Genome sizes and genomic guanine+cytosine (GC) contents of the Czech vascular flora with new estimates for 1700 species

Abstract

Obsah DNA v somatických, nereplikovaných jadrech buněk (velikost genomu) a bazove složeni DNA (GC obsah) jsou zakladni genomicke parametry, ktere lze měřit pomoci průtokove cytometrie. Velikost genomu, a tedy i ploidni uroveň mohou ovlivňovat cetne vlastnosti rostlin, a proto se uvaději v modernich biologických florach a databazich biologických vlastnosti druhů. Velikost genomu se dosud měři převažně pro biosystematicke ucely a navzdory velkemu rozvoji průtokove cytometrie v Ceske republice tato informace pro mnohe druhy ceske květeny chybi. Biologický význam GC obsahu je oproti významu velikosti genomu zatim meně jasný, navic se měři obtižněji, a proto jej nezname u velke větsiny druhů. V teto praci přinasime měřeni obou genomických parametrů pro větsinu cevnatých rostlin ceske květeny. Celkem jsme naměřili nově velikosti genomu a genomický GC obsah pro 1908 vzorků 1700 druhů. Velikost genomu je zde poprve uvedena pro vice než 1000 druhů a obsah GC bazi poprve pro vice než 1500 druhů, což vice než zdvojnasobuje množstvi dosud znamých udajů o obsahu GC bazi u cevnatých rostlin. Spolu s dřive uveřejněnými udaji ziskanými v nasi laboratoři na stejných přistrojich a stejnou metodikou jsou tak tyto udaje dostupne pro 1910 druhů ceske květeny (~83 % soucasne flory bez apomiktů, přechodně zavlecných a vyhynulých druhů). Tyto udaje jsou uspořadany do tabulky a doplněny udaji o poctu chromozomů, ploidni urovni a vypoctene monoploidni velikosti genomu. V clanku přinasime popisnou analýzu tohoto datoveho souboru a diskutujeme o některých cytogeograficky pozoruhodných poznatcich. Tento přehled představuje největsi a nejuplnějsi soubor genomických dat pro květenu jednoho statu. Zde prezentovane výsledky tvoři zaklad karyologicke casti ceske databaze druhových vlastnosti Pladias (www.pladias.cz) a budou využity pro analýzy evoluce a biologickeho významu obou měřených genomických parametrů.