Identificação de metabólitos no plasma e urina com potencial uso como biomarcadores para o monitoramento dos efeitos adversos dos AINEs em gatos via aprendizado de máquina

Cecilia Aparecida Santos Silva, D. Ferreira, Marcos Ferrante, Nicolas Villarino
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Abstract

Os anti-inflamatórios não esteróides (AINEs), como o meloxicam, podem ser usados para melhorar a dor crônica e, ao mesmo tempo, ajudar a reduzir o uso de opióides. No entanto, a administração crônica desses medicamentos pode causar danos gastrointestinais e renais em alguns pacientes, limitando as opções terapêuticas desses pacientes que necessitam de controle da dor e da inflamação. A fim de discriminar animais que receberam AINEs de animais saudáveis (controle) e determinar em qual estágio estão os efetivos dos AINEs no organismo do paciente, foram desenvolvidos 2 modelos, um k-nearest neighbors algorithm (KNN) e um Gaussian Naive Bayes algorithm (NB). A base de dados usada é composta por um grupo de 6 gatos saudáveis e um grupo de 6 gatos que foram tratados com meloxicam. Foram coletadas informações metabolômica plasmática e urinária 5 vezes durante um período de até 31 dias em ambos os grupos. A partir disso, separou-se os dados em três bases: (i) base de substâncias hidrossolúveis, composta por 114 substâncias e 6 amostras, (ii) base de substâncias lipossolúveis com 195 substâncias e 5 amostras, e (iii) base composta por todas as substâncias analisadas com 5 amostras. Além disso, cada base de dados possui 5 classes, uma para cada vez em que as substâncias foram coletadas e medidas. Foi utilizado o Fisher's Discriminant Ratio (FDR), com a finalidade de ranquear as substâncias que mais se alteraram de uma classe para a outra. Apesar da baixa quantidade de amostras e da necessidade de se usar a menor quantidade de substâncias possíveis, resultados satisfatórios foram alcançados.
通过机器学习识别血浆和尿液中可能用作监测猫体内非甾体抗炎药不良反应的生物标记物的代谢物
美洛昔康等非甾体抗炎药(NSAIDs)可用于改善慢性疼痛,同时有助于减少阿片类药物的使用。然而,长期服用这些药物会对一些患者造成胃肠道和肾脏损伤,从而限制了这些需要控制疼痛和炎症的患者的治疗选择。为了将服用过非甾体抗炎药的动物与健康(对照)动物区分开来,并确定非甾体抗炎药在患者体内的效力处于哪个阶段,我们开发了两个模型:k-近邻算法(KNN)和高斯直觉贝叶斯算法(NB)。使用的数据库包括一组 6 只健康猫和一组 6 只接受美洛昔康治疗的猫。在长达 31 天的时间里,对两组猫进行了 5 次血浆和尿液代谢组学信息采集。然后将数据分成三个数据库:(i) 水溶性物质数据库,包括 114 种物质和 6 个样本;(ii) 脂溶性物质数据库,包括 195 种物质和 5 个样本;(iii) 所有分析物质数据库,包括 5 个样本。此外,每个数据库都有 5 个类别,每次采集和测量物质都有一个类别。使用费雪判别率(FDR)对从一个类别到下一个类别变化最大的物质进行排序。尽管样本数量较少,而且需要使用尽可能少的物质,但还是取得了令人满意的结果。
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