A fast right ventricle segmentation in cine-MRI from a dense hough representation

Q4 Physics and Astronomy
Fabio Martínez Carrillo, Alejandra Moreno Tarazona, Luis Carlos Guayacán Chaparro, L. B. Bautista Rozo, Jean Pico
{"title":"A fast right ventricle segmentation in cine-MRI from a dense hough representation","authors":"Fabio Martínez Carrillo, Alejandra Moreno Tarazona, Luis Carlos Guayacán Chaparro, L. B. Bautista Rozo, Jean Pico","doi":"10.33571/rpolitec.v18n35a6","DOIUrl":null,"url":null,"abstract":"Segmentation of the right ventricle (RV) is essential for the diagnosis of multiple cardiac pathologies and conditions. However, its manual delineation is a tedious task and computational support is complex due to geometric and dynamic variability.  This work introduces a dense Hough transform and representation (HT) that allows a nonparametric characterization of the shape, encoding each voxel by its curvature and orientation. This representation is integrated into a bayesian tracking approach, which efficiently segments the RV structure throughout the cardiac cycle. The proposed approach was evaluated on a public dataset, with 16 patients, achieving a Sørensen-Dice coefficient of 0.87 and 0.92, for complete volumes and basal structures, respectively. These results evidence an adequate fit of the proposed model with respect to RV shape throughout the entire cardiac cycle. \nLa segmentación del Ventrículo Derecho (VD) es esencial para el diagnóstico de múltiples patologías y condiciones cardiacas. Sin embargo, su delineación manual es una tarea tediosa y el soporte computacional resulta complejo debido a la variabilidad geométrica y dinámica.  Este trabajo introduce una transformación y representación densa de Hough (TH) que permite una caracterización no paramétrica de la forma, codificando cada vóxel por su curvatura y orientación. Esta representación es integrada en un enfoque de seguimiento bayesiano, que logra de forma eficiente segmentar la estructura del VD, a lo largo del ciclo cardíaco. El enfoque propuesto fue evaluado en un conjunto de datos públicos, con 16 pacientes, logrando un coeficiente Sørensen-Dice de 0,87 y 0,92, para volúmenes completos y estructuras basales, respectivamente. Estos resultados evidencian una adecuada adaptación del modelo propuesto respecto a la forma del VD a lo largo de todo el ciclo cardíaco.","PeriodicalId":34134,"journal":{"name":"Revista Politecnica","volume":" ","pages":""},"PeriodicalIF":0.0000,"publicationDate":"2022-04-28","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":"0","resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":null,"PeriodicalName":"Revista Politecnica","FirstCategoryId":"1085","ListUrlMain":"https://doi.org/10.33571/rpolitec.v18n35a6","RegionNum":0,"RegionCategory":null,"ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":null,"EPubDate":"","PubModel":"","JCR":"Q4","JCRName":"Physics and Astronomy","Score":null,"Total":0}
引用次数: 0

Abstract

Segmentation of the right ventricle (RV) is essential for the diagnosis of multiple cardiac pathologies and conditions. However, its manual delineation is a tedious task and computational support is complex due to geometric and dynamic variability.  This work introduces a dense Hough transform and representation (HT) that allows a nonparametric characterization of the shape, encoding each voxel by its curvature and orientation. This representation is integrated into a bayesian tracking approach, which efficiently segments the RV structure throughout the cardiac cycle. The proposed approach was evaluated on a public dataset, with 16 patients, achieving a Sørensen-Dice coefficient of 0.87 and 0.92, for complete volumes and basal structures, respectively. These results evidence an adequate fit of the proposed model with respect to RV shape throughout the entire cardiac cycle. La segmentación del Ventrículo Derecho (VD) es esencial para el diagnóstico de múltiples patologías y condiciones cardiacas. Sin embargo, su delineación manual es una tarea tediosa y el soporte computacional resulta complejo debido a la variabilidad geométrica y dinámica.  Este trabajo introduce una transformación y representación densa de Hough (TH) que permite una caracterización no paramétrica de la forma, codificando cada vóxel por su curvatura y orientación. Esta representación es integrada en un enfoque de seguimiento bayesiano, que logra de forma eficiente segmentar la estructura del VD, a lo largo del ciclo cardíaco. El enfoque propuesto fue evaluado en un conjunto de datos públicos, con 16 pacientes, logrando un coeficiente Sørensen-Dice de 0,87 y 0,92, para volúmenes completos y estructuras basales, respectivamente. Estos resultados evidencian una adecuada adaptación del modelo propuesto respecto a la forma del VD a lo largo de todo el ciclo cardíaco.
基于密集霍夫表示的电影- mri右心室快速分割
右心室(RV)的分割是必要的诊断多种心脏病理和条件。然而,由于几何和动态的变化,手工绘制是一项繁琐的任务,计算支持也很复杂。这项工作引入了密集霍夫变换和表示(HT),允许形状的非参数表征,通过其曲率和方向编码每个体素。这种表示被集成到贝叶斯跟踪方法中,该方法有效地分割了整个心脏周期的RV结构。该方法在16例患者的公共数据集上进行了评估,完整体积和基础结构的Sørensen-Dice系数分别为0.87和0.92。这些结果证明了所提出的模型在整个心脏周期内对RV形状的充分拟合。La segmentación del Ventrículo Derecho (VD)是必要的para el diagnóstico de múltiples patologías y condition cardiacas。2008年1月,su delineación手册通过对复杂的debido和可变的geomacimica dinámica的计算结果进行了分析。Este trabajo将引入untransformación y representación Hough密度(TH) que permit uncaracterización no paramactrica de la forma, codificando cada vóxel por su curatura y orientación。Esta representación es integrada en enfoque de seguimiiento bayesian, que loga de forma efficient segment la structura del VD, a lo large del ciclo cardíaco。El enfoque提出了一种新的评价方法,即对数据进行综合评价públicos,对数据进行综合评价,对数据进行综合评价,对数据进行综合评价,对数据进行综合评价,对数据进行综合评价。Estos resulttados evidence is una adecuada adaptación del modelo关于一个la forma del de de de de ciclo cardíaco的建议。
本文章由计算机程序翻译,如有差异,请以英文原文为准。
求助全文
约1分钟内获得全文 求助全文
来源期刊
Revista Politecnica
Revista Politecnica Chemistry-Chemistry (miscellaneous)
CiteScore
0.40
自引率
0.00%
发文量
22
审稿时长
24 weeks
×
引用
GB/T 7714-2015
复制
MLA
复制
APA
复制
导出至
BibTeX EndNote RefMan NoteFirst NoteExpress
×
提示
您的信息不完整,为了账户安全,请先补充。
现在去补充
×
提示
您因"违规操作"
具体请查看互助需知
我知道了
×
提示
确定
请完成安全验证×
copy
已复制链接
快去分享给好友吧!
我知道了
右上角分享
点击右上角分享
0
联系我们:info@booksci.cn Book学术提供免费学术资源搜索服务,方便国内外学者检索中英文文献。致力于提供最便捷和优质的服务体验。 Copyright © 2023 布克学术 All rights reserved.
京ICP备2023020795号-1
ghs 京公网安备 11010802042870号
Book学术文献互助
Book学术文献互助群
群 号:604180095
Book学术官方微信
小红书