Modeling of the macromolecular composition dynamics of microalgae batch culture

Q4 Computer Science
A. Lelekov, R. P. Trenkenshu
{"title":"Modeling of the macromolecular composition dynamics of microalgae batch culture","authors":"A. Lelekov, R. P. Trenkenshu","doi":"10.20537/2076-7633-2023-15-3-739-756","DOIUrl":null,"url":null,"abstract":"В работе методом математического моделирования проведено исследование механизмов влияния света на скорость роста и макромолекулярный состав накопительной культуры микроводорослей. Показано, что даже при единственном лимитирующем факторе рост микроводорослей сопряжен со значительным изменением биохимического состава биомассы. Отмечено, что существующие математические модели, основанные на принципах ферментативной кинетики, не учитывают возможную смену лимитирующего фактора в процессе увеличения биомассы и не позволяют описать динамику относительного содержания ее биохимических компонентов. В качестве альтернативного подхода предложена двухкомпонентная модель, в основе которой положено предположение о двухстадийности фотоавтотрофного роста. Биомассу микроводорослей можно рассматривать в виде суммы двух макромолекулярных составляющих — структурной и резервной. Предполагается пропорциональность всех структурных компонентов биомассы, что значительно упрощает математические выкладки и верификацию модели. Предлагаемая модель представлена системой двух дифференциальных уравнений: скорость синтеза резервных составляющих биомассы определяется интенсивностью света, а структурных компонентов — потоком резервов на ключевой мультиферментный комплекс. Модель учитывает, что часть резервных компонентов расходуется на пополнение пула макроэргов. Скорости синтеза структурных и резервных форм биомассы заданы линейными сплайнами, которые позволяют учесть смену лимитирующего фактора с ростом плотности накопительной культуры. Показано, что в условиях светового лимитирования накопительную кривую необходимо разделять на несколько областей: неограниченного роста, малой концентрации клеток и оптически плотной культуры. Для каждого участка получены аналитические решения предлагаемой модели, которые выражены в элементарных функциях и позволяют оценить видоспецифические коэффициенты. Проведена верификация модели на экспериментальных данных роста биомассы и динамики относительного содержания хлорофилла а накопительной культуры красной морской микроводоросли Pоrphуridium purpurеum.","PeriodicalId":37429,"journal":{"name":"Computer Research and Modeling","volume":null,"pages":null},"PeriodicalIF":0.0000,"publicationDate":"2023-06-01","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":"0","resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":null,"PeriodicalName":"Computer Research and Modeling","FirstCategoryId":"1085","ListUrlMain":"https://doi.org/10.20537/2076-7633-2023-15-3-739-756","RegionNum":0,"RegionCategory":null,"ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":null,"EPubDate":"","PubModel":"","JCR":"Q4","JCRName":"Computer Science","Score":null,"Total":0}
引用次数: 0

