BLUP (Best Linear Unbiased Predictors) analysis for the selection of superior genotypes in the yellow diploid potato (Solanum tuberosum group Phureja)

José E. Pacheco, J. Urquijo, A. Darghan, Luis Ernesto Rodríguez
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Abstract

Uno de los principales desafíos que enfrentan los mejoradores es la respuesta diferencial de los genotipos de un entorno a otro, conocida como la interacción genotipo × ambiente (GxE). El procedimiento óptimo restringido de máxima verosimilitud/mejor predictor imparcial lineal (REML / BLUP) permite la estimación simultánea de parámetros genéticos y la predicción de valores genotípicos. Los predictores BLUP se presentan como una alternativa al estrechamiento de los valores sesgados. Se basa en las variaciones por genotipo para determinar su valor de respuesta como complemento al índice de selección (SI). El índice de selección (IS) ESIM (Eigenvalue Selection Index) permite seleccionar genotipos basados en dos o más variables o caracteres de selección siempre y cuando la matriz económica posea los valores adecuados para resaltar la variable respuesta deseada. Se evaluaron tres etapas de selección en un programa avanzado de mejoramiento de papa diploide, se obtuvieron los valores BLUP para las variables rendimiento y gravedad específica (GE), y a partir de ellos los parámetros genéticos y el IS. La ganancia genética para rendimiento correspondió a 1.228 kg/planta con una heredabilidad (H2)=0,82, mientras que la GA para GE fue 0,02 con una H2 = 0,935. El IS a partir de los valores BLUP seleccionó en las etapas finales tres nuevos cultivares (Criolla Dorada, Criolla Ocarina y Criolla Sua Pa) que fueron registradas ante el Instituto Colombiano Agropecuario (ICA). Aunque BLUE y BLUP están altamente correlacionadas, el análisis BLUP/ESIM da ventaja al predictor pues reduce las respuestas con efecto ambiental, seleccionando eficientemente genotipos con alto potencial varietal.
黄色二倍体马铃薯(Solanum tuberosum group Phureja)优良基因型选择的BLUP(最佳线性无偏预测因子)分析
育种者面临的主要挑战之一是基因型在不同环境之间的差异反应,即基因型×环境相互作用(GxE)。限制最大似然/最佳线性无偏预测器(REML / BLUP)最优程序允许同时估计遗传参数和预测基因型值。BLUP预测器是缩小偏差值的一种替代方法。它利用基因型变异来确定其响应值,作为选择指数(SI)的补充。特征值选择指数(ESIM)允许基于两个或两个以上的选择变量或性状选择基因型,只要经济矩阵具有适当的值来突出所需的响应变量。对二倍体马铃薯育种计划的三个选择阶段进行了评价,获得了产量和比重变量的BLUP值,并由此获得了遗传参数和si。产量遗传增益为1228 kg/株,遗传力(H2)= 0.82, GA对GE的遗传增益为0.02,H2 = 0.935。在最后阶段,IS从BLUP值中选择了三个新品种(Criolla Dorada, Criolla Ocarina和Criolla Sua Pa),并在哥伦比亚农业研究所(ICA)注册。虽然BLUE和BLUP高度相关,但BLUP/ESIM分析使预测器具有优势,因为它减少了对环境影响的响应,有效地选择了具有高品种潜力的基因型。
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