S. L. Poder, Manon Delaplace, H. Huet, S. Zientara
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Abstract
Les coronavirus sont présents chez de nombreuses espèces animales : chiens, chats, mais également porcs, ruminants, oiseaux, ainsi que dans la faune sauvage dont les chauves-souris. Les coronavirus infectant les mammifères domestiques et les chiroptères appartiennent aux genres Alpha ou Betacoronavirus. Le genre Gammacoronavirus comprend exclusivement des virus infectant les oiseaux et les mammifères marins tandis que les virus du genre Deltacoronavirus infectent soit les oiseaux soit certains mammifères. Il a été fait l’hypothèse que les virus du genre Alpha et Betacoronavirus trouvent leur origine parmi les coronavirus infectant les chauve-souris tandis que les virus du genre Gamma et Deltacoronavirus seraient issus de virus aviaires. Une même espèce animale peut être infectée par différents coronavirus parfois de genres différents. La multitude d’espèces animales infectées couplée aux possibilités importantes de variabilité du génome des Coronavirus favorisent les transmissions virales inter-espèces et l’émergence de nouveaux virus par recombinaison notamment.