非确定性自动机网络动力学的静态分析

Loïc Paulevé, Maxime Folschette, M. Magnin, O. Roux
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摘要

本文综合了最近的结果,允许对自动机网络的动力学进行大规模分析。我们关注两种类型的属性:可访问性——给定网络的全局状态,对于给定的自动机,是否有一系列的转换允许到达给定的局部状态;以及基于自动机网络拓扑及其局部转换的固定点特征。为了便于访问,我们给出了适用于任何自动机网络的必要条件和异步自动机网络的充分条件。我们还讨论了可访问性切割集的计算,这是一组局部状态的自动机,如果它们是不活动的,将使所研究的可访问性不可能。这些动力学分析利用了不确定性自动机网络中的竞争,并基于抽象,对所有可能的行为给出了紧凑的、非冗余的、近似的表示。这些方法使分析含有成百上千种成分的生物网络的动力学成为可能。
本文章由计算机程序翻译,如有差异,请以英文原文为准。
Analyses statiques de la dynamique des réseaux d'automates indéterministes
Cet article presente une synthese de resultats recents permettant l'analyse a grande echelle de la dynamique des reseaux d'automates. Nous nous focalisons sur deux types de proprietes : l'accessibilite -- etant donne un etat global du reseau, existe-t-il une suite de transitions permettant d'atteindre un etat local donne pour un automate donne ; et la caracterisation des points fixes a partir de la topologie du reseau d'automates et de ses transitions locales. Pour l'accessibilite, nous donnons des conditions necessaires applicables a tout reseaux d'automates et des conditions suffisantes pour les reseaux d'automates asynchrones. Nous abordons egalement le calcul d'ensembles de coupes pour l'accessibilite, qui sont des ensembles d'etats locaux d'automates qui, si ils sont desactives, rendent impossible l'accessibilite etudiee. Ces analyses de la dynamique exploitent la concurrence au sein des reseaux d'automates indeterministes et reposent sur des abstractions donnant une representation compacte, non redondante, mais approchee, de l'ensemble des comportements possibles. Ces methodes ont rendu possible l'analyse de la dynamique de reseaux biologiques avec des centaines et des milliers de composants.
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