (6/314) des échantillons étaient positifs pour Salmonella. Parmi les 6 sérovars identifiés, Salmonella enteritidis (50%) était le plus commun, suivi de S. colindale (33,3%) et S. grampian (16,7). 100% des isolats (6) étaient résistants à au moins un antimicrobien. La résistance a été le plus fréquemment observée à l'amoxicilline-acide clavulanique, Cotrimoxazole et à la Tétracycline (100%). De plus, une diminution de sensibilité au ceftriaxone (83,3%) et l’aztreoname (83,3%) a été observée. Nos résultats ont indiqué une augmentation de la contamination par Salmonella et l’apparition des isolats résistants à plusieurs antimicrobiens dans le CHU. \nSalmonella spp are among the pathogens and multi-resistant agents that are causing great concern at the National Reference General Hospital (HGRN) in N'djamena. They are responsible for food poisoning and typhoid fever. This study has aimed to update knowledge on the presence, diversity and antibiotic resistance of Salmonella spp in hospitals in Chad. A total of 341 stool specimens from inpatients and outpatients were collected between August 2018 and February 2019. The identification of Salmonella strains was carried out using the Api 20E gallery and confirmed by the VITEK® 2TM 15 compact automaton in Chad and on the XLT4 medium at the Pasteur Institute in France. Isolates were characterized by serotyping using the Kauffmann-White Kit. Antimicrobial susceptibility testing was performed according to EUCAST guidelines. Extended-spectrum beta-lactamase (ESBL) resistance phenotype was reported in 42% of isolates. About 2% (6/314) of the samples were positive for Salmonella. Among the 6 sérovars identified, Salmonella enteritidis (50%) was the most common, followed by S. colindale (33.3%) and S. grampian (16.7). 100% of isolates (6) were resistant to at least one antimicrobial. Resistance was most frequently observed to amoxicillin-clavulanic acid, Cotrimoxazole and Tetracycline (100%). Moreover, a decrease in sensitivity to ceftriaxone (83.3%) and aztreonam (83.3%) was observed. Our results indicated an increase in Salmonella contamination and the appearance of isolates resistant to several antimicrobials in the CHU.","PeriodicalId":13808,"journal":{"name":"International Journal of Biological and Chemical Sciences","volume":"121 25","pages":""},"PeriodicalIF":0.0000,"publicationDate":"2024-01-18","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":"0","resultStr":"{\"title\":\"Prévalence et caractérisation des sérotypes de Salmonella isolées au CHU la Référence Nationale de N’Djaména au Tchad\",\"authors\":\"H. Abba, Ban-bo Bebanto Antipas, Edith Marguerite Nikiema, Jean Bienvenue Ouoba, K. Gamougame, Evariste Bako, Soutongnooma Caroline Bouda, Abdoulaye Kuan Traore, Bessimbaye Nadlou, Abdelsalam Adoum Doutoum, Nicolas Barro\",\"doi\":\"10.4314/ijbcs.v17i6.7\",\"DOIUrl\":null,\"url\":null,\"abstract\":\"Les Salmonelles se retrouvent parmi les agents pathogènes multirésistants qui suscitent une grande inquiétude au Centre Hospitalier de Référence Nationale (CHU-RN) de N’Djamena. Ils sont