用于处理、聚类和可视化科学工作流基因图的Web应用程序

Alexandre Heine, E. P. Santos, M. Lima, Sérgio Lifschitz
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摘要

这项工作提出了一个web应用程序来支持来自差异表达基因(DEGs)的科学工作流程的数据,包括RNA测序分析。因此,我们寻求提供处理这些数据的方法,允许通过基因相互作用数据形成基因图,以及使用从存储在字符串文件中的数据中获得的信息创建子图和代表性集群。这些文件在应用程序中执行新请求时进行处理,然后存储在关系数据库中,使研究人员能够可视化和处理他们研究的基因图。
本文章由计算机程序翻译,如有差异,请以英文原文为准。
Aplicação Web de Processamento, Clustering e Visualização de Grafos de Genes de Workflows Científicos
Este trabalho propõe uma aplicação web de apoio a dados provenientes de workflows científicos de genes diferencialmente expressos (DEGs) que envolvem análises de sequenciamento de RNA. Assim, procura-se contribuir com formas de manuseio desses dados, permitindo a formação de um grafo de genes, por meio de dados de interação de genes, assim como a criação de subgrafos e clusters representativos, utilizando-se de informações obtidas de dados armazenados em arquivos de string. Esses arquivos são processados conforme são realizados novos pedidos na aplicação e, então, armazenados em um banco de dados relacional, possibilitando a pesquisadores visualizarem e manusearem grafos de genes para seus estudos.
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