DNA在乙二醇低聚物和聚合物影响下的结构转化

V. Barkhudaryan
{"title":"DNA在乙二醇低聚物和聚合物影响下的结构转化","authors":"V. Barkhudaryan","doi":"10.54503/0366-5119-2023.75.1-56","DOIUrl":null,"url":null,"abstract":"In this work, the effect of ethylene glycol oligomers and polymers of various molecular masses on the structural transformations of deoxyribonucleic acid (DNA) is studied exclusively by viscometry. The main goal of this study was to understand how polyethylene glycol (PEG) interacts, which binds to calf thymus DNA (ctDNA). This paper presents the results of these studies. It has been found that ethylene glycols with molecular masses of 600 and 1000, apparently due to their smallness, do not have a noticeable effect on the sizes of DNA macromolecules in the studied concentration ranges. For ethylene glycols with molecular masses of 6000 and 7000, a clearly expressed complex course of the dependence of the intrinsic viscosity of DNA solutions on the polymer content was established. A decrease in the viscosity of solutions was observed, which was interpreted as a result of a decrease in the size of DNA macromolecules. It was assumed that with a change in the concentration of ethylene glycols in the system, an increase in the density of DNA macromolecules occurs due to a change in the balance of hydrophobic-hydrophilic interactions. The results of the study in the presence of 20 000 molecular masses of PEG in a DNA solution practically exclude the presence of interaction between DNA and PEG molecules at such molecular masses.\nԱյս աշխատանքում բացառապես մածուցիկության մեթոդով ուսումնասիրվել է էթի-լենգլիկոլի օլիգոմերների և տարբեր մոլեկուլային զանգվածներով պոլիմերների ազդեցությունը դեզօքսիռիբոնուկլեինաթթվի (ԴՆԹ) կառուցվածքային փոխակերպումների վրա։ Հետազոտության հիմնական նպատակն էր հասկանալ, թե ինչպես է փոխազդում պոլիէթիլենգլիկոլը (ՊէԳ), որը կապվում է հորթի նշագեղձի ԴՆԹ-ին (հնԴՆԹ): Ներկա հոդվածը ներկայացնում է այդ ուսումնասիրությունների արդյունքները: Պարզվել է, որ 600 և 1000 մոլեկուլային զանգվածներով էթիլենգլիկոլները, ըստ երևույթին, իրենց փոքրության պատճառով, նկատելի ազդեցություն չունեն ԴՆԹ-ի մակրոմոլեկուլների չափերի վրա ուսումնասիրված կոնցենտրացիաների միջակայքում: 6000 և 7000 մոլեկուլային զանգվածներով էթիլենգլիկոլների համար հստակ արտահայտված բարդ ընթացք է հաստատվել ԴՆԹ-ի պոլիմերների պարունակությունից լուծույթների ներքին մածուցիկության կախվածության համար: Նկատվել է լուծույթների մածուցիկության նվազում, որը մեկնաբանվել է որպես ԴՆԹ մակրոմոլեկուլների չափերի նվազման արդյունք։ Ենթադրվում է, որ համակարգում էթիլենգլիկոլների կոնցենտրացիայի փոփոխության ընթացքում ԴՆԹ-ի մակրոմոլեկուլների խտության աճ է տեղի ունենում հիդրոֆոբ-հիդրոֆիլ փոխազդեցությունների հավասարակշռության փոփոխության պատճառով: Հետազոտության արդյունքները ԴՆԹ լուծույթում ՊԷԳ-ի 20000 մոլեկուլային զանգվածով նմուշների առկայության պայմաններում գործնականում բացառվում է փոխազդեցության առկայությունը ԴՆԹ-ի և ՊԷԳ-ի մոլեկուլների միջև նման մոլեկուլային զանգվածների դեպքում:\nВ данной работе исключительно методом вискозиметрии изучено влияние олигомеров и полимеров этиленгликоля различной молекулярной массы на структурные превращения дезоксирибонуклеиновой кислоты (ДНК). Основная цель этого исследования состояла в том, чтобы понять, как взаимодействует полиэтиленгликоль (ПЭГ), который связывается с ДНК тимуса теленка (цтДНК). В данной работе представлены результаты этих исследований. Установлено, что этиленгликоли с молекулярными массами 600 и 1000, по-видимому, в