responsables des toxi-infections alimentaires et de la fièvre typhoïde. Le but de cette étude était d’actualiser la connaissance sur la présence, la diversité et l’antibiorésistance de Salmonella spp dans le milieu hospitalier au Tchad. Au total, 341 spécimens de selles des patients hospitalisés et externes ont été collectés entre août 2018 et févier 2019. L’identification des souches de Salmonella a été réalisée à l’aide de la galérie Api 20E et confirmée par l’automate compact VITEK® 2TM 15 au Tchad et sur le milieu XLT4 de l’institut Pasteur en France. Les isolats ont été caractérisés à l'aide d’un sérotypage en utilisant le Kit de Kauffmann-White. Les tests de sensibilité aux antimicrobiens ont été réalisés selon les directives de EUCAST. Les résultats montrent que le phénotype de résistance aux bêta-lactamases à spectre étendu (BLSE) a été signalé dans 42% des isolats. Environ 2% (6/314) des échantillons étaient positifs pour Salmonella. Parmi les 6 sérovars identifiés, Salmonella enteritidis (50%) était le plus commun, suivi de S. colindale (33,3%) et S. grampian (16,7). 100% des isolats (6) étaient résistants à au moins un antimicrobien. La résistance a été le plus fréquemment observée à l'amoxicilline-acide clavulanique, Cotrimoxazole et à la Tétracycline (100%). De plus, une diminution de sensibilité au ceftriaxone (83,3%) et l’aztreoname (83,3%) a été observée. Nos résultats ont indiqué une augmentation de la contamination par Salmonella et l’apparition des isolats résistants à plusieurs antimicrobiens dans le CHU. \\nSalmonella spp are among the pathogens and multi-resistant agents that are causing great concern at the National Reference General Hospital (HGRN) in N'djamena. They are responsible for food poisoning and typhoid fever. This study has aimed to update knowledge on the presence, diversity and antibiotic resistance of Salmonella spp in hospitals in Chad. A total of 341 stool specimens from inpatients and outpatients were collected between August 2018 and February 2019. The identification of Salmonella strains was carried out using the Api 20E gallery and confirmed by the VITEK® 2TM 15 compact automaton in Chad and on the XLT4 medium at the Pasteur Institute in France. Isolates were characterized by serotyping using the Kauffmann-White Kit. Antimicrobial susceptibility testing was performed according to EUCAST guidelines. Extended-spectrum beta-lactamase (ESBL) resistance phenotype was reported in 42% of isolates. About 2% (6/314) of the samples were positive for Salmonella. Among the 6 sérovars identified, Salmonella enteritidis (50%) was the most common, followed by S. colindale (33.3%) and S. grampian (16.7). 100% of isolates (6) were resistant to at least one antimicrobial. Resistance was most frequently observed to amoxicillin-clavulanic acid, Cotrimoxazole and Tetracycline (100%). Moreover, a decrease in sensitivity to ceftriaxone (83.3%) and aztreonam (83.3%) was observed. Our results indicated an increase in Salmonella contamination and the appearance of isolates resistant to several antimicrobials in the CHU.