شناسایی سرولوژیکی و مولکولی ویروس زردی شلغم در مزارع کلزای استان کرمانشاه

Journal of Plant Protection Pub Date : 2021-08-23 DOI:10.22059/IJPPS.2020.311331.1006954

راحله امینی, هادی خاطری, ناهید معرف زاده

{"title":"شناسایی سرولوژیکی و مولکولی ویروس زردی شلغم در مزارع کلزای استان کرمانشاه","authors":"راحله امینی, هادی خاطری, ناهید معرف زاده","doi":"10.22059/IJPPS.2020.311331.1006954","DOIUrl":null,"url":null,"abstract":"اعضای جنس پولروویروس ازجمله ویروس زردی شلغم (Turnip yellows virus, TuYV) از ویروس‌های مهم در گیاهان زراعی هستند. این ویروس‌ها توسط شته‌ها به‌صورت گردشی- غیرتکثیری انتقال پیدا می‌کنند. طی سال‌های ۱۳۹۷ و ۱۳۹۸ تعداد 32 نمونه‌ی برگ کلزا و یک نمونه خردل وحشی از مزارع استان کرمانشاه جمع‌آوری شد. این نمونه‌ها با کیت تاس-الیزا DSMZ که چهار گونۀ پولروویروس شامل TuYV، Beet mild yellowing virus (BMYV)، Beet western yellows virus (BWYV) و Beet chlorosis virus (BChV) را شناسایی می‌کند، آزمایش شدند. در آزمون تاس-الیزا، هفت نمونه کلزا و نمونه خردل وحشی پاسخ مثبت نشان دادند. برای آزمون انتقال ویروس از Myzus persicae و ‌Brevicoryne brassicae استفاده شد که در گیاهان کلزا و تربچه موفقیت‌آمیز بود ولی آلودگی به چغندرقند منتقل نگردید. در IC-RT-PCR با آغازگرهای اختصاصی، یک قطعه با اندازه ۷۸۰ جفت‌باز از ژن کد کننده P0 از نمونه خردل وحشی و دو نمونه کلزا تکثیر گردید. توالی‌های نوکلئوتیدی جدایه‌های کلزا و خردل وحشی بسیار مشابه بودند (۹۹٫۴ درصد همسانی) و در جستجوی BLAST با توالی‌های نوکلئوتیدی جدایه‌های TuYV، که بسیاری از آن‌ها از استرالیا و از گیاهان مختلف مانند شنبلیله، کلزا، نخودفرنگی و نخود بودند، تا ۹۷٫۲ درصد شباهت داشتند. در تحلیل فیلوژنتیک توالی‌های نوکلئوتیدی ناحیه کدکننده P0، این دو جدایه به همراه سایر جدایه‌های TuYV در یک گروه قرار گرفته و از سایر پولروویروس‌ها مانند BMYV، BWYV و BChV متمایز بودند. در این پژوهش، شناسایی ویروس زردی شلغم در مزارع کلزای ایران بر اساس تعیین توالی نوکلئوتیدی ناحیه کدکننده P0 برای اولین بار در شهرستان کرمانشاه انجام گرفت.","PeriodicalId":16965,"journal":{"name":"Journal of Plant Protection","volume":"49 1","pages":"25-36"},"PeriodicalIF":0.0000,"publicationDate":"2021-08-23","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":"0","resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":null,"PeriodicalName":"Journal of Plant Protection","FirstCategoryId":"1091","ListUrlMain":"https://doi.org/10.22059/IJPPS.2020.311331.1006954","RegionNum":0,"RegionCategory":null,"ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":null,"EPubDate":"","PubModel":"","JCR":"","JCRName":"","Score":null,"Total":0}

引用次数: 0

Abstract

اعضای جنس پولروویروس ازجمله ویروس زردی شلغم (Turnip yellows virus, TuYV) از ویروس‌های مهم در گیاهان زراعی هستند. این ویروس‌ها توسط شته‌ها به‌صورت گردشی- غیرتکثیری انتقال پیدا می‌کنند. طی سال‌های ۱۳۹۷ و ۱۳۹۸ تعداد 32 نمونه‌ی برگ کلزا و یک نمونه خردل وحشی از مزارع استان کرمانشاه جمع‌آوری شد. این نمونه‌ها با کیت تاس-الیزا DSMZ که چهار گونۀ پولروویروس شامل TuYV، Beet mild yellowing virus (BMYV)، Beet western yellows virus (BWYV) و Beet chlorosis virus (BChV) را شناسایی می‌کند، آزمایش شدند. در آزمون تاس-الیزا، هفت نمونه کلزا و نمونه خردل وحشی پاسخ مثبت نشان دادند. برای آزمون انتقال ویروس از Myzus persicae و ‌Brevicoryne brassicae استفاده شد که در گیاهان کلزا و تربچه موفقیت‌آمیز بود ولی آلودگی به چغندرقند منتقل نگردید. در IC-RT-PCR با آغازگرهای اختصاصی، یک قطعه با اندازه ۷۸۰ جفت‌باز از ژن کد کننده P0 از نمونه خردل وحشی و دو نمونه کلزا تکثیر گردید. توالی‌های نوکلئوتیدی جدایه‌های کلزا و خردل وحشی بسیار مشابه بودند (۹۹٫۴ درصد همسانی) و در جستجوی BLAST با توالی‌های نوکلئوتیدی جدایه‌های TuYV، که بسیاری از آن‌ها از استرالیا و از گیاهان مختلف مانند شنبلیله، کلزا، نخودفرنگی و نخود بودند، تا ۹۷٫۲ درصد شباهت داشتند. در تحلیل فیلوژنتیک توالی‌های نوکلئوتیدی ناحیه کدکننده P0، این دو جدایه به همراه سایر جدایه‌های TuYV در یک گروه قرار گرفته و از سایر پولروویروس‌ها مانند BMYV، BWYV و BChV متمایز بودند. در این پژوهش، شناسایی ویروس زردی شلغم در مزارع کلزای ایران بر اساس تعیین توالی نوکلئوتیدی ناحیه کدکننده P0 برای اولین بار در شهرستان کرمانشاه انجام گرفت.

查看原文本刊更多论文

求助全文

约1分钟内获得全文求助全文

来源期刊

Journal of Plant Protection

自引率

0.00%

发文量