Елена Киселева, Федор Нефедьев, А Г Захаренко, М. И. Зарайский
{"title":"Модель прогнозирования колоректального рака, основанная на определении уровня экспрессии микроРНК-21 в слюне и плазме.","authors":"Елена Киселева, Федор Нефедьев, А Г Захаренко, М. И. Зарайский","doi":"10.37469/0507-3758-2022-68-5-622-627","DOIUrl":null,"url":null,"abstract":"Введение. Разработка новых подходов к скринингу колоректального рака (КРР), в том числе основанных на таких молекулярно-генетических методах как оценка экспрессии микроРНК, является актуальной клинической задачей.\nЦель исследования. Предложить алгоритм прогнозирования КРР, основанный на определении уровня экспрессии микроРНК-21 в слюне и плазме.\nМатериалы и методы. Уровни экспрессии микроРНК-21 в образцах плазмы крови и слюны, полученные у 65 пациентов с выявленным раком толстой кишки (группа КРР) и 66 здоровых добровольцев (группа контроль), были измерены методом полимеразной цепной реакции обратной транскрипции (ОТ-ПЦР) и выражены в условных единицах экспрессии (УЕ). Произведен корреляционный анализ уровней экспрессии микроРНК-21 в плазме (П-миРНК-21) и слюне (С-миРНК-21) с полом, возрастом, локализацией и стадией процесса. Для выявления предикторов КРР применяли однофакторный анализ. На основе комбинации ведущих факторов выполнено формирование рисковых классов с последующим построением дерева решений, а для анализа качества смоделированного дерева-решения и модели прогнозирования КРР использовался ROC-анализ. Уровень статистической значимости был зафиксирован на уровне 0,05.\nРезультаты. Уровень экспрессии С-миРНК-21 (9,67±18,52 УЕ) и П-миРНК-21 (3,71±7,38 УЕ) в группе КРР был выше, чем в группе контроля (р<0,0001 и р=0,0089 соответственно). С-миРНК-21 коррелировала с П-миРНК-21 (r=0,31; р<0,05). Корреляции экспрессии микроРНК-21 с полом, возрастом, локализацией процесса и стадией заболевания получено не было. Предикторами наличия КРР при однофакторном анализе стали: С-миРНК-21>2 УЕ [ОР (ДИ): 2,51 (1,76; 3,58)], П-миРНК-21>1,6 УЕ [ОР (ДИ): 2,41 (1,75; 3,31)], возраст>61 год [ОР (ДИ): 2,65 (1,67; 4,21)], высокий уровень ракового эмбрионального антигена (РЭА) [ОР (ДИ): 2,4 (1,93; 2,99)], высокий уровень СА-19.9 [ОР (ДИ): 2,27 (1,85; 2,78)]. Чувствительность и специфичность П-миРНК-21>1,6 УЕ и С-миРНК-21>2 УЕ в качестве маркеров КРР составили 52 и 89 и 61% и 83% соответственно. Предложен алгоритм диагностики КРР в виде модели дерева решений на основе С-миРНК-21, П-миРНК-21 и возраста, обладающей высокими чувствительностью (88,7%) и специфичностью (76,6%) при AuROC 0,86.\nЗаключение. Оценка экспрессии микроРНК-21в слюне и плазме может быть подходящим неинвазивным биомаркером для диагностики КРР.","PeriodicalId":20495,"journal":{"name":"Problems in oncology","volume":null,"pages":null},"PeriodicalIF":0.0000,"publicationDate":"2022-10-27","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":"0","resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":null,"PeriodicalName":"Problems in oncology","FirstCategoryId":"1085","ListUrlMain":"https://doi.org/10.37469/0507-3758-2022-68-5-622-627","RegionNum":0,"RegionCategory":null,"ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":null,"EPubDate":"","PubModel":"","JCR":"","JCRName":"","Score":null,"Total":0}
引用次数: 0
Abstract
Введение. Разработка новых подходов к скринингу колоректального рака (КРР), в том числе основанных на таких молекулярно-генетических методах как оценка экспрессии микроРНК, является актуальной клинической задачей.
Цель исследования. Предложить алгоритм прогнозирования КРР, основанный на определении уровня экспрессии микроРНК-21 в слюне и плазме.
Материалы и методы. Уровни экспрессии микроРНК-21 в образцах плазмы крови и слюны, полученные у 65 пациентов с выявленным раком толстой кишки (группа КРР) и 66 здоровых добровольцев (группа контроль), были измерены методом полимеразной цепной реакции обратной транскрипции (ОТ-ПЦР) и выражены в условных единицах экспрессии (УЕ). Произведен корреляционный анализ уровней экспрессии микроРНК-21 в плазме (П-миРНК-21) и слюне (С-миРНК-21) с полом, возрастом, локализацией и стадией процесса. Для выявления предикторов КРР применяли однофакторный анализ. На основе комбинации ведущих факторов выполнено формирование рисковых классов с последующим построением дерева решений, а для анализа качества смоделированного дерева-решения и модели прогнозирования КРР использовался ROC-анализ. Уровень статистической значимости был зафиксирован на уровне 0,05.
Результаты. Уровень экспрессии С-миРНК-21 (9,67±18,52 УЕ) и П-миРНК-21 (3,71±7,38 УЕ) в группе КРР был выше, чем в группе контроля (р<0,0001 и р=0,0089 соответственно). С-миРНК-21 коррелировала с П-миРНК-21 (r=0,31; р<0,05). Корреляции экспрессии микроРНК-21 с полом, возрастом, локализацией процесса и стадией заболевания получено не было. Предикторами наличия КРР при однофакторном анализе стали: С-миРНК-21>2 УЕ [ОР (ДИ): 2,51 (1,76; 3,58)], П-миРНК-21>1,6 УЕ [ОР (ДИ): 2,41 (1,75; 3,31)], возраст>61 год [ОР (ДИ): 2,65 (1,67; 4,21)], высокий уровень ракового эмбрионального антигена (РЭА) [ОР (ДИ): 2,4 (1,93; 2,99)], высокий уровень СА-19.9 [ОР (ДИ): 2,27 (1,85; 2,78)]. Чувствительность и специфичность П-миРНК-21>1,6 УЕ и С-миРНК-21>2 УЕ в качестве маркеров КРР составили 52 и 89 и 61% и 83% соответственно. Предложен алгоритм диагностики КРР в виде модели дерева решений на основе С-миРНК-21, П-миРНК-21 и возраста, обладающей высокими чувствительностью (88,7%) и специфичностью (76,6%) при AuROC 0,86.
Заключение. Оценка экспрессии микроРНК-21в слюне и плазме может быть подходящим неинвазивным биомаркером для диагностики КРР.