{"title":"Development of Biomolecular Interfaces Constructed on the Frameworks of Huge, Hollow Spherical Complexes","authors":"Sota Sato","doi":"10.4019/bjscc.65.30","DOIUrl":null,"url":null,"abstract":"生命現象においては、たとえば、酵素がその認識ポケ ットに小分子をとりこむことで非共有結合による分子認 識が発現し、選択的かつ高効率な化学反応が制御される 現象が知られている。このような、ホスト分子がゲスト となる基質を包み込んで独特の構造を構築し、物性や反 応が制御されるシステムは、ホスト -ゲスト化学として 人工系においても模倣されてきた。他の手法では実現が 困難な、あるいは実現不可能な興味深い知見がホスト ゲスト化学の手法を使って多数報告されてきているが、 それらの報告例のほとんどは 3ナノメートル以下の分子 スケールでの現象であり、認識サイトが基質を「点」と して認識するタイプのものであった。 一方で生命現象においては、たとえば、細胞表面にお いて糖鎖がよりあつまってクラスターをなす構造が「面 = インターフェース」としてはたらき、重要な認識信号 として作用することが知られている。このような、非常 に多くの数の認識官能基がよりあつまることで、初めて 機能が発現する「面」の分子認識のシステムを、構造と 機能との相関を明確に示しながら展開した研究例は極め て限られる。その理由は明確であり、機能が発現する状 況において、三次元構造も考慮した全体の構造が分子レ ベルで整っており、人工合成によって自在に設計して調 製できる分子システムそのものが無かったからである。 個々の認識能は弱いものの、高密度な集積化によって機 能が発現する複雑なシステムを合理的に開発するために は、構造 -機能の相関が明瞭に定められたシステムを対 象とし、実験的にその相関を明らかにすることを通じて、 ねらった機能を分子設計にフィードバックできる必要が ある。 本研究においては、自己組織化により構造にばらつき がない単分散な中空球状錯体を基本骨格として用い、定 量的な生体分子の官能基化による生体分子クラスターの 開発をおこなった。研究をはじめた当初、このような構 造が分子レベルで一義的に定まり、かつ直径が数ナノメ ートルを超える巨大な錯体分子の合成そのものが挑戦的 な課題であった。合成法の改善と構造決定法の開発、さ らに、研究の進捗とオンタイムで開発された新しい装置・ 施設の利用を一体となって探求したことで、世界最大の 単一構造分子の調製法を確立できた。さらに、標的にし The clusters of biomolecules have an important role as recognition interface in living systems, where the weak molecular recognition of each biomolecular unit is efficiently enhanced by the dense assembly of the units to realize strong affinity. The mimic of these molecular designs has been explored, but the structural deviations or small number of clustered units are not satisfactory as the model of natural interfaces. In our recent projects, we synthesized biomolecular clusters by anchoring a biomolecular unit to an organic ligand followed by assembling the ligands with transition metal ions to obtain self-assembled spherical complexes. Owing to the self-assembly nature of the coordination complexes, the number of introduced biomolecular units is strictly defined, the molecular sizes are huge with the diameter of several to ten nanometers, and the synthesis is quite simple and quantitative. With the variety of sugar, DNA, or peptide clusters, we demonstrated that the huge clusters work as functional interfaces and realized the application to biomolecular or inorganic recognition and further extended to the template synthesis exploiting the recognition functions and the unique three-dimensional shape.","PeriodicalId":72479,"journal":{"name":"Bulletin of Japan Society of Coordination Chemistry","volume":"65 1","pages":"30-37"},"PeriodicalIF":0.0000,"publicationDate":"2015-01-01","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"https://sci-hub-pdf.com/10.4019/bjscc.65.30","citationCount":"0","resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":null,"PeriodicalName":"Bulletin of Japan Society of Coordination Chemistry","FirstCategoryId":"1085","ListUrlMain":"https://doi.org/10.4019/bjscc.65.30","RegionNum":0,"RegionCategory":null,"ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":null,"EPubDate":"","PubModel":"","JCR":"","JCRName":"","Score":null,"Total":0}
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Abstract
