Модель прогнозирования колоректального рака, основанная на определении уровня экспрессии микроРНК-21 в слюне и плазме.

Елена Киселева, Федор Нефедьев, А Г Захаренко, М. И. Зарайский
{"title":"Модель прогнозирования колоректального рака, основанная на определении уровня экспрессии микроРНК-21 в слюне и плазме.","authors":"Елена Киселева, Федор Нефедьев, А Г Захаренко, М. И. Зарайский","doi":"10.37469/0507-3758-2022-68-5-622-627","DOIUrl":null,"url":null,"abstract":"Введение. Разработка новых подходов к скринингу колоректального рака (КРР), в том числе основанных на таких молекулярно-генетических методах как оценка экспрессии микроРНК, является актуальной клинической задачей.\nЦель исследования. Предложить алгоритм прогнозирования КРР, основанный на определении уровня экспрессии микроРНК-21 в слюне и плазме.\nМатериалы и методы. Уровни экспрессии микроРНК-21 в образцах плазмы крови и слюны, полученные у 65 пациентов с выявленным раком толстой кишки (группа КРР) и 66 здоровых добровольцев (группа контроль), были измерены методом полимеразной цепной реакции обратной транскрипции (ОТ-ПЦР) и выражены в условных единицах экспрессии (УЕ). Произведен корреляционный анализ уровней экспрессии микроРНК-21 в плазме (П-миРНК-21) и слюне (С-миРНК-21) с полом, возрастом, локализацией и стадией процесса. Для выявления предикторов КРР применяли однофакторный анализ. На основе комбинации ведущих факторов выполнено формирование рисковых классов с последующим построением дерева решений, а для анализа качества смоделированного дерева-решения и модели прогнозирования КРР использовался ROC-анализ. Уровень статистической значимости был зафиксирован на уровне 0,05.\nРезультаты. Уровень экспрессии С-миРНК-21 (9,67±18,52 УЕ) и П-миРНК-21 (3,71±7,38 УЕ) в группе КРР был выше, чем в группе контроля (р<0,0001 и р=0,0089 соответственно). С-миРНК-21 коррелировала с П-миРНК-21 (r=0,31; р<0,05). Корреляции экспрессии микроРНК-21 с полом, возрастом, локализацией процесса и стадией заболевания получено не было. Предикторами наличия КРР при однофакторном анализе стали: С-миРНК-21>2 УЕ [ОР (ДИ): 2,51 (1,76; 3,58)], П-миРНК-21>1,6 УЕ [ОР (ДИ): 2,41 (1,75; 3,31)], возраст>61 год [ОР (ДИ): 2,65 (1,67; 4,21)], высокий уровень ракового эмбрионального антигена (РЭА) [ОР (ДИ): 2,4 (1,93; 2,99)], высокий уровень СА-19.9 [ОР (ДИ): 2,27 (1,85; 2,78)]. Чувствительность и специфичность П-миРНК-21>1,6 УЕ и С-миРНК-21>2 УЕ в качестве маркеров КРР составили 52 и 89 и 61% и 83% соответственно. Предложен алгоритм диагностики КРР в виде модели дерева решений на основе С-миРНК-21, П-миРНК-21 и возраста, обладающей высокими чувствительностью (88,7%) и специфичностью (76,6%) при AuROC 0,86.\nЗаключение. Оценка экспрессии микроРНК-21в слюне и плазме может быть подходящим неинвазивным биомаркером для диагностики КРР.","PeriodicalId":20495,"journal":{"name":"Problems in oncology","volume":null,"pages":null},"PeriodicalIF":0.0000,"publicationDate":"2022-10-27","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":"0","resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":null,"PeriodicalName":"Problems in oncology","FirstCategoryId":"1085","ListUrlMain":"https://doi.org/10.37469/0507-3758-2022-68-5-622-627","RegionNum":0,"RegionCategory":null,"ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":null,"EPubDate":"","PubModel":"","JCR":"","JCRName":"","Score":null,"Total":0}
引用次数: 0

