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La conception et l'integration de systemes complexes est un enjeu crucial dans le domaine de la recherche et du developpement en environnement industriel. Les logiques qui font aujourd'hui references en conception ne s’interessent que partiellement a l'innovation et a l'interaction du systeme avec son utilisateur. Cet article propose une methode pour la conception de systemes innovants. Dans une premiere partie, il montre sur quels modeles repose la conception de systemes, ainsi que les limites des demarches actuelles. Les fondements systemiques de la methode proposee sont decrits, et explicites dans la troisieme partie. Cette demarche d'essence socio-systemique s’appuie sur les notions d'interaction et d'emergence.