Investigation of Demographic, Clinical, Pathological Features and HSNF5 (SMARCB1)/INI1 Gene Mutations in Patients Diagnosed as Atypical Teratoid Rhabdoid Tumors

Abstract

139 ÖZET Amaç: Atipik teratoid/rabdoid tümör (AT/RT), çocukluk çağı santral sinir sistemi (SSS) tümörlerinden olan embriyonel tümörlerin nadir bir alt grubunu oluşturmaktadır. 22q11.2'de lokalize SMARCB1/INI1 geninde somatik dokularda oluşan değişikliklerin (delesyon, nokta mutasyonu, heterozigosite kaybı), AT/RT’lerin yaklaşık %75-98’inde bulunduğu gösterilmiştir. Ayrıca AT/RT’li hastaların 1/3’ünde SMARCB1/INI1 geninde germline mutasyonlar bildirilmiştir. Bu çalışmada, AT/RT tanısı alan hastalarda bu tümör ile ilişkili bir tümör supresör gen olan SMARCB1/INI1 mutasyonlarının araştırılması amaçlanmıştır. Gereç ve Yöntemler: Bu çalışmada, 2010-2015 yılları arasında Ege Üniversitesi Tıp Fakültesinde, AT/RT tanısı almış olguların demografik, klinik, patolojik özellikleri ve SMARCB1/INI1 mutasyonları değerlendirildi. Olguların hepsinin tümör dokusuna ait patoloji preparatlarından ve ulaşılabilen olguların periferik kanlarından DNA izole edilerek, SMARCB1/INI1 geni için tüm ekzonik bölgeler polimeraz zincir reaksiyonu ile çoğaltıldı, jel elektroforezi ile kontrol edildikten sonra DNA dizi analizi gerçekleştirildi. Tespit edilen varyasyonların patojenitesi, Amerikan Tıbbi Genetik Koleji 2015 kriterlerine göre değerlendirildi. Bulgular: Çalışmaya alınan 10 hastanın 7’si SSS’nin AT/RT’si, 2’si yumuşak dokuda RT, biri renal RT tanılıydı. Hastaların %77’sinde tümör dokusunda immünohistokimyasal yöntemler ile SMARCB1/INI1 protein ekspresyonu kaybı saptandı ve bu hastaların ortanca sağkalım süresinin 5 ay (1-69 ay, SE: 9,29 ay) olduğu görüldü. Dört hastanın tümör dokusunda SMARCB1/INI1 geninde, mutasyon saptandı ve bu hastaların ortanca sağkalım süresi 5,5 ay (1-15 ay, SE: 2,95 ay) olarak saptandı. SMARCB1/INI1 geninde mutasyon saptanmayan hastaların ortanca sağkalım süresi 10,5 ay (1-81 ay, SE: 14,6 ay) olarak saptandı. Sonuç: Tümör dokusunda SMARCB1/INI1 geninde mutasyon saptanan hastaların ortanca sağkalım sürelerinin, mutasyon saptanmayanlara göre daha kısa olduğu gözlenmiştir. Önceki yayınlardan farklı olarak AT/RT tanılı hasta grubumuzda, hiçbir hastada SMARCB1/INI1 geninde germline mutasyon saptanmamıştır.