TGFBR1基因rs111426349多态性与多种癌症易感性的关系

Rubens Barbosa Rezende, Faculdade Santa Rita, L. Teodoro
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Os efeitos da alteração daR487W foram avaliados utilizando as ferramentas SIFT e PROVEAN para avaliação funcional e PolyPhen-2 para compreensão da natureza da alteração. Além disso, as alterações de estabilidade proteica foram avaliadas com a ferramenta MuPRO.A análise in silico, demonstrou alteração funcional (SIFT, Score=0). Bem como, estima-se que troca de aminoácidos pode estar associada a alterações danosas (PolyPhen2, Score=1.000) e relacionadas a função da proteína (PROVEAN, Score=-7.192). De forma complementar, observou-se diminuição da estabilidade proteica (MuPRO, ∆∆G=-0.85). O câncer é uma doença ocasionada por uma complexa interação entre fatores genéticos e ambientais. Fatores genéticos incluem mudanças de sequência e mutações na organização do genoma da célula que podem aumentara susceptibilidade a doença. Sabe-se que avia de sinalização do TGF-βé importante na regulação de diversos processos biológicos, nos quais inclui a diferenciação, proliferação celular, migração e apoptose. As mutações na via de sinalização de TGF-β são constantemente identificadas em várias enfermidades, incluindo câncer de cólon, de mama, próstata ou de pâncreas. O TGFBR1é considerado o comunicador central da via de transdução de sinal do TGF-β,portanto as alterações morfofuncionais observadas decorrentes do rs111426349podem estar associadas a processos danosos e a diminuição da estabilidade proteica podendo comprometer a atuação correta na via de sinalização. A literatura reporta aumento de susceptibilidade a diversos tipos de câncer na presença do polimorfismo, o que ressalta a importância das análises morfofuncionais para compreensão do mecanismo fisiopatológico.Dessa forma, a análise das alterações morfofuncionais e de estabilidade podem contribuir na busca por marcadores moleculares e genéticos de diagnóstico precoce, uma vez que os polimorfismos do gene TGFBR1 estão associados à suscetibilidade ao câncer, e mais pesquisas funcionais devem ser executadas para elucidar a função do gene no desenvolvimento de diversos tipos de câncer.","PeriodicalId":137157,"journal":{"name":"Revista Uningá","volume":"1 1","pages":"0"},"PeriodicalIF":0.0000,"publicationDate":"2021-01-22","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":"0","resultStr":"{\"title\":\"ASSOCIAÇÃO DO POLIMORFISMO rs111426349 DO GENE TGFBR1 À SUSCEPTIBILIDADE A DIVERSOS TIPOS DE CÂNCER\",\"authors\":\"Rubens Barbosa Rezende, Faculdade Santa Rita, L. 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摘要

转化生长因子受体1 (TGFBR1)是一种由多种细胞类型产生的同源二聚体细胞外蛋白,参与细胞外基质的形成,在细胞迁移、增殖和分化中发挥重要作用。rs111426349多态性对应于C> a / C> G / C> T的交换,促进氨基酸从精氨酸到色氨酸在487位置的改变。因此,本研究旨在评估氨基酸变化可能导致的形态功能和蛋白质稳定性的变化,以及与蛋白质生理功能的相关性。根据NCBI dbSNP(氨基酸和位置变化)和uniprot(蛋白质序列)数据库中的信息进行硅分析。使用SIFT和PROVEAN工具评估daR487W改变的效果,并使用PolyPhen-2工具了解改变的性质。此外,用MuPRO工具评估蛋白质稳定性的变化。硅分析显示功能改变(SIFT,评分=0)。此外,据估计,氨基酸交换可能与有害变化(PolyPhen2, Score=1.000)和蛋白质功能相关(PROVEAN, Score=-7.192)有关。此外,蛋白质稳定性降低(MuPRO,∆∆G=-0.85)。癌症是一种由遗传和环境因素复杂相互作用引起的疾病。遗传因素包括细胞基因组组织的序列变化和突变,这可能会增加对疾病的易感性。众所周知,TGF-β信号通路在多种生物过程的调控中具有重要作用,包括细胞分化、增殖、迁移和凋亡。TGF-β信号通路的突变在各种疾病中不断被发现,包括结肠癌、乳腺癌、前列腺癌或胰腺癌。tgfbr1被认为是TGF-β信号转导通路的中心通讯因子,因此rs111426349引起的形态功能改变可能与损伤过程有关,蛋白质稳定性降低可能会影响信号通路的正确表现。文献报道在多态性存在的情况下,对几种癌症的易感性增加,这强调了形态功能分析对理解病理生理机制的重要性。morfofuncionais变化方式的分析,可以帮助稳定在寻找早期诊断的分子标记和基因,基因的多态性TGFBR1易感性相关的癌症,必须实现功能和更多的研究来阐明基因的功能在开发不同类型的癌症。