силу своей малости, не оказывают заметного влияния на размеры макромолекул ДНК в исследованных диапазонах концентраций. Для этиленгликолей с молекулярными массами 6000 и 7000 установлен четко выраженный сложный ход зависимости характеристической вязкости растворов ДНК от содержания полимера. Наблюдалось снижение вязкости растворов, что интерпретировалось как результат уменьшения размеров макромолекул ДНК. Предполагалось, что при изменении концентрации этиленгликолей в системе происходит увеличение плотности макромолекул ДНК за счет изменения баланса гидро-фобно-гидрофильных взаимодействий. Результаты исследования в присутствии 20 000 молекулярных масс ПЭГ в растворе ДНК практически исключают наличие взаимодействия молекул ДНК и ПЭГ при таких молекулярных массах.","PeriodicalId":395281,"journal":{"name":"Biological Journal of Armenia","volume":"63 1","pages":"0"},"PeriodicalIF":0.0000,"publicationDate":"2023-04-11","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":"0","resultStr":"{\"title\":\"Structural transformations of DNA under the influence of oligomers and polymers of ethylene glycols\",\"authors\":\"V. Barkhudaryan\",\"doi\":\"10.54503/0366-5119-2023.75.1-56\",\"DOIUrl\":null,\"url\":null,\"abstract\":\"In this work, the effect of ethylene glycol oligomers and polymers of various molecular masses on the structural transformations of deoxyribonucleic acid (DNA) is studied exclusively by viscometry. The main goal of this study was to understand how polyethylene glycol (PEG) interacts, which binds to calf thymus DNA (ctDNA). This paper presents the results of these studies. It has been found that ethylene glycols with molecular masses of 600 and 1000, apparently due to their smallness, do not have a noticeable effect on the sizes of DNA macromolecules in the studied concentration ranges. For ethylene glycols with molecular masses of 6000 and 7000, a clearly expressed complex course of the dependence of the intrinsic viscosity of DNA solutions on the polymer content was established. A decrease in the viscosity of solutions was observed, which was interpreted as a result of a decrease in the size of DNA macromolecules. It was assumed that with a change in the concentration of ethylene glycols in the system, an increase in the density of DNA macromolecules occurs due to a change in the balance of hydrophobic-hydrophilic interactions. The results of the study in the presence of 20 000 molecular masses of PEG in a DNA solution practically exclude the presence of interaction between DNA and PEG molecules at such molecular masses.\\nԱյս աշխատանքում բացառապես մածուցիկության մեթոդով ուսումնասիրվել է էթի-լենգլիկոլի օլիգոմերների և տարբեր մոլեկուլային զանգվածներով պոլիմերների ազդեցությունը դեզօքսիռիբոնուկլեինաթթվի (ԴՆԹ) կառուցվածքային փոխակերպումների վրա։ Հետազոտության հիմնական նպատակն էր հասկանալ, թե ինչպես է փոխազդում պոլիէթիլենգլիկոլը (ՊէԳ), որը կապվում է հորթի նշագեղձի ԴՆԹ-ին (հնԴՆԹ): Ներկա հոդվածը ներկայացնում է այդ ուսումնասիրությունների արդյունքները: Պարզվել է, որ 600 և 1000 մոլեկուլային զանգվածներով էթիլենգլիկոլները, ըստ երևույթին, իրենց փոքրության պատճառով, նկատելի ազդեցություն չունեն ԴՆԹ-ի մակրոմոլեկուլների չափերի վրա ուսումնասիրված կոնցենտրացիաների միջակայքում: 6000 և 7000 մոլեկուլային զանգվածներով էթիլենգլիկոլների համար հստակ արտահայտված բարդ ընթացք է հաստատվել ԴՆԹ-ի պոլիմերների պարունակությունից լուծույթների ներքին մածուցիկության կախվածության համար: Նկատվել է