SAGA COMPLEX ESSENTIAL FOR THE REGULATION OF GENES INVOLVED IN TREHALOSE METABOLISM

IF 0.5 Q4 MULTIDISCIPLINARY SCIENCES
Tulay Turgut Genc
{"title":"SAGA COMPLEX ESSENTIAL FOR THE REGULATION OF GENES INVOLVED IN TREHALOSE METABOLISM","authors":"Tulay Turgut Genc","doi":"10.23902/trkjnat.1131400","DOIUrl":null,"url":null,"abstract":"Saccharomyces cerevisiae maya hücreleri, olumsuz çevre koşullarında stres metaboliti olarak trehaloz biriktirir. Hücre içi trehaloz miktarının düzenlenmesinde trehalozun sentezi ve yıkımı önemlidir. Bu nedenle, TPS1 ve NTH1 gen ekspresyonları transkripsiyon ve translasyon sırasında sıkı bir şekilde düzenlenmektedir. Her iki genin promotor bölgesinde Stres Tepki Elementleri bulunduğundan stres koşullarında birlikte aktive olurlar. Ancak her iki genin promotor bölgesinde benzer düzenleyici elemanların bulunması bu genlerin transkripsiyon seviyesinde farklı bir regülasyona uğradıklarını göstermektedir. Çalışmamızda, besin açlığında TPS1 ve NTH1 genlerinin transkripsiyonel düzenlenmesinde SAGA kompleksinin rolü analiz edildi. Ayrıca yaban tip ve mutant maya hücrelerinde trehaloz seviyesi enzimatik olarak tespit edildi. TPS1 ve NTH1 genlerinin in silico promotor analizi sonucunda Msn2/4 transkripsiyon faktörlerinin bağlanması için gerekli olan STRE dizilerinin NTH1 promotorunda nükleozomlar tarafından kapatıldığı TPS1 promotorunda ise açıkta kaldıkları belirlendi. Ada1 proteininin yokluğunda, TPS1 geninde stres kaynaklı promotor aktivasyonu gözlenirken, NTH1 geninde promotor aktivasyonu gözlenmedi. Bu sonuçlara göre, Ada1 proteininin yokluğunda STRE dizilerini kaplayan nükleozomlar mobilize edilemediğinden Msn2/4 transkripsiyon faktörleri stres koşullarında promotora bağlanamayarak transkripsiyonu aktive edememiş olabilir. Ayrıca stres koşullarından bağımsız olarak, Ada1 proteininin yokluğunda maya hücrelerindeki trehaloz birikiminin azaldığı gözlendi.","PeriodicalId":23163,"journal":{"name":"Trakya University Journal of Natural Sciences","volume":null,"pages":null},"PeriodicalIF":0.5000,"publicationDate":"2022-09-05","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":"0","resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":null,"PeriodicalName":"Trakya University Journal of Natural Sciences","FirstCategoryId":"1085","ListUrlMain":"https://doi.org/10.23902/trkjnat.1131400","RegionNum":0,"RegionCategory":null,"ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":null,"EPubDate":"","PubModel":"","JCR":"Q4","JCRName":"MULTIDISCIPLINARY SCIENCES","Score":null,"Total":0}
引用次数: 0

Abstract

Saccharomyces cerevisiae maya hücreleri, olumsuz çevre koşullarında stres metaboliti olarak trehaloz biriktirir. Hücre içi trehaloz miktarının düzenlenmesinde trehalozun sentezi ve yıkımı önemlidir. Bu nedenle, TPS1 ve NTH1 gen ekspresyonları transkripsiyon ve translasyon sırasında sıkı bir şekilde düzenlenmektedir. Her iki genin promotor bölgesinde Stres Tepki Elementleri bulunduğundan stres koşullarında birlikte aktive olurlar. Ancak her iki genin promotor bölgesinde benzer düzenleyici elemanların bulunması bu genlerin transkripsiyon seviyesinde farklı bir regülasyona uğradıklarını göstermektedir. Çalışmamızda, besin açlığında TPS1 ve NTH1 genlerinin transkripsiyonel düzenlenmesinde SAGA kompleksinin rolü analiz edildi. Ayrıca yaban tip ve mutant maya hücrelerinde trehaloz seviyesi enzimatik olarak tespit edildi. TPS1 ve NTH1 genlerinin in silico promotor analizi sonucunda Msn2/4 transkripsiyon faktörlerinin bağlanması için gerekli olan STRE dizilerinin NTH1 promotorunda nükleozomlar tarafından kapatıldığı TPS1 promotorunda ise açıkta kaldıkları belirlendi. Ada1 proteininin yokluğunda, TPS1 geninde stres kaynaklı promotor aktivasyonu gözlenirken, NTH1 geninde promotor aktivasyonu gözlenmedi. Bu sonuçlara göre, Ada1 proteininin yokluğunda STRE dizilerini kaplayan nükleozomlar mobilize edilemediğinden Msn2/4 transkripsiyon faktörleri stres koşullarında promotora bağlanamayarak transkripsiyonu aktive edememiş olabilir. Ayrıca stres koşullarından bağımsız olarak, Ada1 proteininin yokluğunda maya hücrelerindeki trehaloz birikiminin azaldığı gözlendi.
海藻糖代谢相关基因调控所必需的Saga复合体
本文章由计算机程序翻译,如有差异,请以英文原文为准。
求助全文
约1分钟内获得全文 求助全文
来源期刊
Trakya University Journal of Natural Sciences
Trakya University Journal of Natural Sciences MULTIDISCIPLINARY SCIENCES-
自引率
0.00%
发文量
24
×
引用
GB/T 7714-2015
复制
MLA
复制
APA
复制
导出至
BibTeX EndNote RefMan NoteFirst NoteExpress
×
提示
您的信息不完整,为了账户安全,请先补充。
现在去补充
×
提示
您因"违规操作"
具体请查看互助需知
我知道了
×
提示
确定
请完成安全验证×
copy
已复制链接
快去分享给好友吧!
我知道了
右上角分享
点击右上角分享
0
联系我们:info@booksci.cn Book学术提供免费学术资源搜索服务,方便国内外学者检索中英文文献。致力于提供最便捷和优质的服务体验。 Copyright © 2023 布克学术 All rights reserved.
京ICP备2023020795号-1
ghs 京公网安备 11010802042870号
Book学术文献互助
Book学术文献互助群
群 号:481959085
Book学术官方微信