基于小局部分布式存储并行结构的大规模Fock矩阵生成算法。与积分截止的关系。

Hajime Takashima
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摘要

在分布式存储器型并行计算机上的大规模分子轨道计算中,积分截止的问题对缩短计算时间带来了显著的效果,积分截止的阈值对计算结果的影响,以及积分截止在大规模分子中的比例对其进行了调查。在大规模分子中,通过只用2个标记进行的剪切,存活下来的基数的比例在10%以下,几乎是固定值,由此,积分数实际上减少为基数N的平方。因此,当在主机和各处理器之间进行矩阵传输时,对于减轻通信量和存储量,必须对与积分截止对应的传输矩阵进行截止。
本文章由计算机程序翻译,如有差异,请以英文原文为准。
A Novel Algorithm for Large-Scale Fock Matrix Generation with Small Local Distributed Memory Parallel Architecture. Relation to the Integral Cutoff.
分散メモリ型並列計算機上での大規模分子軌道計算で、計算時間短縮に大きな効果をもたらす積分カットオフの問題に注目し、積分カットオフの閾値が計算結果に与える影響や、大規模分子における積分カットオフの割合について調べた。大規模分子では、2つの添字だけで行なうカットオフによって生き残る基底数の割合が10%以下となりほぼ一定値になること、これにより、積分数は事実上基底数 N の二乗に減少することが判明した。よって、ホストと各プロセッサの間で行列転送を行なう際には積分カットオフに対応した転送行列のカットオフを行なう事が通信量やメモリ量の軽減に必須であることが分かった。
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