本文章由计算机程序翻译,如有差异,请以英文原文为准。
ASSOCIAÇÃO DO POLIMORFISMO rs111426349 DO GENE TGFBR1 À SUSCEPTIBILIDADE A DIVERSOS TIPOS DE CÂNCER
O receptor 1 do fator transformador de crescimento beta (TGFBR1) é uma proteína extracelular homodimérica produzida por diversos tipos celulares, participa da formação da matriz extracelular e possui papel importante na mobilidade, proliferação e diferenciação celular. O polimorfismo rs111426349 corresponde a uma troca C> A / C> G / C> T promovendo a alteração de aminoácidos de uma Arginina por um Triptofano na posição 487.Para isso, objetivou-se avaliar as possíveis alterações morfofuncionais e de estabilidade proteica decorrentes da alteração de aminoácidos, bem como, correlacionar com a função fisiológica da proteína. Realizou-se a análise in silico com base nas informações disponíveis nos bancos de dados NCBI dbSNP (alteração de aminoácidos e posição) eUNIPROT (sequência proteica). Os efeitos da alteração daR487W foram avaliados utilizando as ferramentas SIFT e PROVEAN para avaliação funcional e PolyPhen-2 para compreensão da natureza da alteração. Além disso, as alterações de estabilidade proteica foram avaliadas com a ferramenta MuPRO.A análise in silico, demonstrou alteração funcional (SIFT, Score=0). Bem como, estima-se que troca de aminoácidos pode estar associada a alterações danosas (PolyPhen2, Score=1.000) e relacionadas a função da proteína (PROVEAN, Score=-7.192). De forma complementar, observou-se diminuição da estabilidade proteica (MuPRO, ∆∆G=-0.85). O câncer é uma doença ocasionada por uma complexa interação entre fatores genéticos e ambientais. Fatores genéticos incluem mudanças de sequência e mutações na organização do genoma da célula que podem aumentara susceptibilidade a doença. Sabe-se que avia de sinalização do TGF-βé importante na regulação de diversos processos biológicos, nos quais inclui a diferenciação, proliferação celular, migração e apoptose. As mutações na via de sinalização de TGF-β são constantemente identificadas em várias enfermidades, incluindo câncer de cólon, de mama, próstata ou de pâncreas. O TGFBR1é considerado o comunicador central da via de transdução de sinal do TGF-β,portanto as alterações morfofuncionais observadas decorrentes do rs111426349podem estar associadas a processos danosos e a diminuição da estabilidade proteica podendo comprometer a atuação correta na via de sinalização. A literatura reporta aumento de susceptibilidade a diversos tipos de câncer na presença do polimorfismo, o que ressalta a importância das análises morfofuncionais para compreensão do mecanismo fisiopatológico.Dessa forma, a análise das alterações morfofuncionais e de estabilidade podem contribuir na busca por marcadores moleculares e genéticos de diagnóstico precoce, uma vez que os polimorfismos do gene TGFBR1 estão associados à suscetibilidade ao câncer, e mais pesquisas funcionais devem ser executadas para elucidar a função do gene no desenvolvimento de diversos tipos de câncer.
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