Molecular identification of formae specialis and racial identity in Iranian strains of Fusarium oxysporum f. sp. lycopersici: detection of avirulence genes

Q3 Agricultural and Biological Sciences

Journal of Crop Protection Pub Date : 2017-04-07 DOI:10.18869/MODARES.JCP.6.1.67

E. Rabiei-Motlagh, H. Rouhani, F. Shokouhifar, M. Rastegar, Parissa Taher

{"title":"Molecular identification of formae specialis and racial identity in Iranian strains of Fusarium oxysporum f. sp. lycopersici: detection of avirulence genes","authors":"E. Rabiei-Motlagh, H. Rouhani, F. Shokouhifar, M. Rastegar, Parissa Taher","doi":"10.18869/MODARES.JCP.6.1.67","DOIUrl":null,"url":null,"abstract":"قارچ Fusarium oxysporum f. sp. lycopersici (Fol) عامل پژمردگی آوندی و یکی از مهم ترین عوامل بیماری زای گیاهی در ایران است. تاکنون چهار ژن مقاومت تک ژنی در گوجه فرنگی شناسایی شده اند که در تعیین نژاد این بیمارگر به کار گرفته می شوند. در مقابل ژن های غیربیماری-زایی Avr1، Avr2و Avr3 در نژادهای FOL شناسایی شده اند که در این بین Avr2 فقط در فرم اختصاصی FOL حضور دارد. از این رو سه ژن فوق می توانند نشانگرهای مناسبی جهت تشخیص فرم تخصصی و هویت نژادی در این عامل بیماری زا باشند. این فرضیه در جدایه هایی از کشورهای مختلف مورد بررسی قرار گرفته، ولیکن تاکنون در جدایه های ایرانی بررسی نشده است. هم چنین مطالعات قبلی نشان داده اند که یک جهش نقطه ای در Avr3 می تواند سبب افزایش توان بیماری زایی FOL در ارقام حساس گوجه فرنگی گردد. در این تحقیق به منظور شناسایی فرم تخصصی و هویت نژادی، ژن های Avr در مجموعه ای از جدایه های ایرانی مورد مطالعه قرار گرفت. نتایج حاصل نشان داد که این روش سنجش ملکولی در تفکیک جدایه های غیربیماری زا از جدایه های بیماری زا با توان بیماری زایی پایین بسیار موثر است. هم چنین براساس نتایج حاصل اکثر جدایه های مورد بررسی دارای ژنوتیپ غیربیماری زایی مشابه با نژاد یک بودند. علاوه براین به منظور بررسی این نکته که آیا تنوع آللی در Avr3 می تواند جدایه هایی با توان بیماری زایی مختلف را از یک دیگر تفکیک نماید، ژن فوق در جدایه هایی با توان بیماری زایی بالا و پایین تعیین توالی گردید. نتایج حاصل نشان داد که در جدایه-های ایرانی ارتباطی میان توان بیماری زایی آن ها و تنوع آللی در Avr3 وجود ندارد.","PeriodicalId":15396,"journal":{"name":"Journal of Crop Protection","volume":null,"pages":null},"PeriodicalIF":0.0000,"publicationDate":"2017-04-07","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":"0","resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":null,"PeriodicalName":"Journal of Crop Protection","FirstCategoryId":"1085","ListUrlMain":"https://doi.org/10.18869/MODARES.JCP.6.1.67","RegionNum":0,"RegionCategory":null,"ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":null,"EPubDate":"","PubModel":"","JCR":"Q3","JCRName":"Agricultural and Biological Sciences","Score":null,"Total":0}