生命現象においては、たとえば、酵素がその認識ポケ ットに小分子をとりこむことで非共有結合による分子認 識が発現し、選択的かつ高効率な化学反応が制御される 現象が知られている。このような、ホスト分子がゲスト となる基質を包み込んで独特の構造を構築し、物性や反 応が制御されるシステムは、ホスト -ゲスト化学として 人工系においても模倣されてきた。他の手法では実現が 困難な、あるいは実現不可能な興味深い知見がホスト ゲスト化学の手法を使って多数報告されてきているが、 それらの報告例のほとんどは 3ナノメートル以下の分子 スケールでの現象であり、認識サイトが基質を「点」と して認識するタイプのものであった。 一方で生命現象においては、たとえば、細胞表面にお いて糖鎖がよりあつまってクラスターをなす構造が「面 = インターフェース」としてはたらき、重要な認識信号 として作用することが知られている。このような、非常 に多くの数の認識官能基がよりあつまることで、初めて 機能が発現する「面」の分子認識のシステムを、構造と 機能との相関を明確に示しながら展開した研究例は極め て限られる。その理由は明確であり、機能が発現する状 況において、三次元構造も考慮した全体の構造が分子レ ベルで整っており、人工合成によって自在に設計して調 製できる分子システムそのものが無かったからである。 個々の認識能は弱いものの、高密度な集積化によって機 能が発現する複雑なシステムを合理的に開発するために は、構造 -機能の相関が明瞭に定められたシステムを対 象とし、実験的にその相関を明らかにすることを通じて、 ねらった機能を分子設計にフィードバックできる必要が ある。 本研究においては、自己組織化により構造にばらつき がない単分散な中空球状錯体を基本骨格として用い、定 量的な生体分子の官能基化による生体分子クラスターの 開発をおこなった。研究をはじめた当初、このような構 造が分子レベルで一義的に定まり、かつ直径が数ナノメ ートルを超える巨大な錯体分子の合成そのものが挑戦的 な課題であった。合成法の改善と構造決定法の開発、さ らに、研究の進捗とオンタイムで開発された新しい装置・ 施設の利用を一体となって探求したことで、世界最大の 単一構造分子の調製法を確立できた。さらに、標的にし The clusters of biomolecules have an important role as recognition interface in living systems, where the weak molecular recognition of each biomolecular unit is efficiently enhanced by the dense assembly of the units to realize strong affinity. The mimic of these molecular designs has been explored, but the structural deviations or small number of clustered units are not satisfactory as the model of natural interfaces. In our recent projects, we synthesized biomolecular clusters by anchoring a biomolecular unit to an organic ligand followed by assembling the ligands with transition metal ions to obtain self-assembled spherical complexes. Owing to the self-assembly nature of the coordination complexes, the number of introduced biomolecular units is strictly defined, the molecular sizes are huge with the diameter of several to ten nanometers, and the synthesis is quite simple and quantitative. With the variety of sugar, DNA, or peptide clusters, we demonstrated that the huge clusters work as functional interfaces and realized the application to biomolecular or inorganic recognition and further extended to the template synthesis exploiting the recognition functions and the unique three-dimensional shape.
在生命现象中,例如,酶将小分子吸入识别口袋中,通过非共价结合来表现分子识别,从而控制选择性、高效率的化学反应。这种主机分子包裹作为客物的基质,构建独特的结构,物性和反应受到控制的系统,作为主机-客物化学在人工系统中也被模仿。使用主机客化学的方法报告了许多其他方法难以实现或不可能实现的有趣的知识,但大部分报告都是3纳米以下的分子。这是一种规模现象,是识别网站将基质视为“点”的类型。另一方面,在生命现象中,例如,位于细胞表面的糖链聚集成簇的结构起到“面=接口”的作用,作为重要的认识信号发挥作用。像这样,将大量的认识官能基聚集在一起,首次发现功能的“面”的分子认识系统,在明确展示结构和功能之间的相关性的同时展开的研究例子极其有限。其理由很明确,因为在功能表现的情况下,还没有一种分子系统能够在分子等级上完整地考虑到三维结构,并通过人工合成自由设计和调配。为了合理地开发单个识别能力较弱,但因高密度集成化而表现出功能的复杂系统,配对结构-功能相关明确的系统。我们需要将其比喻成大象,通过实验明确其相关性,将目标功能反馈到分子设计中。在本研究中,使用通过自组装结构无偏差的单分散的中空球状络合物作为基本骨架,通过定量生物分子的官能团化开发生物分子簇。在开始研究之初,这种结构在分子水平上被统一定义,并且直径超过数纳米的巨大配合物分子的合成本身就是一个具有挑战性的课题。通过对合成方法的改善和结构确定方法的开发,结合研究的进展和实时开发的新设备、设施的利用进行探索,确立了世界上最大的单一结构分子的制备方法。另外,以The clusters of biomolecules have an important role as recognition interface in living为目标systems,where the weak molecular recoition of each biomolecular unit is efficiently增强by the denseassembly of the units to realize strong affinity. the mimic of these molecular designs has beenexplored,but the structural deviations or small number of clustered units are not satisfactory as the modelnatural interfaces. In our recent projects,we synthesized biomolecular clusters by anchoring a biomolecular unit to an organic ligand followedby assembling the ligands with transition metal ions to obtain self-assembled spherical complexes.Owing to the self-assembly nature of the coordination complexes,introduced biomolecular units is strictly defined,the molecular sizes are huge with the diameter of several to ten nanometers,and the synthesis quite simple and quantitative. With the variety of sugar, DNA,or peptide clusters,we demonstrated that the huge clusters work as功能interfaces and realized the application tobiomolecular or inorganic recognition and further扩展到template synthesis exploiting therecognition functions and the unique three-dimensional shape。