Про мінімальну модель кінетичної кооперативності. Випадок глюкокінази

IF 0.6 Q4 PHYSICS, MULTIDISCIPLINARY

Ukrainian Journal of Physics Pub Date : 2023-11-29 DOI:10.15407/ujpe68.10.684

L.N. Christophorov

{"title":"Про мінімальну модель кінетичної кооперативності. Випадок глюкокінази","authors":"L.N. Christophorov","doi":"10.15407/ujpe68.10.684","DOIUrl":null,"url":null,"abstract":"Детально розглянуто тристанову мiнiмальну схему кiнетичної кооперативностi мономерних ферментiв. Встановлено строгi критерiї позитивної кооперативностi та її сигмоїдної версiї в термiнах параметрiв системи (констант швидкостей). Показано, що ступiнь кооперативностi особливо чутливий до швидкостей та напряму обмiну мiж конформацiйними станами вiльного ферменту. Проте нiякої необхiдностi “кiнетичного резонансу” (i тим бiльше, його загальностi), заявленої нещодавно для посилення кооперативностi, виявлено не було. Загалом, хоча мiнiмальна тристанова модель добре слугує для якiсного розумiння природи кiнетичної кооперативностi, вона навряд чи придатна для кiлькiсного опису реакцiй реальних ферментiв, що показано у випадку глюкокiнази.","PeriodicalId":23400,"journal":{"name":"Ukrainian Journal of Physics","volume":"19 1","pages":""},"PeriodicalIF":0.6000,"publicationDate":"2023-11-29","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":"0","resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":null,"PeriodicalName":"Ukrainian Journal of Physics","FirstCategoryId":"1085","ListUrlMain":"https://doi.org/10.15407/ujpe68.10.684","RegionNum":0,"RegionCategory":null,"ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":null,"EPubDate":"","PubModel":"","JCR":"Q4","JCRName":"PHYSICS, MULTIDISCIPLINARY","Score":null,"Total":0}

引用次数: 0

Abstract

Детально розглянуто тристанову мiнiмальну схему кiнетичної кооперативностi мономерних ферментiв. Встановлено строгi критерiї позитивної кооперативностi та її сигмоїдної версiї в термiнах параметрiв системи (констант швидкостей). Показано, що ступiнь кооперативностi особливо чутливий до швидкостей та напряму обмiну мiж конформацiйними станами вiльного ферменту. Проте нiякої необхiдностi “кiнетичного резонансу” (i тим бiльше, його загальностi), заявленої нещодавно для посилення кооперативностi, виявлено не було. Загалом, хоча мiнiмальна тристанова модель добре слугує для якiсного розумiння природи кiнетичної кооперативностi, вона навряд чи придатна для кiлькiсного опису реакцiй реальних ферментiв, що показано у випадку глюкокiнази.

查看原文本刊更多论文

关于动力学合作的最小模型。葡萄糖激酶的案例

详细研究了单体酶的三态最小动力学合作方案。根据系统参数（速率常数）确定了正合作性的严格标准及其西格玛版本。研究表明，合作程度对自由酶构象状态之间的交换速率和方向特别敏感。然而，研究发现不需要 "动力学共振"（更不需要其普遍性），而最近有人声称 "动力学共振 "可提高合作性。一般来说，尽管最小三态模型能很好地定性理解动力学合作性的本质，但它很难适用于定量描述实际酶的反应，葡萄糖激酶的情况就表明了这一点。

本文章由计算机程序翻译，如有差异，请以英文原文为准。

求助全文

约1分钟内获得全文求助全文

来源期刊

Ukrainian Journal of Physics PHYSICS, MULTIDISCIPLINARY-

CiteScore

1.20

自引率

20.00%

发文量

244

期刊介绍： Ukrainian Journal of Physics is the general physics edition of the Department of Physics and Astronomy of the National Academy of Sciences of Ukraine. The journal publishes original papers and reviews in the fields of experimental and theoretical physics.