Abstract

Введение. Разработка новых подходов к скринингу колоректального рака (КРР), в том числе основанных на таких молекулярно-генетических методах как оценка экспрессии микроРНК, является актуальной клинической задачей. Цель исследования. Предложить алгоритм прогнозирования КРР, основанный на определении уровня экспрессии микроРНК-21 в слюне и плазме. Материалы и методы. Уровни экспрессии микроРНК-21 в образцах плазмы крови и слюны, полученные у 65 пациентов с выявленным раком толстой кишки (группа КРР) и 66 здоровых добровольцев (группа контроль), были измерены методом полимеразной цепной реакции обратной транскрипции (ОТ-ПЦР) и выражены в условных единицах экспрессии (УЕ). Произведен корреляционный анализ уровней экспрессии микроРНК-21 в плазме (П-миРНК-21) и слюне (С-миРНК-21) с полом, возрастом, локализацией и стадией процесса. Для выявления предикторов КРР применяли однофакторный анализ. На основе комбинации ведущих факторов выполнено формирование рисковых классов с последующим построением дерева решений, а для анализа качества смоделированного дерева-решения и модели прогнозирования КРР использовался ROC-анализ. Уровень статистической значимости был зафиксирован на уровне 0,05. Результаты. Уровень экспрессии С-миРНК-21 (9,67±18,52 УЕ) и П-миРНК-21 (3,71±7,38 УЕ) в группе КРР был выше, чем в группе контроля (р<0,0001 и р=0,0089 соответственно). С-миРНК-21 коррелировала с П-миРНК-21 (r=0,31; р<0,05). Корреляции экспрессии микроРНК-21 с полом, возрастом, локализацией процесса и стадией заболевания получено не было. Предикторами наличия КРР при однофакторном анализе стали: С-миРНК-21>2 УЕ [ОР (ДИ): 2,51 (1,76; 3,58)], П-миРНК-21>1,6 УЕ [ОР (ДИ): 2,41 (1,75; 3,31)], возраст>61 год [ОР (ДИ): 2,65 (1,67; 4,21)], высокий уровень ракового эмбрионального антигена (РЭА) [ОР (ДИ): 2,4 (1,93; 2,99)], высокий уровень СА-19.9 [ОР (ДИ): 2,27 (1,85; 2,78)]. Чувствительность и специфичность П-миРНК-21>1,6 УЕ и С-миРНК-21>2 УЕ в качестве маркеров КРР составили 52 и 89 и 61% и 83% соответственно. Предложен алгоритм диагностики КРР в виде модели дерева решений на основе С-миРНК-21, П-миРНК-21 и возраста, обладающей высокими чувствительностью (88,7%) и специфичностью (76,6%) при AuROC 0,86. Заключение. Оценка экспрессии микроРНК-21в слюне и плазме может быть подходящим неинвазивным биомаркером для диагностики КРР.
结肠癌预测模型基于唾液和血浆中的mirna -21表达水平。
引入。研究结肠癌筛查(crr)的新方法,包括基于mirna表达评估等分子遗传方法,是一项重要的临床任务。目的研究。提供一个基于唾液和血浆中mirna -21表达水平的预测算法。材料和方法。65名确诊结肠癌患者和66名健康志愿者(crr组)的血浆和唾液中的mirna -21表达水平由多氯胺酮链式反应(pcr)测量,并以条件单位表示。对等离子体中的mirna -21表达水平和唾液(c - myrna -21)进行了相关分析。krr使用单个因子分析来识别教学者。在关键因素的组合中,已经完成了风险等级的形成和决策树的构建,rrr使用ROC分析来分析建模树的质量和预测模型。统计重要性已被记录为0.05.0。c - mirna -21 (9.67 18.52 y)和p - mirna -21 (3.71 7.38 y)的表述水平高于控制组(rr): 2.51 (1.76);3.58), p - mirna -21> 1.6 ue (or): 2.41 (1.75);3.31岁(>61岁):2.65岁(1.67岁);4.21),高水平的胚胎抗原(rh): 2.4 (1.93);2.99),sa -19.9 (or): 2.27 (1.85);2.78)]。p - mirna -21> 1.6 >和c - mirna -21>2 >分别为52和89和61%和83%。crr基于c - mirna -21、p - mirna -21和年龄高度敏感(88.7%)和特异性(76.6%)的诊断算法提供。唾液和血浆中的mirna - 21s表达评估可能是诊断crr的一种非侵入性生物标记。
本文章由计算机程序翻译,如有差异,请以英文原文为准。
求助全文
约1分钟内获得全文 求助全文
来源期刊
自引率
0.00%
发文量
0
×
引用
GB/T 7714-2015
复制
MLA
复制
APA
复制
导出至
BibTeX EndNote RefMan NoteFirst NoteExpress
×
提示
您的信息不完整,为了账户安全,请先补充。
现在去补充
×
提示
您因"违规操作"
具体请查看互助需知
我知道了
×
提示
确定
请完成安全验证×
copy
已复制链接
快去分享给好友吧!
我知道了
右上角分享
点击右上角分享
0
联系我们:info@booksci.cn Book学术提供免费学术资源搜索服务,方便国内外学者检索中英文文献。致力于提供最便捷和优质的服务体验。 Copyright © 2023 布克学术 All rights reserved.
京ICP备2023020795号-1
ghs 京公网安备 11010802042870号
Book学术文献互助
Book学术文献互助群
群 号:481959085
Book学术官方微信