دراسة حاسوبية لفعالية مركب إيبيجالوكاتشين جاليت كمضاد طبيعي للأكسدة

Journal of King Abdulaziz University-science Pub Date : 2020-06-05 DOI:10.4197/sci.32-1.5

حسين ضيف الله المالكي حسين ضيف الله المالكي

{"title":"دراسة حاسوبية لفعالية مركب إيبيجالوكاتشين جاليت كمضاد طبيعي للأكسدة","authors":"حسين ضيف الله المالكي حسين ضيف الله المالكي","doi":"10.4197/sci.32-1.5","DOIUrl":null,"url":null,"abstract":"في هذه الدراسة استخدمنا أساليب حاسوبية حديثة لدراسة الخصائص الضوئية الكهربائية والقدرة التفاعلية والكسح الجذري لـمركب إيبيجالوكاتشين جاليت (-) Epigallocatechin Gallate (EGCG) ، فتم دراسة الحالة الأرضية باستخدام نظرية الكثافة الوظيفية (DFT) في مستويات مختلفة.B3LYP/6-31G* ,B3LYP/6-31G**, B3LYP/6-31+G* : حيث تم حساب الترددات وأنواع الشحنات للمركب عند نفس المستويات الحسابية. يُظهر حساب الطيف المرئي للأشعة فوق البنفسجية لـمركب EGCG في مذيبات مختلفة نطاقي امتصاص في المنطقة 273-277 و285-290 نانومتر تتوافق مع التحولات ? ?* ? و n? ?* على التوالي، وهذه النتائج تتوافق مع القيم التجريبية. كذلك تم حساب فجوة الطاقة HOMO-LUMO (4.48 eV) عند مستوى (B3LYP / 6-31+G**) ، وتم تحديد أعلى مدار جزئي مشغول HOMO وأدنى مدار جزئي غير مشغول LUMO بشكل رئيسي على أجزاء مختلفة من الجزيء مما يدل على خصائص انتقال الشحنات داخل الجزيء .(ICT) تم حساب قيمة طاقة التأين (Ionization Potential) لـمركب EGCG لتكون (157.6) سعرة حرارية / مول وهو أقل بكثير من بعض المركبات القياسية (اللوتولين والفينول) مما يشير إلى زيادة نشاط مركب تحت الدراسة كمضاد للأكسدة. وبالمثل أظهر نتائج آلية انتقال ذرة الهيدروجين سهولة تأين OH-3 مقارنة مع المجموعات الاخرى حيث بلغت قيمة المحتوى الحراري الأدنى لتفكك هذه الرابطة (62.2 سعرة حرارية / مول) مقارنة ببقية روابط OH لـمركب .EGCG كذلك اجريت أيضًا دراسات الالتحام الجزيئي (Molecular Docking) بين مركب (EGCG Ligand) و أوكسيداز اليورات Urate Oxidase (1R4U) لإثبات نشاطه في أكسدة حمض اليوريك. تم تحديد وضع الالتحام الجزيئي باستخدام اعلى درجات Libdock وكانت النتيجة تساوي 121.71 وتم تصوير تفاعلاته لإلقاء الضوء على جوانب الالتحام. ومن الدراسة الحالية اتضح ان مركب إيبيجالوكاتشين جاليت EGCG له اهمية عظمى في تطبيقاته المحتملة كمضاد فعال للأكسدة ومثبط في مواقع تفاعلية مختلفة وكذلك كاسح للجذور الحرة.","PeriodicalId":16197,"journal":{"name":"Journal of King Abdulaziz University-science","volume":"68 1","pages":""},"PeriodicalIF":0.0000,"publicationDate":"2020-06-05","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":"0","resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":null,"PeriodicalName":"Journal of King Abdulaziz University-science","FirstCategoryId":"1085","ListUrlMain":"https://doi.org/10.4197/sci.32-1.5","RegionNum":0,"RegionCategory":null,"ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":null,"EPubDate":"","PubModel":"","JCR":"","JCRName":"","Score":null,"Total":0}