Abstract

В работе методом математического моделирования проведено исследование механизмов влияния света на скорость роста и макромолекулярный состав накопительной культуры микроводорослей. Показано, что даже при единственном лимитирующем факторе рост микроводорослей сопряжен со значительным изменением биохимического состава биомассы. Отмечено, что существующие математические модели, основанные на принципах ферментативной кинетики, не учитывают возможную смену лимитирующего фактора в процессе увеличения биомассы и не позволяют описать динамику относительного содержания ее биохимических компонентов. В качестве альтернативного подхода предложена двухкомпонентная модель, в основе которой положено предположение о двухстадийности фотоавтотрофного роста. Биомассу микроводорослей можно рассматривать в виде суммы двух макромолекулярных составляющих — структурной и резервной. Предполагается пропорциональность всех структурных компонентов биомассы, что значительно упрощает математические выкладки и верификацию модели. Предлагаемая модель представлена системой двух дифференциальных уравнений: скорость синтеза резервных составляющих биомассы определяется интенсивностью света, а структурных компонентов — потоком резервов на ключевой мультиферментный комплекс. Модель учитывает, что часть резервных компонентов расходуется на пополнение пула макроэргов. Скорости синтеза структурных и резервных форм биомассы заданы линейными сплайнами, которые позволяют учесть смену лимитирующего фактора с ростом плотности накопительной культуры. Показано, что в условиях светового лимитирования накопительную кривую необходимо разделять на несколько областей: неограниченного роста, малой концентрации клеток и оптически плотной культуры. Для каждого участка получены аналитические решения предлагаемой модели, которые выражены в элементарных функциях и позволяют оценить видоспецифические коэффициенты. Проведена верификация модели на экспериментальных данных роста биомассы и динамики относительного содержания хлорофилла а накопительной культуры красной морской микроводоросли Pоrphуridium purpurеum.
微藻间歇培养大分子组成动力学建模
通过数学建模,研究了光对生长速度的影响机制和储存藻类文化的宏观分子组成。即使在一个有限的因素下,微藻的生长也伴随着生物化学成分的显著变化。注意到现有基于酶动力学原理的数学模型没有考虑到生物质量增加过程中限制因子的可能变化,也不允许描述其生物化学成分相对成分的动力学。另一种方法是提出一种两部分模型,其中包括关于光电生长两阶段的假设。微生物的生物量可以被看作是两个宏观分子的总和——结构和储备。生物质量的所有结构成分都被认为是比例的,这大大简化了模型的数学构造和验证。拟议中的模型是由两个微分方程组成的:生物量的聚变速率由光的强度和结构成分的速率决定的。该模型考虑到,部分备用组件被用于补充pola macerg。生物质量的结构和后备形式的合成速度是由线性合金决定的,线性合金允许考虑随着累积文化密度的增加而改变的限制因素。在光的限制下,累积曲线必须分为几个领域:无限增长、低浓度细胞和光学密集文化。每个部门都收到了拟议模型的分析解决方案,这些方案以基本函数表示,允许评估物种特异系数。该模型被验证为生物质量增长的实验数据和叶绿素相对含量的动力学以及红海藻的累积文化。
本文章由计算机程序翻译,如有差异,请以英文原文为准。
求助全文
约1分钟内获得全文 求助全文
来源期刊
Computer Research and Modeling
Computer Research and Modeling Computer Science-Computational Theory and Mathematics
CiteScore
0.80
自引率
0.00%
发文量
82
审稿时长
15 weeks
期刊介绍: The journal publishes original research papers and review articles in the field of computer research and mathematical modeling in physics, engineering, biology, ecology, economics, psychology etc. The journal covers research on computer methods and simulation of systems of various nature in the leading scientific schools of Russia and other countries. Of particular interest are papers devoted to simulation in thriving fields of science such as nanotechnology, bioinformatics, and econophysics. The main goal of the journal is to cover the development of computer and mathematical methods for the study of processes in complex structured and developing systems. The primary criterion for publication of papers in the journal is their scientific level. The journal does not charge a publication fee. The decision made on publication is based on the results of an independent review. The journal is oriented towards a wide readership – specialists in mathematical modeling in various areas of science and engineering. The scope of the journal includes: — mathematical modeling and numerical simulation; — numerical methods and the basics of their application; — models in physics and technology; — analysis and modeling of complex living systems; — models of economic and social systems. New sections and headings may be included in the next volumes.
×
引用
GB/T 7714-2015
复制
MLA
复制
APA
复制
导出至
BibTeX EndNote RefMan NoteFirst NoteExpress
×
提示
您的信息不完整,为了账户安全,请先补充。
现在去补充
×
提示
您因"违规操作"
具体请查看互助需知
我知道了
×
提示
确定
请完成安全验证×
copy
已复制链接
快去分享给好友吧!
我知道了
右上角分享
点击右上角分享
0
联系我们:info@booksci.cn Book学术提供免费学术资源搜索服务,方便国内外学者检索中英文文献。致力于提供最便捷和优质的服务体验。 Copyright © 2023 布克学术 All rights reserved.
京ICP备2023020795号-1
ghs 京公网安备 11010802042870号
Book学术文献互助
Book学术文献互助群
群 号:481959085
Book学术官方微信