中国儿童非唐氏综合征急性巨核细胞白血病临床相关基因组图谱

急性巨核母细胞白血病（AMKL）占新诊断的儿童急性髓性白血病（AML）[1]的4%-15%。儿童AMKL包含两种主要亚型：与唐氏综合征相关的AMKL （DS-AMKL）和独立于唐氏综合征发生的AMKL（非DS-AMKL）。与主要由21三体和GATA1突变驱动的DS-AMKL不同，非DS-AMKL具有更大的基因组异质性和更差的临床结果[2,3]。新一代测序研究已经确定了非ds - amkl的关键致癌驱动因素，包括RBM15::MKL1、CBFA2T3::GLIS2、NUP98::KDM5A和KMT2A重排[4,5,6]。尽管如此，20%的非ds - amkl病例的遗传基础仍然未知，这对推进精准医学和开发有效的靶向治疗提出了重大挑战。我们对中国儿童非ds - amkl进行了全面的转录组学分析。我们于2009年11月至2022年10月在上海儿童医疗中心（SCMC）招募了117例非ds - amkl患者（补充表1）。中国儿童非ds - amkl病例的临床特征与非amkl儿童AML病例非常相似（补充表2）[7]，但中位年龄明显较年轻（1.3 vs. 6.5岁，p < 0.001， Fisher精确检验）。对来自该队列的58个诊断样本进行转录组测序（RNA-seq），并与我们之前发表的RNA-seq图谱整合。最后，我们分析了100例儿童非ds - amkl病例的转录组学数据（补充表3）。