Частота и спектр наследственных мутаций в гене TP53 в обширном исследовании российских пациенток с раком молочной железы

И. С. Степанов, Елена Игоревна Васильева, Анна Соколенко, Евгений Имянитов
{"title":"Частота и спектр наследственных мутаций в гене TP53 в обширном исследовании российских пациенток с раком молочной железы","authors":"И. С. Степанов, Елена Игоревна Васильева, Анна Соколенко, Евгений Имянитов","doi":"10.37469/0507-3758-2022-68-5-589-597","DOIUrl":null,"url":null,"abstract":"Введение. Наиболее распространенной опухолевой локализацией при TP53-ассоциированном опухолевом синдроме (heritable TP53-related cancer syndrome ― hTP53rc), который ранее назывался «синдром Ли-Фраумени» ― является рак молочной железы (РМЖ). Синдром характеризуется возникновением наследственной мутации в гене TP53. В настоящем исследовании демонстрируется относительно высокая встречаемость hTP53rc в структуре наследственных опухолей молочной железы, а также представлен корректный алгоритм диагностики TP53-ассоциированных РМЖ в российской популяции.\nЦель исследования. Изучение частоты и спектра наследственных мутаций в гене TP53 у пациенток с РМЖ.\nМатериалы и методы. Проведено исследование 1726 образцов от пациенток с РМЖ при помощи секвенирования нового поколения (next generation sequencing ― NGS) для обнаружения наследственных мутаций в генах TP53, BRCA1/2. Особенностью этого исследования служила возможность использования «обогащенной» выборки ― из нее были исключены все образцы от пациенток с любыми мутациями в генах BRCA1/2 при помощи особого алгоритма. В генах CHEK2, NBS1, BLM были дополнительно исследованы методом ПЦР наиболее часто встречающиеся в популяции мутации: CHEK2 del5395 (del ex9-10), CHEK2 c.444+1G>A [IVS2+1G>A], CHEK2 1100delC, NBS1 657del5, BLM p.Q548X [c.1642C>T] в образцах от 1322 пациенток из 1726. Такая методика была применена для возможности обнаружения носительства двойных мутаций и могла бы позволить оценить особенности клинических проявлений таких ситуаций в случае их обнаружения. Применение алгоритма на основе секвенирования нового поколения с исследованием нескольких генов позволило исключить образцы с мутациями и сформировать итоговую выборку, по которой оценивалась встречаемость hTP53rc.\nРезультаты. Частота hTP53rc в сформированной выборке составила 10/1494, т е. 0,67%.\nЗаключение. Распространенность hTP53rc в российской популяции, очевидно, оценена недостаточно. Вклад hTP53rc в структуру наследственных РМЖ целесообразно учитывать.","PeriodicalId":20495,"journal":{"name":"Problems in oncology","volume":null,"pages":null},"PeriodicalIF":0.0000,"publicationDate":"2022-10-27","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":"0","resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":null,"PeriodicalName":"Problems in oncology","FirstCategoryId":"1085","ListUrlMain":"https://doi.org/10.37469/0507-3758-2022-68-5-589-597","RegionNum":0,"RegionCategory":null,"ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":null,"EPubDate":"","PubModel":"","JCR":"","JCRName":"","Score":null,"Total":0}
引用次数: 0