引用次数: 0

Abstract

قارچ Fusarium oxysporum f. sp. lycopersici (Fol) عامل پژمردگی آوندی و یکی از مهم ترین عوامل بیماری زای گیاهی در ایران است. تاکنون چهار ژن مقاومت تک ژنی در گوجه فرنگی شناسایی شده اند که در تعیین نژاد این بیمارگر به کار گرفته می شوند. در مقابل ژن های غیربیماری-زایی Avr1، Avr2و Avr3 در نژادهای FOL شناسایی شده اند که در این بین Avr2 فقط در فرم اختصاصی FOL حضور دارد. از این رو سه ژن فوق می توانند نشانگرهای مناسبی جهت تشخیص فرم تخصصی و هویت نژادی در این عامل بیماری زا باشند. این فرضیه در جدایه هایی از کشورهای مختلف مورد بررسی قرار گرفته، ولیکن تاکنون در جدایه های ایرانی بررسی نشده است. هم چنین مطالعات قبلی نشان داده اند که یک جهش نقطه ای در Avr3 می تواند سبب افزایش توان بیماری زایی FOL در ارقام حساس گوجه فرنگی گردد. در این تحقیق به منظور شناسایی فرم تخصصی و هویت نژادی، ژن های Avr در مجموعه ای از جدایه های ایرانی مورد مطالعه قرار گرفت. نتایج حاصل نشان داد که این روش سنجش ملکولی در تفکیک جدایه های غیربیماری زا از جدایه های بیماری زا با توان بیماری زایی پایین بسیار موثر است. هم چنین براساس نتایج حاصل اکثر جدایه های مورد بررسی دارای ژنوتیپ غیربیماری زایی مشابه با نژاد یک بودند. علاوه براین به منظور بررسی این نکته که آیا تنوع آللی در Avr3 می تواند جدایه هایی با توان بیماری زایی مختلف را از یک دیگر تفکیک نماید، ژن فوق در جدایه هایی با توان بیماری زایی بالا و پایین تعیین توالی گردید. نتایج حاصل نشان داد که در جدایه-های ایرانی ارتباطی میان توان بیماری زایی آن ها و تنوع آللی در Avr3 وجود ندارد.

查看原文本刊更多论文

伊朗番茄尖孢镰刀菌特殊菌种的分子鉴定和种族鉴定:无毒基因的检测

尖孢镰刀菌（Fusarium oxysporum f.sp.lycopersici，Fol）是伊朗一种重要的植物病害。到目前为止，已经在用于定义该患者种族的肥料中鉴定出四个抗性基因。Avr1、Avr2和Avr3在FOL种族中被识别，仅以Avr2之间的FOL特殊形式存在。这三个基因可以成为识别疾病具体形式和特征的正确指标。این；阿拉伯语یکنتاڪ。先前的研究表明，由于FOL开发鸡肉传感器的能力增加，Avr3中的一个点可以增加。在这项研究中，Avr基因已经在伊朗的一系列分支中进行了研究。结果表明，这种分子标度方法在具有繁殖能力的传染病的鉴别中是非常有效的。因此，非传染性基因型的大多数分析差异与第一种族相似。此外，重点是，如果Avr3的过敏性降解可以反映出各种传染病能力的差异，那么该基因就被定义为降解的上下水平。结果表明，伊朗的分离与Avr3中世界的进化之间没有联系。

本文章由计算机程序翻译，如有差异，请以英文原文为准。

求助全文

约1分钟内获得全文求助全文

来源期刊

Journal of Crop Protection Agricultural and Biological Sciences-Agronomy and Crop Science

CiteScore

1.20

自引率

0.00%

发文量

审稿时长

10 weeks

期刊介绍： Journal of Crop Protection is one of the TMU Press journals that is published by the responsibility of its Editor-in-Chief and Editorial Board in the determined scopes. Journal of Crop Protection (JCP) is an international peer-reviewed research journal published quarterly for the purpose of advancing the scientific studies. It covers fundamental and applied aspects of plant pathology and entomology in agriculture and natural resources. The journal will consider submissions from all over the world, on research works not being published or submitted for publication as full paper, review article and research note elsewhere. The Papers are published in English with an extra abstract in Farsi language.