通过PIWI/PIRNA相互作用对小家鼠细胞再生过程的硅分析

Isabele Pagani Pavan, Irís Moreira Da Siva, Matheus Correia Casotti, Luana Santos Louro, Thomas Erik Santos Louro, Elizeu Fagundes De Carvalho, Debora Dummer Meira, Iuri Drumond Louro
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摘要

细胞和组织再生在医学和生物学的各个领域都得到了广泛的研究,但其过程和功能仍存在差距。在过去的十年中,表观遗传学在这一功能中的作用得到了阐明,重点是非编码rna,其中PIWI相互作用rna (piRNAs),以前以其在生殖细胞中的作用和转座元件的控制而闻名。最近的研究表明,piRNA在体细胞组织(如神经细胞)中的功能,对小型啮齿动物,特别是小家鼠的研究表明,该通路的表达与再生过程的正确功能之间存在重要联系。再生医学是一个挑战与理解这些过程,通过研究鲁棒来描述和生物信息学工具,构建蛋白质相互作用网络(PPIN)来确定治疗目标蛋白质和基因功能的基础上通过PIWI / piRNA ssm笑。通过对这些网络的分析,我们能够识别哺乳动物再生过程中相关的蛋白质及其相互作用,有了这些结果,未来将有可能根据在硅中获得的数据开发体内试验,从而节省时间和财政投资。
本文章由计算机程序翻译,如有差异,请以英文原文为准。
ANÁLISE IN SILICO DO PROCESSO DE REGENERAÇÃO CELULAR ATRAVÉS DA INTERAÇÃO PIWI/PIRNA EM MUS MUSCULUS
A regeneração celular e tecidual, muito abordada em diversas áreas da medicina e da biologia, ainda permanece com lacunas sobre seus processos e funcionamento. Na última década, elucidou-se o papel da epigenética na referida função, dando-se ênfase para RNAs não codificantes, e entre eles, os piRNAs (PIWI-interacting RNAs), antes conhecidos por sua atuação em células germinativas e no controle de elementos transponíveis. Estudos recentes demonstraram funções dos piRNA em células de tecidos somáticos, como o nervoso, e pesquisas com pequenos roedores, especialmente em Mus musculus, apontaram uma importante ligação entre a expressão dessa via e o correto funcionamento do processo de regeneração. Por ser um desafio relevante para a medicina regenerativa entender esses processos, através de estudos robustos aqui descritos e utilizando ferramentas de Bioinformática, construiu-se redes de interação proteína-proteína (PPIN) para identificar proteínas-alvo para tratamentos terapêuticos com base no funcionamento da via do gene PIWI/piRNA em Mus musculus. A partir da análise dessas redes, conseguimos identificar proteínas relevantes, assim como suas interações, para o processo regenerativo em mamíferos e, com esses resultados, futuramente, poder-se-á desenvolver testes in vivo com base nos dados obtidos in silico, economizando, assim, tempo e investimentos financeiros.
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