լուծույթների մածուցիկության նվազում, որը մեկնաբանվել է որպես ԴՆԹ մակրոմոլեկուլների չափերի նվազման արդյունք։ Ենթադրվում է, որ համակարգում էթիլենգլիկոլների կոնցենտրացիայի փոփոխության ընթացքում ԴՆԹ-ի մակրոմոլեկուլների խտության աճ է տեղի ունենում հիդրոֆոբ-հիդրոֆիլ փոխազդեցությունների հավասարակշռության փոփոխության պատճառով: Հետազոտության արդյունքները ԴՆԹ լուծույթում ՊԷԳ-ի 20000 մոլեկուլային զանգվածով նմուշների առկայության պայմաններում գործնականում բացառվում է փոխազդեցության առկայությունը ԴՆԹ-ի և ՊԷԳ-ի մոլեկուլների միջև նման մոլեկուլային զանգվածների դեպքում:\\nВ данной работе исключительно методом вискозиметрии изучено влияние олигомеров и полимеров этиленгликоля различной молекулярной массы на структурные превращения дезоксирибонуклеиновой кислоты (ДНК). Основная цель этого исследования состояла в том, чтобы понять, как взаимодействует полиэтиленгликоль (ПЭГ), который связывается с ДНК тимуса теленка (цтДНК). В данной работе представлены результаты этих исследований. Установлено, что этиленгликоли с молекулярными массами 600 и 1000, по-видимому, в силу своей малости, не оказывают заметного влияния на размеры макромолекул ДНК в исследованных диапазонах концентраций. Для этиленгликолей с молекулярными массами 6000 и 7000 установлен четко выраженный сложный ход зависимости характеристической вязкости растворов ДНК от содержания полимера. Наблюдалось снижение вязкости растворов, что интерпретировалось как результат уменьшения размеров макромолекул ДНК. Предполагалось, что при изменении концентрации этиленгликолей в системе происходит увеличение плотности макромолекул ДНК за счет изменения баланса гидро-фобно-гидрофильных взаимодействий. Результаты исследования в присутствии 20 000 молекулярных масс ПЭГ в растворе ДНК практически исключают наличие взаимодействия молекул ДНК и ПЭГ при таких молекулярных массах.\",\"PeriodicalId\":395281,\"journal\":{\"name\":\"Biological Journal of Armenia\",\"volume\":\"63 1\",\"pages\":\"0\"},\"PeriodicalIF\":0.0000,\"publicationDate\":\"2023-04-11\",\"publicationTypes\":\"Journal Article\",\"fieldsOfStudy\":null,\"isOpenAccess\":false,\"openAccessPdf\":\"\",\"citationCount\":\"0\",\"resultStr\":null,\"platform\":\"Semanticscholar\",\"paperid\":null,\"PeriodicalName\":\"Biological Journal of Armenia\",\"FirstCategoryId\":\"1085\",\"ListUrlMain\":\"https://doi.org/10.54503/0366-5119-2023.75.1-56\",\"RegionNum\":0,\"RegionCategory\":null,\"ArticlePicture\":[],\"TitleCN\":null,\"AbstractTextCN\":null,\"PMCID\":null,\"EPubDate\":\"\",\"PubModel\":\"\",\"JCR\":\"\",\"JCRName\":\"\",\"Score\":null,\"Total\":0}","platform":"Semanticscholar","paperid":null,"PeriodicalName":"Biological Journal of Armenia","FirstCategoryId":"1085","ListUrlMain":"https://doi.org/10.54503/0366-5119-2023.75.1-56","RegionNum":0,"RegionCategory":null,"ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":null,"EPubDate":"","PubModel":"","JCR":"","JCRName":"","Score":null,"Total":0}
引用次数: 0

摘要

