癌症潜在药物靶点关键基因的鉴定

癌症是最常见的癌症之一，在世界癌症死亡率中排名第三。这项研究的目的是确定潜在的中枢基因，强调它们的功能、信号通路和治疗GC患者的候选药物。我们使用公开的下一代测序（NGS）数据来鉴定差异表达（DE）基因。将顶部DE基因映射到STRING数据库以构建蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）网络，并选择顶部枢纽基因进行进一步分析。我们在GC中总共发现了1555个DE基因，其中870个上调，685个下调。我们选择了前400个（200个上调和200个下调）基因来构建PPI网络，并提取了前15个枢纽基因。基因本体论（GO）术语和京都基因与基因组百科全书（KEGG）对15个中枢基因的通路富集分析揭示了一些与GC患者显著相关的重要功能和信号通路。中枢基因的存活分析揭示了三个中枢基因CDH2、COL4A1和COL5A2的较低表达与GC患者的较好存活率相关。这三个基因可能是GC诊断和治疗的候选生物标志物。然后，我们考虑了3种关键蛋白（基因组生物标志物）（COL4A1、CDH2和CO5A2）作为药物靶蛋白（受体），并对其与102种元药物制剂进行了对接分析，发现依维莫司、多西他赛、兰瑞肽、Venetoclax、特姆西莫司和尼洛替尼是我们提出的治疗GC患者的靶蛋白中排名前6的候选药物。因此，所提出的药物可能对GC患者的治疗起到至关重要的作用。