V. H. D. Silva, Alice Loureiro Martins, Marina Luna de Souza Alves, Barbara de Miranda Rost, Michael dos Santos Brito
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Apesar de promotores constitutivos ja caracterizados funcionarem para alguns organismos vegetais, ate o momento ha deficiencia de fortes promotores constitutivos para a engenharia genetica de gramineas, sobretudo na cana-de-acucar (Saccharum officinarum), principal materia-prima utilizada para producao de etanol de primeira e segunda geracao no Brasil. Objetivo: O presente estudo visa avaliar e caracterizar in silico novos promotores constitutivos da cana, bem como seus homologos em Sorgo e Milho, para o desenvolvimento de novos vetores de transformacao eficientes para gramineas. Materiais e metodos: A partir de banco de dados genomicos e transcriptomicos, especificos para a Cana e outras especies correlatas, alem de ferramentas de bioinformatica pretende-se identificar os genes constitutivos e seus homologos, visualizar a sua expressao e encontrar possiveis candidatos para isolar seus promotores genicos e realizar as analises. Resultados parciais: Ate o momento, foi possivel realizar a identificacao de ao menos 10 genes constitutivos da cana-de-acucar e seus homologos em milho e sorgo. Atraves dos testes de expressao de Northern virtual no SuCEST e de forma complementar, em bancos especificos para seus homologos, os genes Fator de Elongacao 1 Delta 1, Proteina Homologa ao FT SUI1 e Arginina tRNA Ligase da cana-de-acucar demonstraram os melhores perfis de expressao. Concomitantemente a isso, iniciamos estudos na prospeccao de novos promotores viriais capazes de conduzir a expressao constitutiva em gramineas. 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PROSPECÇÃO E ANÁLISE IN SÍLICO DE NOVOS PROMOTORES CONSTITUTIVOS PARA CANA-DE-AÇÚCAR
A crescente demanda por novas fontes renovaveis de geracao de energia e o aumento da populacao mundial tornam a Biotecnologia Vegetal indispensavel para novas pesquisas visando o desenvolvimento de plantas geneticamente modificadas (OGMs). Para a obtencao desses OGMs, os promotores exercem importante funcao na regulacao e expressao dos genes. Dentre eles, os promotores constitutivos sao responsaveis pela regulacao de genes cuja expressao ocorre ininterrupta nos diferentes tecidos e estagios de desenvolvimento da planta, sendo estes na maioria das vezes envolvidos com o metabolismo basal da celula. Apesar de promotores constitutivos ja caracterizados funcionarem para alguns organismos vegetais, ate o momento ha deficiencia de fortes promotores constitutivos para a engenharia genetica de gramineas, sobretudo na cana-de-acucar (Saccharum officinarum), principal materia-prima utilizada para producao de etanol de primeira e segunda geracao no Brasil. Objetivo: O presente estudo visa avaliar e caracterizar in silico novos promotores constitutivos da cana, bem como seus homologos em Sorgo e Milho, para o desenvolvimento de novos vetores de transformacao eficientes para gramineas. Materiais e metodos: A partir de banco de dados genomicos e transcriptomicos, especificos para a Cana e outras especies correlatas, alem de ferramentas de bioinformatica pretende-se identificar os genes constitutivos e seus homologos, visualizar a sua expressao e encontrar possiveis candidatos para isolar seus promotores genicos e realizar as analises. Resultados parciais: Ate o momento, foi possivel realizar a identificacao de ao menos 10 genes constitutivos da cana-de-acucar e seus homologos em milho e sorgo. Atraves dos testes de expressao de Northern virtual no SuCEST e de forma complementar, em bancos especificos para seus homologos, os genes Fator de Elongacao 1 Delta 1, Proteina Homologa ao FT SUI1 e Arginina tRNA Ligase da cana-de-acucar demonstraram os melhores perfis de expressao. Concomitantemente a isso, iniciamos estudos na prospeccao de novos promotores viriais capazes de conduzir a expressao constitutiva em gramineas. A proxima etapa consiste em desenhar iniciadores especificos dos promotores endogenos, objetivando a clonagem fisica e posterior sequenciamento destes promotores.
O projeto e financiado pela FAPESP atraves do auxilio regular no 2019/12424-6 .