在这项工作中,乙二醇低聚物和不同分子质量的聚合物对脱氧核糖核酸(DNA)结构转化的影响是专门用粘度法研究的。本研究的主要目的是了解聚乙二醇(PEG)如何与小牛胸腺DNA (ctDNA)相互作用。本文介绍了这些研究的结果。研究发现,分子量为600和1000的乙二醇,显然是由于其体积小,在研究浓度范围内对DNA大分子的大小没有明显的影响。对于分子质量为6000和7000的乙二醇,建立了DNA溶液特性粘度随聚合物含量变化的复杂过程。观察到溶液粘度的降低,这被解释为DNA大分子大小减小的结果。假设随着系统中乙二醇浓度的变化,由于疏水-亲水相互作用平衡的变化,DNA大分子的密度增加。在DNA溶液中存在20,000分子质量的PEG时的研究结果实际上排除了在这种分子质量下DNA和PEG分子之间相互作用的存在。Այսաշխատանքումբացառապեսմածուցիկությանմեթոդովուսումնասիրվելէէթի——լենգլիկոլիօլիգոմերներիևտարբերմոլեկուլայինզանգվածներովպոլիմերներիազդեցությունըդեզօքսիռիբոնուկլեինաթթվի(ԴՆԹ)կառուցվածքայինփոխակերպումներիվրա։Հետազոտությանհիմնականնպատակնէրհասկանալ,թեինչպեսէփոխազդումպոլիէթիլենգլիկոլը(ՊէԳ),որըկապվումէհորթինշագեղձիԴՆԹ——ին(հնԴՆԹ):Ներկահոդվածըներկայացնումէայդուսումնասիրություններիարդյունքները:Պարզվելէ,որ600և1000մոլեկուլայինզանգվածներովէթիլենգլիկոլները,ըստերևույթին,իրենցփոքրությանպատճառով,նկատելիազդեցությունչունենԴՆԹ——իմակրոմոլեկուլներիչափերիվրաուսումնասիրվածկոնցենտրացիաներիմիջակայքում:6000և7000մոլեկուլայինզանգվածներովէթիլենգլիկոլներիհամարհստակարտահայտվածբարդընթացքէհաստատվելԴՆԹ——իպոլիմերներիպարունակությունիցլուծույթներիներքինմածուցիկությանկախվածությանհամար:Նկատվելէլուծույթներիմածուցիկությաննվազում,որըմեկնաբանվելէորպեսԴՆԹմակրոմոլեկուլներիչափերինվազմանարդյունք։Ենթադրվումէ,որհամակարգումէթիլենգլիկոլներիկոնցենտրացիայիփոփոխությանընթացքումԴՆԹ——իմակրոմոլեկուլներիխտությանաճէտեղիունենումհիդրոֆոբ——հիդրոֆիլփոխազդեցություններիհավասարակշռությանփոփոխությանպատճառով:ՀետազոտությանարդյունքներըԴՆԹլուծույթումՊԷԳ-ի20000մոլեկուլայինզանգվածովնմուշներիառկայությանպայմաններումգործնականումբացառվումէփոխազդեցությանառկայությունըԴՆԹ——իևՊԷԳ——իմոլեկուլներիմիջևնմանմոլեկուլայինզանգվածներիդեպքում:Вданнойработеисключительнометодомвискозиметрииизученовлияниеолигомеровиполимеровэтиленгликоляразличноймолекулярноймассынаструктурныепревращениядезоксирибонуклеиновойкислоты(ДНК)。Основнаяцельэтогоисследованиясостоялавтом,чтобыпонять,каквзаимодействуетполиэтиленгликоль(ПЭГ),которыйсвязываетсясДНКтимусателенка(цтДНК)。Вданнойработепредставленырезультатыэтихисследований。Установлено,чтоэтиленгликолисмолекулярнымимассами600и1000пов——идимому,всилусвоеймалости,неоказываютзаметноговлияниянаразмерымакромолекулДНКвисследованныхдиапазонахконцентраций。Дляэтиленгликолейсмолекулярнымимассами6000 7000уистановленчетковыраженныйсложныйходзависимостихарактеристическойвязкостирастворовДНКотсодержанияполимера。Наблюдалосьснижениевязкостирастворов,чтоинтерпретировалоськакрезультатуменьшенияразмеровмакромолекулДНК。Предполагалось,чтоприизмененииконцентрацииэтиленгликолейвсистемепроисходитувеличениеплотностимакромолекулДНКзасчетизменениябалансагидро-фобног,идрофильныхвзаимодействий。Результатыисследованиявприсутстви20 000имолекулярныхмассПЭГвраствореДНКпрактическиисключаютналичиевзаимодействиямолекулДНКиПЭГпритакихмолекулярныхмассах。
本文章由计算机程序翻译,如有差异,请以英文原文为准。
Structural transformations of DNA under the influence of oligomers and polymers of ethylene glycols
In this work, the effect of ethylene glycol oligomers and polymers of various molecular masses on the structural transformations of deoxyribonucleic acid (DNA) is studied exclusively by viscometry. The main goal of this study was to understand how polyethylene glycol (PEG) interacts, which binds to calf thymus DNA (ctDNA). This paper presents the results of these studies. It has been found that ethylene glycols with molecular masses of 600 and 1000, apparently due to their smallness, do not have a noticeable effect on the sizes of DNA macromolecules in the studied concentration ranges. For ethylene glycols with molecular masses of 6000 and 7000, a clearly expressed complex course of the dependence of the intrinsic viscosity of DNA solutions on the polymer content was established. A decrease in the viscosity of solutions was observed, which was interpreted as a result of a decrease in the size of DNA macromolecules. It was assumed that with a change in the concentration of ethylene glycols in the system, an increase in the density of DNA