\",\"PeriodicalId\":13808,\"journal\":{\"name\":\"International Journal of Biological and Chemical Sciences\",\"volume\":\"121 25\",\"pages\":\"\"},\"PeriodicalIF\":0.0000,\"publicationDate\":\"2024-01-18\",\"publicationTypes\":\"Journal Article\",\"fieldsOfStudy\":null,\"isOpenAccess\":false,\"openAccessPdf\":\"\",\"citationCount\":\"0\",\"resultStr\":null,\"platform\":\"Semanticscholar\",\"paperid\":null,\"PeriodicalName\":\"International Journal of Biological and Chemical Sciences\",\"FirstCategoryId\":\"1085\",\"ListUrlMain\":\"https://doi.org/10.4314/ijbcs.v17i6.7\",\"RegionNum\":0,\"RegionCategory\":null,\"ArticlePicture\":[],\"TitleCN\":null,\"AbstractTextCN\":null,\"PMCID\":null,\"EPubDate\":\"\",\"PubModel\":\"\",\"JCR\":\"\",\"JCRName\":\"\",\"Score\":null,\"Total\":0}","platform":"Semanticscholar","paperid":null,"PeriodicalName":"International Journal of Biological and Chemical Sciences","FirstCategoryId":"1085","ListUrlMain":"https://doi.org/10.4314/ijbcs.v17i6.7","RegionNum":0,"RegionCategory":null,"ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":null,"EPubDate":"","PubModel":"","JCR":"","JCRName":"","Score":null,"Total":0}
引用次数: 0

摘要

沙门氏菌是引起恩贾梅纳国家参考资料医院中心(CHU-RN)高度关注的多重耐药病原体之一。它们是食物中毒和伤寒的罪魁祸首。这项研究旨在更新乍得医院中沙门氏菌属的存在、多样性和抗生素耐药性方面的知识。2018 年 8 月至 2019 年 2 月期间,共收集了 341 份住院病人和门诊病人粪便标本。使用 Api 20E 图库对沙门氏菌菌株进行鉴定,并使用乍得的 VITEK® 2TM 15 紧凑型自动系统和法国巴斯德研究所的 XLT4 培养基进行确认。使用考夫曼-怀特试剂盒对分离菌株进行血清型鉴定。抗菌药物敏感性检测按照欧盟微生物检测和分析中心的指导原则进行。结果显示,42%的分离菌株具有广谱β-内酰胺酶(ESBL)耐药表型。约 2%(6/314)的样本对沙门氏菌呈阳性反应。在鉴定出的 6 个血清型中,最常见的是肠炎沙门氏菌(50%),其次是 Colindale 沙门氏菌(33.3%)和 grampian 沙门氏菌(16.7%)。100%的分离菌株(6 个)对至少一种抗菌药产生抗药性。最常见的抗药性是阿莫西林-克拉维酸、复方新诺明和四环素(100%)。此外,对头孢曲松(83.3%)和阿曲南(83.3%)的敏感性也有所下降。我们的研究结果表明,沙门氏菌污染有所增加,而且出现了对多种抗菌药具有耐药性的分离菌株。沙门氏菌是引起恩贾梅纳国家参考综合医院(HGRN)严重关切的病原体和多重耐药菌之一。它们是食物中毒和伤寒的罪魁祸首。本研究旨在更新有关乍得医院中沙门氏菌的存在、多样性和抗生素耐药性的知识。2018 年 8 月至 2019 年 2 月期间,共收集了 341 份来自住院病人和门诊病人的粪便标本。使用 Api 20E 图库对沙门氏菌菌株进行了鉴定,并由乍得的 VITEK® 2TM 15 紧凑型自动机和法国巴斯德研究所的 XLT4 培养基进行了确认。使用考夫曼-怀特试剂盒对分离株进行血清分型鉴定。抗菌药敏感性检测根据欧盟微生物检测和分析委员会(EUCAST)的指导方针进行。42%的分离菌株报告了广谱β-内酰胺酶(ESBL)耐药表型。约 2% 的样本(6/314)对沙门氏菌呈阳性反应。在鉴定出的 6 个血清型中,最常见的是肠炎沙门氏菌(50%),其次是科林代尔沙门氏菌(33.3%)和格拉比安沙门氏菌(16.7%)。100%的分离菌株(6 个)对至少一种抗菌药产生抗药性。最常见的抗药性是阿莫西林-克拉维酸、复方新诺明和四环素(100%)。此外,对头孢曲松(83.3%)和阿曲南(83.3%)的敏感性也有所下降。我们的研究结果表明,沙门氏菌污染有所增加,而且出现了对多种抗菌药具有耐药性的分离菌株。
本文章由计算机程序翻译,如有差异,请以英文原文为准。
Prévalence et caractérisation des sérotypes de Salmonella isolées au CHU la Référence Nationale de N’Djaména au Tchad
Les Salmonelles se retrouvent parmi les agents pathogènes multirésistants qui suscitent une grande inquiétude au Centre Hospitalier de Référence Nationale (CHU-RN) de N’Djamena. Ils sont responsables des toxi-infections alimentaires et de la fièvre typhoïde. Le but de cette étude était d’actualiser la connaissance sur la présence, la diversité et l’antibiorésistance de Salmonella spp dans le milieu hospitalier au Tchad. Au total, 341 spécimens de selles des patients hospitalisés et externes ont été collectés entre août 2018 et févier 2019. L’identification des souches de Salmonella a été réalisée à l’aide de la galérie Api 20E et confirmée par l’automate compact