Helicobacter pylori y la expresión de genes en pacientes con adenocarcinoma gástrico

Q4 Computer Science
Jhonatan Rabanal-Sanchez
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Abstract

El cáncer gástrico (CG) es uno de los canceres con mayor incidencia en el mundo. Diversos estudios han asociado la presencia de una infección crónica por Helicobacter pylori, como uno de los procesos claves en la formación, crecimiento y desarrollo de este cáncer. El adenocarcinoma gástrico es un subtipo de CG y representa alrededor del 90% de los casos reportados. Muchos estudios en pacientes con CG, han reportado la presencia de mutaciones en genes que cumplen funciones importantes en señalización celular, integridad genómica, adhesión celular, remodelación de cromatina, motilidad celular y formación del citoesqueleto. En este trabajo se analizó los datos provenientes del atlas del genoma del cáncer(TCGA), del cual se obtuvo datos de la expresión de estos genes (expresados en transcripciones por millón); se obtuvo la mediana, valor de los cuartiles y el ρ-valor de la diferencia de medianas. Se encontró que la mayor parte estaban sobreexpresados en pacientes con adenocarcinoma gástrico. Sin embargo, algunos genes presentaron una expresión similar a lo observado en condiciones no cancerosas, cuando estaba presente una infección por H. pylori; y estos mismos genes presentaron una sobreexpresión en ausencia de H. pylori. Este estudio plantea que estos resultados se deberían a la metilación del ADN producida por esta bacteria, por lo que este mecanismo inhibiría la expresión de estos genes.
胃腺癌患者幽门螺杆菌与基因表达
胃癌(gc)是世界上发病率最高的癌症之一。一些研究已经将慢性幽门螺杆菌感染的存在与这种癌症形成、生长和发展的关键过程联系起来。胃腺癌是胃腺癌的一个亚型,约占报告病例的90%。许多对CG患者的研究报道了在细胞信号、基因组完整性、细胞粘附、染色质重塑、细胞运动和细胞骨架形成中发挥重要作用的基因突变的存在。在本研究中,我们分析了来自癌症基因组图谱(TCGA)的数据,获得了这些基因表达的数据(以百万分之一的转录本表达);在本研究中,我们评估了两种不同的方法,一种是通过比较两种方法的平均值,另一种是通过比较两种方法的平均值。其中大部分在胃腺癌患者中被发现过表达。然而,当幽门螺杆菌感染存在时,一些基因的表达与在非癌变条件下观察到的相似;在没有幽门螺杆菌的情况下,这些基因也表现出过表达。这项研究表明,这些结果是由于这种细菌产生的dna甲基化,因此这种机制会抑制这些基因的表达。
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