Eldevan da Silva Barbosa, Ana Gabrielly de Melo Matos, A. Marques, Eleilde Almeida Araújo, J. Pinho
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Materiais e Métodos: Os dados para este tipo de tumor são referentes a análise de array realizado por meio da plataforma Affymetrix. Para a identificação dos microRNAs em snoRNAs foi utilizado a plataforma miRBase, e a análise ontológica de genes alvos e vias envolvidas com os microRNAs foram preditos usando bases de dados do miRBase, e da plataforma DIANA Tools. Resultados: Com isso identificamos 5 microRNAs (hsa-miR- 664b-3p, hsa-miR-664b-5p, hsa-miR-6516-3p, hsa-miR-6516-5p, hsa-miR-3651), onde a análise in silico revelou que esses microRNAs regulam 141 genes, entre eles estão: FUT9, OXSM, GALNT7, EXT1, PDE10A, NOS1AP, PAX6, ERBB4, PLN. Estes genes regulam vias como: biossíntese de glicoesfingolipídios, biossíntese de mucina tipo O-glicano, vias de sinalização que regulam a pluripotência de células-tronco e glioma. 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摘要
简介:阴茎癌(CP)是一种罕见的癌症发病率高,特别是在巴西,巴西引发肿瘤的遗传机制还不清楚,snoRNAs的识别功能,有助于理解这个更全面,但最近的研究表明,癌症的snoRNAs不会功能—规范,如:调节染色质结构,作为miRNAs和piRNAs的前体,选择性剪接,氧化应激介质,以及其他未知的功能。目的:因此,本研究的目的是通过硅工具确定阴茎癌患者样本中表达的规范和非规范snoRNAs功能。材料和方法:这类肿瘤的数据参考了通过Affymetrix平台进行的阵列分析。利用miRBase平台鉴定snoRNAs中的microRNAs,利用miRBase数据库和DIANA工具平台预测靶基因和microRNAs相关途径的本体论分析。结果:我们鉴定了5个microRNAs (hsa- mir -664b- 3p, hsa- mir -664b-5p, hsa- mir -6516-3p, hsa- mir -6516-5p, hsa- mir -3651),硅分析显示这些microRNAs调控141个基因,其中包括FUT9, OXSM, GALNT7, EXT1, PDE10A, NOS1AP, PAX6, ERBB4, PLN。这些基因调节诸如糖脂生物合成、O-聚糖粘蛋白生物合成、调节干细胞和胶质瘤多能性的信号通路等途径。结论:我们可以得出结论,tumorigênese在CP的microRNAs有至关重要的作用,数据显示功能的多样性的microRNAs snoRNAs的关系,以及这些生物分子在通常desreguladas在癌症,这些生物分子的研究有助于阐明阴茎癌的致癌过程。
ANÁLISE IN SILICO DE MICRORNAS PRESENTES EM SNORNAS EM AMOSTRAS DE PACIENTES COM CÂNCER DE PÊNIS
Introdução: O câncer de pênis (CP) é uma neoplasia rara que apresenta elevada incidência no Brasil, em especial no Maranhão, e os mecanismos genéticos que desencadeiam este tumor ainda são escassos, a identificação das funções dos snoRNAs, poderá contribuir no entendimento deste câncer de forma mais abrangente, estudos recentes revelam que os snoRNAs teria funções não–canônicas, como: regular a estrutura da cromatina, ser precursor de miRNAs e piRNAs, splicing alternativo, mediadores de estresse oxidativo, além de outras funções desconhecidas. Objetivos: Portanto, o objetivo deste trabalho foi identificar, através de ferramentas in silico, as funções canônicas e não canônicas dos snoRNAs expressos em amostras de pacientes com câncer de pênis. Materiais e Métodos: Os dados para este tipo de tumor são referentes a análise de array realizado por meio da plataforma Affymetrix. Para a identificação dos microRNAs em snoRNAs foi utilizado a plataforma miRBase, e a análise ontológica de genes alvos e vias envolvidas com os microRNAs foram preditos usando bases de dados do miRBase, e da plataforma DIANA Tools. Resultados: Com isso identificamos 5 microRNAs (hsa-miR- 664b-3p, hsa-miR-664b-5p, hsa-miR-6516-3p, hsa-miR-6516-5p, hsa-miR-3651), onde a análise in silico revelou que esses microRNAs regulam 141 genes, entre eles estão: FUT9, OXSM, GALNT7, EXT1, PDE10A, NOS1AP, PAX6, ERBB4, PLN. Estes genes regulam vias como: biossíntese de glicoesfingolipídios, biossíntese de mucina tipo O-glicano, vias de sinalização que regulam a pluripotência de células-tronco e glioma. Conclusão: Podemos concluir que os microRNAs apresentam papel fundamental para a tumorigênese em CP, os dados demonstram a diversidade de funções dos microRNAs em snoRNAs, e a relação destas biomoléculas em vias que normalmente estão desreguladas em câncer, o estudo destas biomoléculas pode ajudar a elucidar o processo carcinogênico do câncer de pênis.