In silico analysis of miRNA target genes possibly induced by tuberculosis infection

IF 0.7 4区农林科学 Q3 AGRICULTURE, DAIRY & ANIMAL SCIENCE

Revista Mexicana de Ciencias Pecuarias Pub Date : 2024-01-19 DOI:10.22319/rmcp.v15i1.6463

Elba Rodríguez-Hernández, L. Quintas-Granados, Feliciano Milian Suazo, Ana María Anaya Escalera

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Abstract

El objetivo fue identificar mediante análisis in silico los genes a los cuales se unen los miR-146a, miR-146b y miR-155 y, analizar las rutas metabólicas en las que intervienen durante la infección con tuberculosis. Para el análisis se utilizó: miRBase, UniProtKB, TargetScan Human, miRDB y miRTarBase. El miR-146a interacciona o se une a genes importantes en la adhesión celular y el proceso de fagocitosis (CLDN16 y ATP6V1C2, respectivamente) (P, 0.05), esta interacción podría tener implicaciones importantes en la patogénesis de la tuberculosis o enfermedades relacionadas. Los resultados de este trabajo sugieren que la activación de mecanismos moleculares específicos en respuesta a la tuberculosis está regulada por los miR-146a, miR-146b y miR-155. Los genes con los cuales los miR-146a y miR-155 interaccionan o se unen, están involucrados en la respuesta inmune y en procesos celulares imprescindibles durante una infección por tuberculosis.

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对结核病感染可能诱导的 miRNA 靶基因进行硅学分析

目的是通过硅分析确定 miR-146a、miR-146b 和 miR-155 与之结合的基因，并分析它们在结核病感染过程中参与的代谢途径。分析中使用的数据库包括：miRBase、UniProtKB、TargetScan Human、miRDB 和 miRTarBase。miR-146a 与细胞粘附和吞噬过程中的重要基因（分别为 CLDN16 和 ATP6V1C2）相互作用或结合（P，0.05），这种相互作用可能对结核病或相关疾病的发病机制有重要影响。这项工作的结果表明，结核病特定分子机制的激活受 miR-146a、miR-146b 和 miR-155 的调控。与 miR-146a 和 miR-155 相互作用或结合的基因参与了免疫反应和结核病感染过程中必不可少的细胞过程。

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期刊介绍： The MEXICAN MAGAZINE OF SCIENCES PECUARIAS is an organ of scientific and technical diffusion of the livestock sector. Its periodicity is quarterly and arbitrated by pairs in the double-blind mode. Its objective is to make known the results of the research carried out by any scientific institution, in Mexico and in any part of the world, related to the livestock sciences, particularly those that refer to the different disciplines of Veterinary Medicine and Animal Science. The Journal is bilingual, publishes the complete articles in Spanish or English and is included in various indexing services and international dissemination platforms, such as the Index of Mexican Journals of Scientific and Technological Research of the National Council of Science and Technology (CONACYT); In the EBSCO Host database; In the Network of Scientific Journals of Latin America and the Caribbean, Spain and Portugal (RedALyC); In the Ibero-American Network of Scientific Journals of Free Access Veterinary Medicine. Indexed in the ISI Journal Citation Report Science Edition; And Elsevier''s SCOPUS and EMBASE indices.