Development of a Microvessel Density Gene Signature and Its Application in Precision Medicine.
IF 2
Q3 ONCOLOGY
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Abstract
Significance: A novel gene signature for MVD was developed. This MVD gene score enables the estimation of MVD, reflecting the sensitivity to antiangiogenic inhibitors, in transcriptomic datasets. We demonstrated the utility of the MVD gene score together with a T cell-inflamed gene signature for potential future use as a clinical biomarker.
微血管密度基因标记的研制及其在精准医学中的应用。
抗血管生成药物和免疫检查点抑制剂联合治疗已显示出增强的临床活性，并已被批准用于治疗多种肿瘤类型。尽管进行了广泛的研究，但对联合治疗的预测性生物标志物仍然知之甚少。微血管密度（MVD）是免疫组织化学（IHC）测量异常血管生成的替代标志物，与抗血管生成抑制剂单药治疗的反应有关。然而，获得足够质量的肿瘤组织进行免疫组化分析并不总是可行的，而且基于免疫组化的MVD测量在大型公共数据集中是不可用的。在这项研究中，我们建立了一个基于rna测序数据的MVD基因评分，通过使用RNA-seq和IHC测量的MVD在12个小鼠同基因肿瘤模型中反映MVD。我们在小鼠和人类肿瘤数据集中探索了MVD基因评分和预测抗pd -1治疗反应的基因标记之间的关系。MVD基因评分与lenvatinib（一种主要靶向vegfr和fgfr的多重酪氨酸激酶抑制剂）在小鼠肿瘤模型中的抗肿瘤活性以及IHC在市买的人福尔马林固定石蜡包埋肿瘤样品中测量的MVD相关。肿瘤基因组图谱中的肿瘤类型根据MVD基因评分和t细胞炎症基因表达谱（TcellinfGEP）分为四个亚组，这些亚组与临床治疗指征相关。总之，新开发的MVD基因评分可以在无法获得IHC数据的大型公共数据集中估计MVD，并且与TcellinfGEP一起具有潜在的临床应用价值，可以用于精确医学表征患者的肿瘤。
本文章由计算机程序翻译，如有差异，请以英文原文为准。
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