神经炎症与帕金森病:本体数据库分析

Vinicius Oliveira Lord, T. Kowalski, Giovanna Câmara Giudicelli
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Foi realizada uma pesquisa dos principais genes ligados à DP na ferramenta Human Phenotype Ontolgy (HPO) e buscas por genes relacionados à neuroinflamação no banco de dados AmiGO2. Estes dados foram comparados através de um Diagrama de Venn. Informações relacionadas às funções dos genes avaliados foram obtidas no banco de dados GeneCards. Foram encontrados 119 genes relacionados à DP no HPO e 158 genes relacionados à neuroinflamação no AmiGO2. Seis genes eram comuns entre DP e neuroinflamação: TREM2, GRN, SNCA, PSEN1, MAPT e APP; todos eles já foram associados a outros tipos de demência não relacionados à DP. Foi visto que estes genes estão relacionados a proteínas que formam placas e emaranhados em doenças neurodegenerativas, como a alfa sinucleína na DP e as proteínas Tau e beta amiloide na doença de Alzheimer, sugerindo que estes genes podem estar diretamente associados à patogênese destas doenças. 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摘要

帕金森氏病(pd)是一种进行性神经退行性疾病,可导致痴呆。它是一种使运动协调能力衰弱的疾病,导致三种运动症状:运动迟缓、僵硬和静息性震颤。在大多数患者中,该病的病因尚不清楚,已知存在年龄、男性和环境因素等危险因素。神经炎症存在于帕金森病的病理生理学中。研究已经发现小胶质细胞和浸润淋巴细胞在死后大脑中,以及血液中促炎细胞因子浓度的增加。本研究的目的是将帕金森病和神经炎症中已经列出的基因联系起来,以确定哪些基因与两者相关。在人类本体表型(HPO)工具中搜索与帕金森病相关的主要基因,并在AmiGO2数据库中搜索与神经炎症相关的基因。这些数据通过维恩图进行比较。从基因卡数据库中获得了与基因功能相关的信息。在HPO中发现119个与pd相关的基因,在AmiGO2中发现158个与神经炎症相关的基因。pd与神经炎症共6个基因:TREM2、GRN、SNCA、PSEN1、MAPT和APP;所有这些都与其他与帕金森病无关的痴呆症有关。研究发现,这些基因与神经退行性疾病中的斑块和缠结蛋白有关,如帕金森病中的α突触核蛋白和阿尔茨海默病中的Tau蛋白和β淀粉样蛋白,表明这些基因可能与这些疾病的发病机制直接相关。这项工作是一项探索性分析,以确定哪些基因在帕金森病和神经炎症之间是共同的,因为神经炎症过程似乎是理解神经退行性疾病进展的基础。从这个角度来看,将对帕金森病患者和健康人的转录组进行meta分析,以确定这些基因在疾病的哪个阶段以及在哪些组织中发生了改变。
本文章由计算机程序翻译,如有差异,请以英文原文为准。
NEUROINFLAMAÇÃO E DOENÇA DE PARKINSON: ANÁLISE A PARTIR DE BANCO DE DADOS DE ONTOLOGIAS
A doença de Parkinson (DP) é um distúrbio neurodegenerativo progressivo que pode levar a demência. É uma doença debilitante da coordenação motora, causando uma tríade de sintomas motores: bradicinesia, rigidez e tremor de repouso. Em grande parte dos pacientes a etiologia desta doença ainda é desconhecida, e sabe-se que existem fatores de risco que incluem idade, sexo masculino e fatores ambientais. A neuroinflamação está presente na fisiopatologia do Parkinson. Estudos já localizaram células microgliais e linfócitos infiltrantes em cérebros post-mortem, além de aumento de concentração de citocinas pró-inflamatórias no sangue. O objetivo deste trabalho foi relacionar genes já listados na DP e na neuroinflamação, a fim de verificar quais genes estão associados em ambas. Foi realizada uma pesquisa dos principais genes ligados à DP na ferramenta Human Phenotype Ontolgy (HPO) e buscas por genes relacionados à neuroinflamação no banco de dados AmiGO2. Estes dados foram comparados através de um Diagrama de Venn. Informações relacionadas às funções dos genes avaliados foram obtidas no banco de dados GeneCards. Foram encontrados 119 genes relacionados à DP no HPO e 158 genes relacionados à neuroinflamação no AmiGO2. Seis genes eram comuns entre DP e neuroinflamação: TREM2, GRN, SNCA, PSEN1, MAPT e APP; todos eles já foram associados a outros tipos de demência não relacionados à DP. Foi visto que estes genes estão relacionados a proteínas que formam placas e emaranhados em doenças neurodegenerativas, como a alfa sinucleína na DP e as proteínas Tau e beta amiloide na doença de Alzheimer, sugerindo que estes genes podem estar diretamente associados à patogênese destas doenças. Este trabalho é uma análise exploratória a fim de verificar quais genes são comuns entre DP e neuroinflamação, uma vez que o processo neuroinflamatório parece ser fundamental para o entendimento da progressão das doenças neurodegenerativas. Como perspectiva, será realizada uma metanálise de transcriptomas de pessoas acometidas por DP e pessoas saudáveis, a fim de verificar em qual fase da doença e também em quais tecidos estes genes estão alterados.
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