Gıda, yem ve tohumda multipleks GDO tarama testi geliştirilmesi ve validasyon çalışmaları

Gıda ve Yem Bilimi Teknolojisi Dergisi Pub Date : 2023-10-06 DOI:10.56833/gidaveyem.1386888

Nihal AKMAN, Adnan Fatih DAĞDELEN

{"title":"Gıda, yem ve tohumda multipleks GDO tarama testi geliştirilmesi ve validasyon çalışmaları","authors":"Nihal AKMAN, Adnan Fatih DAĞDELEN","doi":"10.56833/gidaveyem.1386888","DOIUrl":null,"url":null,"abstract":"Giriş: Genetik Modifiye Organizmaların (GDO) kontrol analizlerinin ilk aşamasında GDO tarama analizi yer almaktadır. GDO’lu ürünlerin %90’ından fazlasında genetik modifikasyonu gösteren bölgeler; 35S promotor, NOS terminator ve FMV promotor bölgeleridir. Ticari kitler de genel olarak bu bölgeleri taramak için üretilmiştir. Bu bölgeler tarandığında daha az ileri analize ihtiyaç duyulmaktadır. Ticari kitler kullanım kolaylığı sağlaması nedeni ile tercih edilmekte ancak analiz maliyetini artırmaktadır. Bu çalışmada multipleks test materyalinin laboratuvar içi metot olarak hazırlanması ile maliyetin düşürülmesi amaçlanmıştır.  Materyal ve yöntem: Çalışmada ilk etapta bileşenler uygun oranlarda karıştırılarak GDO tarama testi hazırlanmıştır. Bu tarama testi ile daha sonra sertifikalı referans madde (CRM), gıda ve yem matrikslerinde validasyon çalışmaları gerçekleştirilmiştir. Tartışma ve sonuç: Planlanan bu çalışma sonucunda LOD (tespit limiti) seviyesi 10 DNA kopyası olan hassas ve analiz maliyeti ticari kite oranla daha düşük multipleks GDO tarama testi geliştirilmiştir. Bu testin yanlış negatiflik ve yanlış pozitiflik oranları %0 bulunmuştur. Asimetrik LOD sonucu tüm bölgeler için 10 kopya/10000 kopya olmuştur. Şartlardaki küçük değişiklikler ile 30 DNA kopyasının pozitif sonuç vermesi bu tarama testinin sağlamlık kriterine uygun olduğunu göstermiştir.","PeriodicalId":227202,"journal":{"name":"Gıda ve Yem Bilimi Teknolojisi Dergisi","volume":"53 1","pages":"0"},"PeriodicalIF":0.0000,"publicationDate":"2023-10-06","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":"0","resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":null,"PeriodicalName":"Gıda ve Yem Bilimi Teknolojisi Dergisi","FirstCategoryId":"1085","ListUrlMain":"https://doi.org/10.56833/gidaveyem.1386888","RegionNum":0,"RegionCategory":null,"ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":null,"EPubDate":"","PubModel":"","JCR":"","JCRName":"","Score":null,"Total":0}

引用次数: 0

Abstract

Giriş: Genetik Modifiye Organizmaların (GDO) kontrol analizlerinin ilk aşamasında GDO tarama analizi yer almaktadır. GDO’lu ürünlerin %90’ından fazlasında genetik modifikasyonu gösteren bölgeler; 35S promotor, NOS terminator ve FMV promotor bölgeleridir. Ticari kitler de genel olarak bu bölgeleri taramak için üretilmiştir. Bu bölgeler tarandığında daha az ileri analize ihtiyaç duyulmaktadır. Ticari kitler kullanım kolaylığı sağlaması nedeni ile tercih edilmekte ancak analiz maliyetini artırmaktadır. Bu çalışmada multipleks test materyalinin laboratuvar içi metot olarak hazırlanması ile maliyetin düşürülmesi amaçlanmıştır. Materyal ve yöntem: Çalışmada ilk etapta bileşenler uygun oranlarda karıştırılarak GDO tarama testi hazırlanmıştır. Bu tarama testi ile daha sonra sertifikalı referans madde (CRM), gıda ve yem matrikslerinde validasyon çalışmaları gerçekleştirilmiştir. Tartışma ve sonuç: Planlanan bu çalışma sonucunda LOD (tespit limiti) seviyesi 10 DNA kopyası olan hassas ve analiz maliyeti ticari kite oranla daha düşük multipleks GDO tarama testi geliştirilmiştir. Bu testin yanlış negatiflik ve yanlış pozitiflik oranları %0 bulunmuştur. Asimetrik LOD sonucu tüm bölgeler için 10 kopya/10000 kopya olmuştur. Şartlardaki küçük değişiklikler ile 30 DNA kopyasının pozitif sonuç vermesi bu tarama testinin sağlamlık kriterine uygun olduğunu göstermiştir.

查看原文本刊更多论文

开发和验证食品、饲料和种子中的多重转基因生物筛选测试

简介：转基因生物筛选分析是转基因生物控制分析的第一步。在 90% 以上的转基因作物中，出现基因修饰的区域是 35S 启动子、NOS 终止子和 FMV 启动子区域。一般会生产商业试剂盒来筛选这些区域。筛选出这些区域后，所需的进一步分析就会减少。商业试剂盒因其使用方便而受到青睐，但却增加了分析成本。本研究旨在通过实验室内方法制备多重检测材料来降低成本。材料和方法在研究的第一阶段，以适当的比例混合各种成分，制备转基因生物筛选试验。然后在有证标准物质（CRM）、食品和饲料基质中对该筛选测试进行验证：这项计划研究的结果是，开发出了一种多重转基因生物筛查检验，其检测限（LOD）为 10 个 DNA 拷贝，与商业试剂盒相比，灵敏度高，分析成本低。该检测方法的假阴性率和假阳性率均为 0%。所有区域的非对称 LOD 结果均为 10 拷贝/10000 拷贝。在条件稍有改变的情况下，30 个 DNA 拷贝就能得到阳性结果，这表明该筛选测试符合稳健性标准。

本文章由计算机程序翻译，如有差异，请以英文原文为准。

求助全文

约1分钟内获得全文求助全文

来源期刊

Gıda ve Yem Bilimi Teknolojisi Dergisi

自引率

0.00%

发文量