引用次数: 0

Abstract

في هذه الدراسة استخدمنا أساليب حاسوبية حديثة لدراسة الخصائص الضوئية الكهربائية والقدرة التفاعلية والكسح الجذري لـمركب إيبيجالوكاتشين جاليت (-) Epigallocatechin Gallate (EGCG) ، فتم دراسة الحالة الأرضية باستخدام نظرية الكثافة الوظيفية (DFT) في مستويات مختلفة.B3LYP/6-31G* ,B3LYP/6-31G**, B3LYP/6-31+G* : حيث تم حساب الترددات وأنواع الشحنات للمركب عند نفس المستويات الحسابية. يُظهر حساب الطيف المرئي للأشعة فوق البنفسجية لـمركب EGCG في مذيبات مختلفة نطاقي امتصاص في المنطقة 273-277 و285-290 نانومتر تتوافق مع التحولات ? ?* ? و n? ?* على التوالي، وهذه النتائج تتوافق مع القيم التجريبية. كذلك تم حساب فجوة الطاقة HOMO-LUMO (4.48 eV) عند مستوى (B3LYP / 6-31+G**) ، وتم تحديد أعلى مدار جزئي مشغول HOMO وأدنى مدار جزئي غير مشغول LUMO بشكل رئيسي على أجزاء مختلفة من الجزيء مما يدل على خصائص انتقال الشحنات داخل الجزيء .(ICT) تم حساب قيمة طاقة التأين (Ionization Potential) لـمركب EGCG لتكون (157.6) سعرة حرارية / مول وهو أقل بكثير من بعض المركبات القياسية (اللوتولين والفينول) مما يشير إلى زيادة نشاط مركب تحت الدراسة كمضاد للأكسدة. وبالمثل أظهر نتائج آلية انتقال ذرة الهيدروجين سهولة تأين OH-3 مقارنة مع المجموعات الاخرى حيث بلغت قيمة المحتوى الحراري الأدنى لتفكك هذه الرابطة (62.2 سعرة حرارية / مول) مقارنة ببقية روابط OH لـمركب .EGCG كذلك اجريت أيضًا دراسات الالتحام الجزيئي (Molecular Docking) بين مركب (EGCG Ligand) و أوكسيداز اليورات Urate Oxidase (1R4U) لإثبات نشاطه في أكسدة حمض اليوريك. تم تحديد وضع الالتحام الجزيئي باستخدام اعلى درجات Libdock وكانت النتيجة تساوي 121.71 وتم تصوير تفاعلاته لإلقاء الضوء على جوانب الالتحام. ومن الدراسة الحالية اتضح ان مركب إيبيجالوكاتشين جاليت EGCG له اهمية عظمى في تطبيقاته المحتملة كمضاد فعال للأكسدة ومثبط في مواقع تفاعلية مختلفة وكذلك كاسح للجذور الحرة.

查看原文本刊更多论文

关于伊贝卢卡钦-吉利特作为天然抗氧化剂的功效的计算机研究

在这项研究中，我们使用了现代计算机方法来研究电子光特性、反应能力和亚甲基双氧基苯基的根扫描，并在不同级别使用功能密度理论对地面状况进行了研究。B3LYP/6-31G* b3lyp - 6- 31g ** b3lyp - 6-31+ g *:该化合物的频率和货物类型在计算水平相同。对EGCG化合物在不同溶溶剂中的可见紫外光谱法的计算显示，273-277和28- 290纳米之间的吸收波段与变换相对应??* ?和n?这些结果符合实验性价值观。此外，还在B3LYP / 6-31+G**的水平上计算了4.48 eV的能量差距，并确定了主要由不同分子部分组成的低度半动半径和最小的半动半径，这表明了EGCG的电荷在分子内部流动的特性。同样，氢原子传导机制的结果显示，氢原子分解的最小热含量(62.2卡路里/摩尔)与其他化合物的其他部分相比也显示出oh3的容易变性，因为与其他化合物相比，氢原子分解链的较低的热含量(62.2卡路里/摩尔)和氧氧核糖核酸(1R4U)之间也进行了分子对接研究。分子对接位置是用阳极顶端确定的，结果为121.71，其相互作用被拍摄，以显示对接的各个方面。从目前的研究发现，伊维加卡钦·盖利特(eggg)对于在不同的交互式环境中作为一种有效的抗氧化剂、抑制剂和自由根部除尘器，用途十分重要。

本文章由计算机程序翻译，如有差异，请以英文原文为准。

求助全文

约1分钟内获得全文求助全文

来源期刊

Journal of King Abdulaziz University-science

自引率

0.00%

发文量