Detección molecular de virus en cultivos, plántulas y semillas de gulupa (Passiflora edulis f. edulis) en el oriente de Antioquia

IF 0.6 4区农林科学 Q4 AGRONOMY

Bioagro Pub Date : 2022-05-01 DOI:10.51372/bioagro342.3

D. Cardona, Yuliana Marcela Gallo García, Mónica Higuita, Rodrigo Hoyos Sánchez, P. G. Gutiérrez Sánchez, Mauricio Alejandro Marín Montoya

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Abstract

La gulupa (Passiflora edulisf. edulis) es uno de los frutales con mayor crecimiento en los últimos años y de gran influencia en la economía de Antioquia (Colombia); sin embargo, su cultivo es afectado por diferentes problemas fitosanitarios, especialmente la marchitez por Fusariumoxysporumyenfermedades virales. En este estudio se evaluóla prevalencia de cuatro virus de ARN (SMV, CABMV, PFYMV y CMV) mediante RT-qPCR, virus del género Begomovirusy del badnavirus GBVA por PCR, a partir de muestras sintomáticas (SI) y asintomáticas (AS) obtenidas en 15 lotes, 15 grupos de plántulas (PL) y 15 muestras de semilla sexual en el oriente de Antioquia. Los genomas de los virus fueron ensamblados utilizando secuenciación masiva (HTS) a partir de grupos de muestras (15x). Con excepción de CABMV y begomovirus, los otros virus fueron encontrados en las muestras sintomáticas y asintomáticas, siendo el PFYMV (SI=33,3 % y AS=46,6 %) y SMV (SI=33,3 % y AS=20 %) los de mayor prevalencia,mientrasqueGBVA yCMV sedetectaron enniveles inferiores al26,6 %. Deforma interesante, los cuatro virus detectados se encontraron en evaluaciones sobre brotes de semillasrecién germinadas(SMV=40 %, CMV=13,3 %, PFYMV=86,6 %, GBVA=53,3 %), lo que sugiere que la semilla sexual juega un papel importante en la transmisión de estos virus en gulupa, así como también las plántulas comercializadas en esta región (SMV=86,6 %, CMV=0 %, PFYMV=60 %, GBVA=53,3 %). Mediante HTS fue posible el ensamblaje completo de los genomas de PFYMV, SMV y GBVA. Estos resultados enfatizan la necesidad de generar material certificado por su sanidad viral en gulupa

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安蒂奥基亚东部古鲁帕(西番莲)作物、幼苗和种子中病毒的分子检测

Gulupa（Passiflora edulisf.edulis）是近年来增长最快的水果之一，对哥伦比亚安蒂奥基亚的经济产生了重大影响；然而，它的种植受到不同的植物健康问题的影响，特别是病毒镰刀菌引起的枯萎病。在这项研究中，通过RT-QPCR评估了四种RNA病毒（SMV、CABMV、PFYMV和CMV）的患病率，通过PCR评估了Badnavirus GBVA的Begomovirusy属病毒，从安蒂奥基亚东部15批、15组幼苗和15个有性种子样本中获得的症状（SI）和无症状（AS）样本中进行了评估。使用来自样本组（15x）的大规模测序（HTS）组装病毒基因组。除CABMV和Begomovirus外，其他病毒在有症状和无症状的样本中发现，其中PFYMV（SI=33.3%和AS=46.6%）和SMV（SI=33.3%和AS=20%）的患病率最高，而YCMV Sedetected Enniveles的患病率较低，为26.6%。有趣的是，检测到的四种病毒都是在对发芽种子爆发的评估中发现的（SMV=40%，CMV=13.3%，PFYMV=86.6%，GBVA=53.3%），这表明有性种子在这些病毒在Gulupa的传播中起着重要作用，以及在该地区销售的幼苗（SMV=86.6%，CMV=0%，PFYMV=60%，GBVA=53.3%）。通过HTS，可以完全组装PFYMV、SMV和GBVA的基因组。这些结果强调，有必要生产经Gulupa病毒健康认证的材料

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Bioagro Agricultural and Biological Sciences-General Agricultural and Biological Sciences

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期刊介绍： Bioagro es una revista científica del Decanato de Agronomía de la Universidad Centroccidental “Lisandro Alvarado” (UCLA). Su periodicidad es cuatrimestral y se publica en los meses de enero, mayo y septiembre. Cada trabajo es revisado por al menos dos especialistas en el área, externos a la revista, de cuya opinión depende la aceptación definitiva. Se utiliza sistema de arbitraje doble ciego. La revista va dirigida, fundamental pero no exclusivamente, a profesionales y técnicos del área agrícola. Su objetivo es publicar trabajos científicos originales e inéditos en ciencias agrícolas que enfoquen aspectos de agronomía, botánica y propagación de plantas, entomología y zoología, suelos, fitopatología y protección vegetal, ingeniería agrícola, genética y mejoramiento de plantas, ecología, procesamiento de productos agrícolas, biotecnología y sociales. También pueden ser publicados artículos cortos en los que se presenten descubrimientos científicos, desarrollos tecnológicos y resultados de diagnósticos integrales, en la modalidad de Notas Técnicas. En Venezuela, se encuentra en las bibliotecas de todas las universidades e institutos de educación superior que ofrecen carreras agronómicas, así como de los entes oficiales de investigación agropecuaria. En el exterior, la revista llega a universidades y/o institutos de investigación agrícolas de todos los países de América Latina así como Estados Unidos, Canadá y España.