烟草 miRNA169 基因家族及启动子的生物信息学分析

Abstract

miRNA169是介导植物低温早花的关键因子。为了明确低温诱导烟草miRNA169基因家族表达的调控机制，培育耐低温抗早花的烟草新品种，对miRBase数据库中烟草miRNA169基因数据进行了分析，并对该基因家族及其启动子的结构和功能进行了预测。结果表明:在烟草基因组中共有19个miRNA169基因，分布在1号、8号和9号染色体上，同一染色体上的miRNA169分布集中。除pre-miRNA169t外，其他pre-miRNA169均具有很高的同源性。同时，在所有烟草miRNA169的启动子上均发现低温胁迫应答元件LTR，以及参与低温应答的激素脱落酸（ABA）和茉莉酸（JA）的应答元件。因此，推测烟草miRNA169对低温胁迫的响应过程可能是LTR、ABA和JA途径三者共同作用的结果。