Comparison of 12 DNA extraction kits for vertebrate samples

IF 1 4区环境科学与生态学 Q3 BIODIVERSITY CONSERVATION

Animal Biodiversity and Conservation Pub Date : 2020-06-01 DOI:10.32800/abc.2020.43.0067

I. Martincová, Tatiana Aghová

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Abstract

espanolObtener extracciones de ADN de buena calidad es un paso crucial para los proyectos de investigacion del ambito de la biologia molecular. En la actualidad, existen numerosos protocolos para la extraccion en tejidos de vertebrados. En el presente estudio comparamos 11 protocolos de extraccion por columnas y un protocolo HotSHOT utilizando condiciones parecidas (como el tipo de muestra o el peso del material inicial). Evaluamos el tiempo de extraccion, la calidad y la cantidad de ADN obtenido y el precio de la extraccion de una unica muestra. Segun nuestro analisis, los kits que dieron mejores resultados para producir ADN con la mayor concentracion y pureza son JetQuick® Genomic DNA Purification Kit (Genomed) y el NucleoSpin® Tissue (Macherey–Nagel). No obstante, se recomienda encarecidamente probar varios kits de extraccion con muestras especificas para encontrar el que sea mejor en cuanto al tiempo, la calidad y el costo en relacion con un proyecto concreto. EnglishObtaining high quality DNA extractions is a crucial step for molecular biology research projects. At present, numerous protocols are available for vertebrate tissue extractions. In the present study we compared eleven column–based protocols and one HotSHOT protocol using similar conditions (i.e., type of sample, weight of starting material). We evaluated time of extraction, quality and quantity of DNA yield, and price of extraction for a single sample. Based on our analysis, the most successful kits for producing DNA with the highest concentration and purity are the JetQuick® Genomic DNA Purification Kit (Genomed) and the NucleoSpin® Tissue (Macherey–Nagel). Nevertheless, it is highly recom-mended to test various extraction kits with specific samples to find the optimal kit in all aspects of time, quality and cost for a particular project

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12种脊椎动物样本DNA提取试剂盒的比较

高质量的dna提取是分子生物学领域研究项目的关键一步。目前，有许多从脊椎动物组织中提取的方案。在本研究中，我们比较了11个柱提取方案和使用相似条件(如样品类型或初始材料重量)的热拍摄方案。我们评估提取时间，获得的dna的质量和数量，以及提取单个样本的价格。根据我们的分析，JetQuick®基因组DNA纯化试剂盒(Genomed)和NucleoSpin®组织(Macherey - Nagel)是生产浓度和纯度最高的DNA的最佳试剂盒。然而，强烈建议用特定的样品测试几个提取套件，以找到与特定项目相关的时间、质量和成本最好的一个。EnglishObtaining high quality extractions是关键的DNA step for分子生物学research projects。目前，脊椎组织提取有许多方案可用。在本研究中，我们比较了基于11列的协议和使用类似条件(即样品类型、起始材料的重量)的一个热射协议。我们对单个样本的提取时间、DNA产量的质量和数量以及提取价格进行了评估。根据我们的分析，生产具有最高浓度和纯度的DNA最成功的试剂盒是JetQuick®基因组DNA纯化试剂盒(Genomed)和NucleoSpin®组织(Macherey - Nagel)。不过，强烈建议使用特定样品测试各种提取试剂盒，以便在时间、质量和成本方面为特定项目找到最佳试剂盒。

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Animal Biodiversity and Conservation 农林科学-动物学

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期刊介绍： Animal Biodiversity and Conservation (antes Miscel·lània Zoològica) es una revista interdisciplinar, publicada desde 1958 por el Museu de Ciències Naturals de Barcelona. Incluye artículos de investigación empírica y teórica en todas las áreas de la zoología (sistemática, taxonomía, morfología, biogeografía, ecología, etología, fisiología y genética) procedentes de todas las regiones del mundo. La revista presta especial interés a los estudios que planteen un problema nuevo o introduzcan un tema nuevo, con hipòtesis y prediccions claras, y a los trabajos que de una manera u otra tengan relevancia en la biología de la conservación. No se publicaran artículos puramente descriptivos, o artículos faunísticos o corológicos en los que se describa la distribución en el espacio o en el tiempo de los organismes zoológicos.