准一维分子链中电荷转移模型在混合超级计算机上部分自动化计算的实现

M. I. Pyatkov, A. Zaytsev, M. Olshevets, N. S. Fialko
{"title":"准一维分子链中电荷转移模型在混合超级计算机上部分自动化计算的实现","authors":"M. I. Pyatkov, A. Zaytsev, M. Olshevets, N. S. Fialko","doi":"10.17537/ICMBB18.66","DOIUrl":null,"url":null,"abstract":"Точность средних зависит от числа реализаций K как K . Для решения таких задач за разумные времена требуются гибридные супер-ЭВМ. При проведении расчетов на кластере в суперкомпьютерном центре коллективного пользования появляются технические проблемы, связанные с политикой администрирования кластера, которые требуют постоянного внимания исследователя. В работе описана частичная автоматизация расчетов на гибридных супер-ЭВМ. Показана эффективность разработанных процедур при моделировании переноса заряда в биополимерах в широком диапазоне температур термостата. Разработанный комплекс программ применяется для серийных расчетов при исследованиях переноса заряда в ДНК на гибридных вычислительных комплексах K-60 и K-100 в ИПМ им. М.В. Келдыша РАН.","PeriodicalId":168323,"journal":{"name":"Proceedings of the International Conference \"Mathematical Biology and Bioinformatics\"","volume":"31 1","pages":"0"},"PeriodicalIF":0.0000,"publicationDate":"2018-11-07","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":"0","resultStr":"{\"title\":\"Implementation of partially automated calculations on hybrid supercomputers in the modelling of charge transfer in quasi-one-dimensional molecular chains\",\"authors\":\"M. I. Pyatkov, A. Zaytsev, M. Olshevets, N. S. Fialko\",\"doi\":\"10.17537/ICMBB18.66\",\"DOIUrl\":null,\"url\":null,\"abstract\":\"Точность средних зависит от числа реализаций K как K . Для решения таких задач за разумные времена требуются гибридные супер-ЭВМ. При проведении расчетов на кластере в суперкомпьютерном центре коллективного пользования появляются технические проблемы, связанные с политикой администрирования кластера, которые требуют постоянного внимания исследователя. В работе описана частичная автоматизация расчетов на гибридных супер-ЭВМ. Показана эффективность разработанных процедур при моделировании переноса заряда в биополимерах в широком диапазоне температур термостата. Разработанный комплекс программ применяется для серийных расчетов при исследованиях переноса заряда в ДНК на гибридных вычислительных комплексах K-60 и K-100 в ИПМ им. М.В. Келдыша РАН.\",\"PeriodicalId\":168323,\"journal\":{\"name\":\"Proceedings of the International Conference \\\"Mathematical Biology and Bioinformatics\\\"\",\"volume\":\"31 1\",\"pages\":\"0\"},\"PeriodicalIF\":0.0000,\"publicationDate\":\"2018-11-07\",\"publicationTypes\":\"Journal Article\",\"fieldsOfStudy\":null,\"isOpenAccess\":false,\"openAccessPdf\":\"\",\"citationCount\":\"0\",\"resultStr\":null,\"platform\":\"Semanticscholar\",\"paperid\":null,\"PeriodicalName\":\"Proceedings of the International Conference \\\"Mathematical Biology and Bioinformatics\\\"\",\"FirstCategoryId\":\"1085\",\"ListUrlMain\":\"https://doi.org/10.17537/ICMBB18.66\",\"RegionNum\":0,\"RegionCategory\":null,\"ArticlePicture\":[],\"TitleCN\":null,\"AbstractTextCN\":null,\"PMCID\":null,\"EPubDate\":\"\",\"PubModel\":\"\",\"JCR\":\"\",\"JCRName\":\"\",\"Score\":null,\"Total\":0}","platform":"Semanticscholar","paperid":null,"PeriodicalName":"Proceedings of the International Conference \"Mathematical Biology and Bioinformatics\"","FirstCategoryId":"1085","ListUrlMain":"https://doi.org/10.17537/ICMBB18.66","RegionNum":0,"RegionCategory":null,"ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":null,"EPubDate":"","PubModel":"","JCR":"","JCRName":"","Score":null,"Total":0}
引用次数: 0

摘要

平均精度取决于K作为K的实现数量。在合理的情况下,需要混合动力超级计算机来解决这些问题。在超级计算机集体使用中心的集群上进行计算时,出现了与集群管理政策相关的技术问题,需要研究人员的持续关注。本文描述了混合超级计算机计算的部分自动化。在生物聚合物中模拟电荷在恒温器温度范围内转移的过程是有效的。该复杂的程序被应用于对将电荷转移到K-60和K-100混合计算复合体dna中的序列号。他的名字叫mv。
本文章由计算机程序翻译,如有差异,请以英文原文为准。
Implementation of partially automated calculations on hybrid supercomputers in the modelling of charge transfer in quasi-one-dimensional molecular chains
Точность средних зависит от числа реализаций K как K . Для решения таких задач за разумные времена требуются гибридные супер-ЭВМ. При проведении расчетов на кластере в суперкомпьютерном центре коллективного пользования появляются технические проблемы, связанные с политикой администрирования кластера, которые требуют постоянного внимания исследователя. В работе описана частичная автоматизация расчетов на гибридных супер-ЭВМ. Показана эффективность разработанных процедур при моделировании переноса заряда в биополимерах в широком диапазоне температур термостата. Разработанный комплекс программ применяется для серийных расчетов при исследованиях переноса заряда в ДНК на гибридных вычислительных комплексах K-60 и K-100 в ИПМ им. М.В. Келдыша РАН.
求助全文
通过发布文献求助,成功后即可免费获取论文全文。 去求助
来源期刊
自引率
0.00%
发文量
0
×
引用
GB/T 7714-2015
复制
MLA
复制
APA
复制
导出至
BibTeX EndNote RefMan NoteFirst NoteExpress
×
提示
您的信息不完整,为了账户安全,请先补充。
现在去补充
×
提示
您因"违规操作"
具体请查看互助需知
我知道了
×
提示
确定
请完成安全验证×
copy
已复制链接
快去分享给好友吧!
我知道了
右上角分享
点击右上角分享
0
联系我们:info@booksci.cn Book学术提供免费学术资源搜索服务,方便国内外学者检索中英文文献。致力于提供最便捷和优质的服务体验。 Copyright © 2023 布克学术 All rights reserved.
京ICP备2023020795号-1
ghs 京公网安备 11010802042870号
Book学术文献互助
Book学术文献互助群
群 号:481959085
Book学术官方微信