MOLACULAR DOCKING SENYAWA XANTHORRHIZOL DARI CURCUMA XANTHORRIZA SEBAGAI ANTI INFLAMASI DAN TES ADME PREDICTIONS

Jurnal Penelitian Kesehatan Suara Forikes Pub Date : 2022-08-29 DOI:10.56836/journaliskb.v8i2.64

Nurul Afriani Arif, Rezki, Irwandi Rahmat

{"title":"MOLACULAR DOCKING SENYAWA XANTHORRHIZOL DARI CURCUMA XANTHORRIZA SEBAGAI ANTI INFLAMASI DAN TES ADME PREDICTIONS","authors":"Nurul Afriani Arif, Rezki, Irwandi Rahmat","doi":"10.56836/journaliskb.v8i2.64","DOIUrl":null,"url":null,"abstract":"Abstract. Enzymes that influence the inflammatory process are cyclooxygenase enzymes that function in forming a prostaglandin to form inflammation. The xanthorrhizol compound has anti-inflammatory effect, so the xanthorrhizol docking research was carried out on the cycloocxigenase enzyme to determine the interaction of xanthorrhizol compounds derived from ginger rhizome (Curcuma xanthorriza). The analysis of these compounds used bioinformatics with several software namely PyMOL v.7.4.5, PyRx 0.8, and Avogadro. This software helps to visualize the compound and see the potential inhibitor of the compound against the cyclooxygenase enzyme. The docking of the xanthorrhizol ligand obtained the -7.4 binding affinity which showed it could interact with the active site of the cyclooxygenase enzyme target protein.. \nAbstrak. Enzim yang berpengaruh dalam proses inflamasi yaitu enzim cyclooxygenase yang berfungsi dalam membentuk sebua prostaglandin untuk membenntuk inflamasi. Senyawa xanthorrhizol mempunyai efek antiinflamasi, sehingga dilakukan penelitian docking xanthorrhizol terhadap enzim cycloocxigenase untuk mengetahui interaksi senyawa xanthorrhizol yang berasal dari tanaman temulawak (Curcuma xanthorriza) analisis senyawa tersebut menggunakan bioinformatika dengan beberapa soft ware yaitu PyMOL v.7.4.5, PyRx 0.8, dan Avogadro. Softwere ini membantu untuk memvisualisasi senyawa dan melihat potensi inhibitor senyawa terhadap enzim cyclooxigenase. Hasil docking dari ligan xanthorrhizol memproleh binding affinity -7,4 yang menunjukkan dapat berinteraksi dengan sisi aktif protein target enzim ciclooxigenase","PeriodicalId":31281,"journal":{"name":"Jurnal Penelitian Kesehatan Suara Forikes","volume":null,"pages":null},"PeriodicalIF":0.0000,"publicationDate":"2022-08-29","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":"0","resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":null,"PeriodicalName":"Jurnal Penelitian Kesehatan Suara Forikes","FirstCategoryId":"1085","ListUrlMain":"https://doi.org/10.56836/journaliskb.v8i2.64","RegionNum":0,"RegionCategory":null,"ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":null,"EPubDate":"","PubModel":"","JCR":"","JCRName":"","Score":null,"Total":0}

引用次数: 0

Abstract

Abstract. Enzymes that influence the inflammatory process are cyclooxygenase enzymes that function in forming a prostaglandin to form inflammation. The xanthorrhizol compound has anti-inflammatory effect, so the xanthorrhizol docking research was carried out on the cycloocxigenase enzyme to determine the interaction of xanthorrhizol compounds derived from ginger rhizome (Curcuma xanthorriza). The analysis of these compounds used bioinformatics with several software namely PyMOL v.7.4.5, PyRx 0.8, and Avogadro. This software helps to visualize the compound and see the potential inhibitor of the compound against the cyclooxygenase enzyme. The docking of the xanthorrhizol ligand obtained the -7.4 binding affinity which showed it could interact with the active site of the cyclooxygenase enzyme target protein.. Abstrak. Enzim yang berpengaruh dalam proses inflamasi yaitu enzim cyclooxygenase yang berfungsi dalam membentuk sebua prostaglandin untuk membenntuk inflamasi. Senyawa xanthorrhizol mempunyai efek antiinflamasi, sehingga dilakukan penelitian docking xanthorrhizol terhadap enzim cycloocxigenase untuk mengetahui interaksi senyawa xanthorrhizol yang berasal dari tanaman temulawak (Curcuma xanthorriza) analisis senyawa tersebut menggunakan bioinformatika dengan beberapa soft ware yaitu PyMOL v.7.4.5, PyRx 0.8, dan Avogadro. Softwere ini membantu untuk memvisualisasi senyawa dan melihat potensi inhibitor senyawa terhadap enzim cyclooxigenase. Hasil docking dari ligan xanthorrhizol memproleh binding affinity -7,4 yang menunjukkan dapat berinteraksi dengan sisi aktif protein target enzim ciclooxigenase

查看原文本刊更多论文

摘要。影响炎症过程的酶是环加氧酶，它在形成前列腺素形成炎症中起作用。黄菌素化合物具有抗炎作用，因此对环氧化酶进行黄菌素对接研究，以确定姜根(Curcuma xanthorriza)中黄菌素化合物的相互作用。这些化合物的分析使用生物信息学软件PyMOL v.7.4.5, PyRx 0.8和Avogadro。该软件有助于可视化化合物，并看到化合物对环氧合酶的潜在抑制剂。黄菌根醇配体对接获得-7.4的结合亲和力，表明它可以与环加氧酶靶蛋白的活性位点相互作用。Abstrak。酶促炎症，酶促炎症，酶促炎症，酶促炎症，酶促炎症，酶促炎症。姜黄(Curcuma xanthorriza)抗炎药，姜黄抗炎药，姜黄抗炎药，姜黄抗炎药，姜黄抗炎药，姜黄抗炎药，姜黄抗炎药，姜黄抗炎药，姜黄抗炎药软膜是一种由senyawa和melithepotential抑制剂senyawa terhadap酶环氧化酶组成的膜。哈西尔对接达里木甘黄菌根酸膜的结合亲和力-7,4阳门农竹坎dapat berinteraksi登甘丝素aktif蛋白靶酶环氧化酶

本文章由计算机程序翻译，如有差异，请以英文原文为准。

求助全文

约1分钟内获得全文求助全文

来源期刊

Jurnal Penelitian Kesehatan Suara Forikes

自引率

0.00%

发文量

审稿时长

6 weeks