VITEK® 2TM 15 au Tchad et sur le milieu XLT4 de l’institut Pasteur en France. Les isolats ont été caractérisés à l'aide d’un sérotypage en utilisant le Kit de Kauffmann-White. Les tests de sensibilité aux antimicrobiens ont été réalisés selon les directives de EUCAST. Les résultats montrent que le phénotype de résistance aux bêta-lactamases à spectre étendu (BLSE) a été signalé dans 42% des isolats. Environ 2% (6/314) des échantillons étaient positifs pour Salmonella. Parmi les 6 sérovars identifiés, Salmonella enteritidis (50%) était le plus commun, suivi de S. colindale (33,3%) et S. grampian (16,7). 100% des isolats (6) étaient résistants à au moins un antimicrobien. La résistance a été le plus fréquemment observée à l'amoxicilline-acide clavulanique, Cotrimoxazole et à la Tétracycline (100%). De plus, une diminution de sensibilité au ceftriaxone (83,3%) et l’aztreoname (83,3%) a été observée. Nos résultats ont indiqué une augmentation de la contamination par Salmonella et l’apparition des isolats résistants à plusieurs antimicrobiens dans le CHU. Salmonella spp are among the pathogens and multi-resistant agents that are causing great concern at the National Reference General Hospital (HGRN) in N'djamena. They are responsible for food poisoning and typhoid fever. This study has aimed to update knowledge on the presence, diversity and antibiotic resistance of Salmonella spp in hospitals in Chad. A total of 341 stool specimens from inpatients and outpatients were collected between August 2018 and February 2019. The identification of Salmonella strains was carried out using the Api 20E gallery and confirmed by the VITEK® 2TM 15 compact automaton in Chad and on the XLT4 medium at the Pasteur Institute in France. Isolates were characterized by serotyping using the Kauffmann-White Kit. Antimicrobial susceptibility testing was performed according to EUCAST guidelines. Extended-spectrum beta-lactamase (ESBL) resistance phenotype was reported in 42% of isolates. About 2% (6/314) of the samples were positive for Salmonella. Among the 6 sérovars identified, Salmonella enteritidis (50%) was the most common, followed by S. colindale (33.3%) and S. grampian (16.7). 100% of isolates (6) were resistant to at least one antimicrobial. Resistance was most frequently observed to amoxicillin-clavulanic acid, Cotrimoxazole and Tetracycline (100%). Moreover, a decrease in sensitivity to ceftriaxone (83.3%) and aztreonam (83.3%) was observed. Our results indicated an increase in Salmonella contamination and the appearance of isolates resistant to several antimicrobials in the CHU.
求助全文
通过发布文献求助,成功后即可免费获取论文全文。 去求助
来源期刊
CiteScore
0.90
自引率
0.00%
发文量
0
×
引用
GB/T 7714-2015
复制
MLA
复制
APA
复制
导出至
BibTeX EndNote RefMan NoteFirst NoteExpress
×
提示
您的信息不完整,为了账户安全,请先补充。
现在去补充
×
提示
您因"违规操作"
具体请查看互助需知
我知道了
×
提示
确定
请完成安全验证×
copy
已复制链接
快去分享给好友吧!
我知道了
右上角分享
点击右上角分享
0
联系我们:info@booksci.cn Book学术提供免费学术资源搜索服务,方便国内外学者检索中英文文献。致力于提供最便捷和优质的服务体验。 Copyright © 2023 布克学术 All rights reserved.
京ICP备2023020795号-1
ghs 京公网安备 11010802042870号
Book学术文献互助
Book学术文献互助群
群 号:481959085
Book学术官方微信