Dian Nurlaily, Farida Nur Hayati, Elly Pusporani
{"title":"Membandingkan Seleksi variabel Pada Data Microarray Menggunakan Important Variable Value dan Genetic Algorithm (Studi Kasus Lung Cancer Dataset dan Prostate Cancer Dataset)","authors":"Dian Nurlaily, Farida Nur Hayati, Elly Pusporani","doi":"10.36456/jstat.vol14.no1.a3853","DOIUrl":null,"url":null,"abstract":"Teknologi DNA microarray menarik minat yang luar biasa baik di kalangan komunitas ilmiah maupun kalangan industri. Meskipun data microarray telah diterapkan dalam berbagai bidang, penanganan volume data besar yang dihasilkan bukanlah perkara yang mudah. Ukuran sampel kecil dengan dimensi tinggi adalah tantangan utama analisis menggunakan data microarray. Oleh karena itu perlu dilakukan analisis lebih lanjut untuk mengatasi hal ini. Banyak penelitian yang telah dirancang berkaitan dengan data microarray misalnya untuk menyelidiki mekanisme genetik kanker, dan untuk mengklasifikasikan berbagai jenis kanker atau membedakan antara jaringan kanker dan non-kanker. Semua penelitian ini bertujuan untuk menghasilkan kesimpulan dan interpretasi yang bermanfaat dari kumpulan data yang kompleks. Dalam penelitian ini, data yang digunakan adalah data kanker paru-paru sebanyak 24257 Variabel dan data kanker prostat sebanyak 12626 Variabel. Data tersebut kemudian akan dianalisis dengan beberapa metode feature selection yaitu important variable value dan genetic algorithm untuk memilih dimensi atau variabel data sehingga dapat meningkatkan akurasi klasifikasi data. Berdasarkan hasil analisis feature selection menggunakan data kanker paru-paru, didapatkan jumlah variabel terpilih sebanyak 112 variabel dengan metode feature selection important. Sedangkan metode genetic algorithm didapatkan jumlah variabel terpilihnya sebanyak 12266 variabel. Pada data kanker prostat, didapatkan jumlah variabel terpilih sebanyak 299 variabel dengan metode feature selection important. Sedangkan metode genetic algorithm didapatkan jumlah variabel terpilihnya sebanyak 6359 variabel. \n ","PeriodicalId":118320,"journal":{"name":"J Statistika: Jurnal Ilmiah Teori dan Aplikasi Statistika","volume":"53 1","pages":"0"},"PeriodicalIF":0.0000,"publicationDate":"2021-07-31","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":"0","resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":null,"PeriodicalName":"J Statistika: Jurnal Ilmiah Teori dan Aplikasi Statistika","FirstCategoryId":"1085","ListUrlMain":"https://doi.org/10.36456/jstat.vol14.no1.a3853","RegionNum":0,"RegionCategory":null,"ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":null,"EPubDate":"","PubModel":"","JCR":"","JCRName":"","Score":null,"Total":0}
引用次数: 0

摘要

微阵列DNA技术在科学界和业界都引起了极大的兴趣。虽然微数组数据已经应用于许多领域,但对由此产生的大量数据进行处理并非易事。尺寸高的小样本大小是使用微阵列数据分析的主要挑战。因此,需要进行进一步的分析来解决这个问题。许多研究都是基于微型阵列数据进行的,以研究癌症的遗传机制,并对不同类型的癌症进行分类,或者区分癌症和非癌症组织。所有这些研究都是为了从复杂的数据集中得出有用的结论和解释。在这项研究中,使用的数据包括24257个变量肺癌和12626个变量前列腺癌。然后将用几种方法来分析这些数据,即重要的变量值值和遗传算法,以选择数据的维度或变量,从而提高数据分类的准确性。根据用肺癌数据进行的物化筛选分析,通过选择性采样重要获得了112个变量的选择数。而遗传算法得到的变量是12266。在前列腺癌数据中,通过选择性选择方法实现的变量为299个。而遗传算法得到的变量数量为6359。
本文章由计算机程序翻译,如有差异,请以英文原文为准。
Membandingkan Seleksi variabel Pada Data Microarray Menggunakan Important Variable Value dan Genetic Algorithm (Studi Kasus Lung Cancer Dataset dan Prostate Cancer Dataset)
Teknologi DNA microarray menarik minat yang luar biasa baik di kalangan komunitas ilmiah maupun kalangan industri. Meskipun data microarray telah diterapkan dalam berbagai bidang, penanganan volume data besar yang dihasilkan bukanlah perkara yang mudah. Ukuran sampel kecil dengan dimensi tinggi adalah tantangan utama analisis menggunakan data microarray. Oleh karena itu perlu dilakukan analisis lebih lanjut untuk mengatasi hal ini. Banyak penelitian yang telah dirancang berkaitan dengan data microarray misalnya untuk menyelidiki mekanisme genetik kanker, dan untuk mengklasifikasikan berbagai jenis kanker atau membedakan antara jaringan kanker dan non-kanker. Semua penelitian ini bertujuan untuk menghasilkan kesimpulan dan interpretasi yang bermanfaat dari kumpulan data yang kompleks. Dalam penelitian ini, data yang digunakan adalah data kanker paru-paru sebanyak 24257 Variabel dan data kanker prostat sebanyak 12626 Variabel. Data tersebut kemudian akan dianalisis dengan beberapa metode feature selection yaitu important variable value dan genetic algorithm untuk memilih dimensi atau variabel data sehingga dapat meningkatkan akurasi klasifikasi data. Berdasarkan hasil analisis feature selection menggunakan data kanker paru-paru, didapatkan jumlah variabel terpilih sebanyak 112 variabel dengan metode feature selection important. Sedangkan metode genetic algorithm didapatkan jumlah variabel terpilihnya sebanyak 12266 variabel. Pada data kanker prostat, didapatkan jumlah variabel terpilih sebanyak 299 variabel dengan metode feature selection important. Sedangkan metode genetic algorithm didapatkan jumlah variabel terpilihnya sebanyak 6359 variabel.  
求助全文
通过发布文献求助,成功后即可免费获取论文全文。 去求助
来源期刊
自引率
0.00%
发文量
0
×
引用
GB/T 7714-2015
复制
MLA
复制
APA
复制
导出至
BibTeX EndNote RefMan NoteFirst NoteExpress
×
提示
您的信息不完整,为了账户安全,请先补充。
现在去补充
×
提示
您因"违规操作"
具体请查看互助需知
我知道了
×
提示
确定
请完成安全验证×
copy
已复制链接
快去分享给好友吧!
我知道了
右上角分享
点击右上角分享
0
联系我们:info@booksci.cn Book学术提供免费学术资源搜索服务,方便国内外学者检索中英文文献。致力于提供最便捷和优质的服务体验。 Copyright © 2023 布克学术 All rights reserved.
京ICP备2023020795号-1
ghs 京公网安备 11010802042870号
Book学术文献互助
Book学术文献互助群
群 号:481959085
Book学术官方微信