Ülkemiz Turnip Mosaic Virus Bamya İzolatının Tüm Genom Analizi

Abstract

Turnip mosaic virus (TuMV) dunyada konukcusu oldugu bitkilerin yetistirildigi bolgelerde ekonomik duzeyde zarara neden olmaktadir. Dunyada son yillarda yapilan bir calismada virusun Brassicaceae familyasindaki bitkilerin disinda bamyayi da enfekte ettigi belirlenmistir. Bu calisma kapsaminda bamyayi enfekte eden bir TuMV izolatinin tum genom dizi analizi yapilmistir. Genom dizilimi belirlenen bamya TuMV izolatinin dunya izolatlari ile karsilastirilmasi sonucunda nukleotit duzeyinde %77-93, amino asit duzeyinde ise %89-97 oraninda benzerliklere sahip oldugu bulunmustur. Filogenetik analizler sonucunda ise bamya TuMV izolatinin basal-B filogenetik grubunda yer aldigi gorulmustur. Bu calisma ile ulkemizde ilk defa bamyayi enfekte eden bir TuMV izolatinin genom duzeyinde molekuler karaktezasyonu gerceklestirilmistir.