Abstract

Введение. Наиболее распространенной опухолевой локализацией при TP53-ассоциированном опухолевом синдроме (heritable TP53-related cancer syndrome ― hTP53rc), который ранее назывался «синдром Ли-Фраумени» ― является рак молочной железы (РМЖ). Синдром характеризуется возникновением наследственной мутации в гене TP53. В настоящем исследовании демонстрируется относительно высокая встречаемость hTP53rc в структуре наследственных опухолей молочной железы, а также представлен корректный алгоритм диагностики TP53-ассоциированных РМЖ в российской популяции. Цель исследования. Изучение частоты и спектра наследственных мутаций в гене TP53 у пациенток с РМЖ. Материалы и методы. Проведено исследование 1726 образцов от пациенток с РМЖ при помощи секвенирования нового поколения (next generation sequencing ― NGS) для обнаружения наследственных мутаций в генах TP53, BRCA1/2. Особенностью этого исследования служила возможность использования «обогащенной» выборки ― из нее были исключены все образцы от пациенток с любыми мутациями в генах BRCA1/2 при помощи особого алгоритма. В генах CHEK2, NBS1, BLM были дополнительно исследованы методом ПЦР наиболее часто встречающиеся в популяции мутации: CHEK2 del5395 (del ex9-10), CHEK2 c.444+1G>A [IVS2+1G>A], CHEK2 1100delC, NBS1 657del5, BLM p.Q548X [c.1642C>T] в образцах от 1322 пациенток из 1726. Такая методика была применена для возможности обнаружения носительства двойных мутаций и могла бы позволить оценить особенности клинических проявлений таких ситуаций в случае их обнаружения. Применение алгоритма на основе секвенирования нового поколения с исследованием нескольких генов позволило исключить образцы с мутациями и сформировать итоговую выборку, по которой оценивалась встречаемость hTP53rc. Результаты. Частота hTP53rc в сформированной выборке составила 10/1494, т е. 0,67%. Заключение. Распространенность hTP53rc в российской популяции, очевидно, оценена недостаточно. Вклад hTP53rc в структуру наследственных РМЖ целесообразно учитывать.
在对俄罗斯乳腺癌患者的广泛研究中,TP53基因的遗传突变频率和光谱
引入。最常见的TP53-相关肿瘤定位综合征(hTP53rc)是乳腺癌(rmg)。这种综合症的特征是TP53基因的遗传突变。本研究显示,在遗传性乳腺癌肿瘤结构中hTP53rc相对较高,并在俄罗斯人口中引入了正确的诊断方法。目的研究。研究rmg患者TP53基因的频率和频谱。材料和方法。通过下一代测序(NGS)检测TP53、BRCA1/2基因中的遗传突变,对患者进行了1726个样本。这项研究的特别之处是能够使用“丰富”样本——它排除了BRCA1/2基因突变的病人的所有样本。在CHEK2、NBS1、NBS1、NBS1、NBS1、NBS1、NBS1、NBS1、NBS1、NBS1、NBS1、NBS1、NBS1、NBS1、NBS1、NBS1、NBS1、NBS1、NBS1、NBS1、NBS1、NBS1、NBS1、nb48x等基因中,BLM进一步研究了pcr基因。1642C>T)样品中有1322名患者。这种技术被应用于检测双突变载体的可能性,并可以在检测时评估这种情况的临床表现。通过对新一代多基因测序算法的应用,排除了突变样本,形成了评估htp53rc结果的最终样本。成型样本hTP53rc的频率为10/1494,为0.67%。俄罗斯人口中hTP53rc的普及率显然没有得到充分的估计。hTP53rc对遗传rj结构的贡献值得考虑。
本文章由计算机程序翻译,如有差异,请以英文原文为准。
求助全文
约1分钟内获得全文 求助全文
来源期刊
自引率
0.00%
发文量
0
×
引用
GB/T 7714-2015
复制
MLA
复制
APA
复制
导出至
BibTeX EndNote RefMan NoteFirst NoteExpress
×
提示
您的信息不完整,为了账户安全,请先补充。
现在去补充
×
提示
您因"违规操作"
具体请查看互助需知
我知道了
×
提示
确定
请完成安全验证×
copy
已复制链接
快去分享给好友吧!
我知道了
右上角分享
点击右上角分享
0
联系我们:info@booksci.cn Book学术提供免费学术资源搜索服务,方便国内外学者检索中英文文献。致力于提供最便捷和优质的服务体验。 Copyright © 2023 布克学术 All rights reserved.
京ICP备2023020795号-1
ghs 京公网安备 11010802042870号
Book学术文献互助
Book学术文献互助群
群 号:481959085
Book学术官方微信