macromolecules occurs due to a change in the balance of hydrophobic-hydrophilic interactions. The results of the study in the presence of 20 000 molecular masses of PEG in a DNA solution practically exclude the presence of interaction between DNA and PEG molecules at such molecular masses. Այս աշխատանքում բացառապես մածուցիկության մեթոդով ուսումնասիրվել է էթի-լենգլիկոլի օլիգոմերների և տարբեր մոլեկուլային զանգվածներով պոլիմերների ազդեցությունը դեզօքսիռիբոնուկլեինաթթվի (ԴՆԹ) կառուցվածքային փոխակերպումների վրա։ Հետազոտության հիմնական նպատակն էր հասկանալ, թե ինչպես է փոխազդում պոլիէթիլենգլիկոլը (ՊէԳ), որը կապվում է հորթի նշագեղձի ԴՆԹ-ին (հնԴՆԹ): Ներկա հոդվածը ներկայացնում է այդ ուսումնասիրությունների արդյունքները: Պարզվել է, որ 600 և 1000 մոլեկուլային զանգվածներով էթիլենգլիկոլները, ըստ երևույթին, իրենց փոքրության պատճառով, նկատելի ազդեցություն չունեն ԴՆԹ-ի մակրոմոլեկուլների չափերի վրա ուսումնասիրված կոնցենտրացիաների միջակայքում: 6000 և 7000 մոլեկուլային զանգվածներով էթիլենգլիկոլների համար հստակ արտահայտված բարդ ընթացք է հաստատվել ԴՆԹ-ի պոլիմերների պարունակությունից լուծույթների ներքին մածուցիկության կախվածության համար: Նկատվել է լուծույթների մածուցիկության նվազում, որը մեկնաբանվել է որպես ԴՆԹ մակրոմոլեկուլների չափերի նվազման արդյունք։ Ենթադրվում է, որ համակարգում էթիլենգլիկոլների կոնցենտրացիայի փոփոխության ընթացքում ԴՆԹ-ի մակրոմոլեկուլների խտության աճ է տեղի ունենում հիդրոֆոբ-հիդրոֆիլ փոխազդեցությունների հավասարակշռության փոփոխության պատճառով: Հետազոտության արդյունքները ԴՆԹ լուծույթում ՊԷԳ-ի 20000 մոլեկուլային զանգվածով նմուշների առկայության պայմաններում գործնականում բացառվում է փոխազդեցության առկայությունը ԴՆԹ-ի և ՊԷԳ-ի մոլեկուլների միջև նման մոլեկուլային զանգվածների դեպքում: В данной работе исключительно методом вискозиметрии изучено влияние олигомеров и полимеров этиленгликоля различной молекулярной массы на структурные превращения дезоксирибонуклеиновой кислоты (ДНК). Основная цель этого исследования состояла в том, чтобы понять, как взаимодействует полиэтиленгликоль (ПЭГ), который связывается с ДНК тимуса теленка (цтДНК). В данной работе представлены результаты этих исследований. Установлено, что этиленгликоли с молекулярными массами 600 и 1000, по-видимому, в силу своей малости, не оказывают заметного влияния на размеры макромолекул ДНК в исследованных диапазонах концентраций. Для этиленгликолей с молекулярными массами 6000 и 7000 установлен четко выраженный сложный ход зависимости характеристической вязкости растворов ДНК от содержания полимера. Наблюдалось снижение вязкости растворов, что интерпретировалось как результат уменьшения размеров макромолекул ДНК. Предполагалось, что при изменении концентрации этиленгликолей в системе происходит увеличение плотности макромолекул ДНК за счет изменения баланса гидро-фобно-гидрофильных взаимодействий. Результаты исследования в присутствии 20 000 молекулярных масс ПЭГ в растворе ДНК практически исключают наличие взаимодействия молекул ДНК и ПЭГ при таких молекулярных массах.
求助全文
通过发布文献求助,成功后即可免费获取论文全文。 去求助
来源期刊
自引率
0.00%
发文量
0
×
引用
GB/T 7714-2015
复制
MLA
复制
APA
复制
导出至
BibTeX EndNote RefMan NoteFirst NoteExpress
×
提示
您的信息不完整,为了账户安全,请先补充。
现在去补充
×
提示
您因"违规操作"
具体请查看互助需知
我知道了
×
提示
确定
请完成安全验证×
copy
已复制链接
快去分享给好友吧!
我知道了
右上角分享
点击右上角分享
0
联系我们:info@booksci.cn Book学术提供免费学术资源搜索服务,方便国内外学者检索中英文文献。致力于提供最便捷和优质的服务体验。 Copyright © 2023 布克学术 All rights reserved.
京ICP备2023020795号-1
ghs 京公网安备 11010802042870号
Book学术文献互助
Book学术文献互助群
群 号:604180095
Book学术官方微信