Avaliação in silico do perfil de expressão gênica do sindecam-4 nos diferentes subtipos de tumores de mama

C. Melo, Laura Romanholi de Oliveira Pereira, Ariane Carolina Ferreira, M. Silva, Maria Aparecida da Silva Pinhal
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Abstract

Introdução: O câncer de mama corresponde a uma das principais causas de morte em mulheres. Os tumores luminais A e B apresentam boa resposta com tratamentos hormonais, os tumores que superexpressam HER-2 podem ser tratados com anticorpos monoclonais, já os tumores triplo-negativos apresentam poucos tratamentos disponíveis por apresentarem expressão baixa ou ausente dos receptores hormonais e HER-2, além de pior progressão tumoral. Os sindecans são proteoglicanos de heparam sulfato que tem função de interagir com fatores de crescimento, citocinas e matriz extracelular, modulando assim processos importantes na progressão tumoral. Objetivo: Analisar a expressão o sindecam-4 nos diferentes subtipos de tumores de mama. Métodos: A bioinformática vem se mostrando útil para estudo de novos biomarcadores. No presente estudo, foi analisado o banco de dados TCGA (514 pacientes) e Metabric (1898 pacientes) utilizando o software cBioportal. Foram analisados os dados de expressão gênica por RNA-Seq e Microarray. Resultados: Foi verificada alteração de expressão gênica do sindecam-4 entre os diferentes subtipos de tumores de mama. Pacientes com tumor triplo-negativo tiveram a expressão diminuída para sindecam-4 em ambos os bancos de dados. Conclusão: Foi verificado que sindecam-4 parece ser um potencial biomarcador em tumores de mama, a expressão diminuída de sindecam-4 parece estar relacionada a um pior prognóstico.
不同乳腺肿瘤亚型中syndecam-4基因表达谱的硅学评估
导言:乳腺癌是导致女性死亡的主要原因之一。A型和B型发光体肿瘤对激素治疗反应良好,HER-2过度表达的肿瘤可以用单克隆抗体治疗,而三阴性肿瘤由于激素受体和HER-2表达量低或不表达,以及肿瘤进展较慢,几乎没有治疗方法。蛋白多糖是硫酸肝素蛋白多糖,可与生长因子、细胞因子和细胞外基质相互作用,从而调节肿瘤进展的重要过程。目的:分析不同亚型乳腺肿瘤中辛迪加-4 的表达情况。方法:生物信息学已被证明有助于研究新的生物标记物。本研究使用 cBioportal 软件分析了 TCGA(514 例患者)和 Metabric(1898 例患者)数据库。使用 RNA-Seq 和芯片分析了基因表达数据。结果:在不同的乳腺肿瘤亚型之间发现了syndecam-4基因表达的变化。在两个数据库中,三阴性肿瘤患者的syndecam-4基因表达量都有所下降。结论:研究发现,syndecam-4似乎是乳腺肿瘤的潜在生物标记物,syndecam-4表达的减少似乎与预后较差有关。
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