Kajian Aktivitas Metabolit Andrographolide dan Turunannya Dalam Herba Sambiloto (Andrographis paniculata) Terhadap Mutasi D614G SARS-CoV-2 Protein Spike Secara In Silico

Riski Vitasari, Muhammad Isrul, Dwi Syah Fitra Ramadhan
{"title":"Kajian Aktivitas Metabolit Andrographolide dan Turunannya Dalam Herba Sambiloto (Andrographis paniculata) Terhadap Mutasi D614G SARS-CoV-2 Protein Spike Secara In Silico","authors":"Riski Vitasari, Muhammad Isrul, Dwi Syah Fitra Ramadhan","doi":"10.54883/28296850.v1i6.282","DOIUrl":null,"url":null,"abstract":"Virus korona merupakan penyakit menular berbahaya yang disebabkan oleh virus baru (SARS-CoV-2). Usaha untuk mengeksplorasi bahan-bahan alam aktif sebagai  anti-virus terus dilakukan. Salah satu tanaman lokal Indonesia yang dapat menghambat SARS-CoV-2 protein spike yaitu herba sambiloto (Andrographis paniculata) secara in silico,  akan tetapi aktivitasnya terhadap mutan D614G SARS-CoV-2 belum diketahui. Tujuan dari penelitian ini yaitu untuk mengkaji   aktivitas metabolit andrographolide dan turunannya dalam herba sambiloto (Andrographis paniculata) terhadap mutasi D614G SARS-CoV-2 protein spike secara in silico.Penelitian ini menggunakan metode in silico yaitu penambatan molekul. Penambatan  molekul  dilakukan  menggunakan  Autodock  Tools  1.5.6  dan  dianalisis interaksi ikatannya menggunakan BIOVIA Discovery Studio 2017, kemudian  diprediksi ADME menggunakan software Swiss ADME dan sofware PASS online untuk mengetahui toksisitasnya.Hasil penelitian menunjukkan bahwa diperoleh dari 23 senyawa turunan andrographolide    yang memiliki stabilitas ikatan lebih baik dari pada senyawa andrographolide yaitu senyawa 14-Acetyl-3,19-isopropylideneandrographolide yang dapat menghambat reseptor non-mutasi (6VSB)  dengan energi ikatan -5.34 kcal/mol dan  mutan D614G (7KDL) dengan energi ikatan -5.72 kcal/mol dengan hasil   prediksi ADME memenuhi   aturan   lipinski   dan   tidak   menunjukan   adanya   aktivitas    toksisitas hepatotoksik dan nefrotoksik yang bermakna.","PeriodicalId":398865,"journal":{"name":"Jurnal Pharmacia Mandala Waluya","volume":"21 1","pages":"0"},"PeriodicalIF":0.0000,"publicationDate":"2022-12-30","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":"0","resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":null,"PeriodicalName":"Jurnal Pharmacia Mandala Waluya","FirstCategoryId":"1085","ListUrlMain":"https://doi.org/10.54883/28296850.v1i6.282","RegionNum":0,"RegionCategory":null,"ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":null,"EPubDate":"","PubModel":"","JCR":"","JCRName":"","Score":null,"Total":0}
引用次数: 0

Abstract

Virus korona merupakan penyakit menular berbahaya yang disebabkan oleh virus baru (SARS-CoV-2). Usaha untuk mengeksplorasi bahan-bahan alam aktif sebagai  anti-virus terus dilakukan. Salah satu tanaman lokal Indonesia yang dapat menghambat SARS-CoV-2 protein spike yaitu herba sambiloto (Andrographis paniculata) secara in silico,  akan tetapi aktivitasnya terhadap mutan D614G SARS-CoV-2 belum diketahui. Tujuan dari penelitian ini yaitu untuk mengkaji   aktivitas metabolit andrographolide dan turunannya dalam herba sambiloto (Andrographis paniculata) terhadap mutasi D614G SARS-CoV-2 protein spike secara in silico.Penelitian ini menggunakan metode in silico yaitu penambatan molekul. Penambatan  molekul  dilakukan  menggunakan  Autodock  Tools  1.5.6  dan  dianalisis interaksi ikatannya menggunakan BIOVIA Discovery Studio 2017, kemudian  diprediksi ADME menggunakan software Swiss ADME dan sofware PASS online untuk mengetahui toksisitasnya.Hasil penelitian menunjukkan bahwa diperoleh dari 23 senyawa turunan andrographolide    yang memiliki stabilitas ikatan lebih baik dari pada senyawa andrographolide yaitu senyawa 14-Acetyl-3,19-isopropylideneandrographolide yang dapat menghambat reseptor non-mutasi (6VSB)  dengan energi ikatan -5.34 kcal/mol dan  mutan D614G (7KDL) dengan energi ikatan -5.72 kcal/mol dengan hasil   prediksi ADME memenuhi   aturan   lipinski   dan   tidak   menunjukan   adanya   aktivitas    toksisitas hepatotoksik dan nefrotoksik yang bermakna.
日冕病毒是一种由新病毒引起的危险的传染病。继续探索活跃的天然材料抗病毒血清。一种生长在印度尼西亚的植物,可以在二氧化物中抑制萨斯- cov -2蛋白刺集,但它对突变体D614G SARS-CoV-2的作用还不清楚。本研究的目的是研究雄激素分泌和桑biloto草本植物(androbiiode paniculata)的代谢活性,以研究二氧化硅蛋白(D614G SARS-CoV-2蛋白的突变。这项研究使用硅胶的分子增强方法。分子培养方法使用1.5.6自动工具进行分析,并使用2017年探索工作室生物技术进行分析,然后预测ADME使用瑞士软件ADME和在线软件来分析其毒性。研究结果表明,有稳定的化合物23 andrographolide衍生品获得更好的纽带的andrographolide即14-Acetyl-3,19-isopropylideneandrographolide化合物化合物可以抑制受体non-mutasi (6VSB) 5纽带。34 kcal / mol的能量和D614G突变(7KDL) 5纽带。72 kcal / mol的能量与预测结果ADME满足lipinski规则并没有显示任何毒性活动有意义的肝毒性和新毒性。
本文章由计算机程序翻译,如有差异,请以英文原文为准。
求助全文
约1分钟内获得全文 求助全文
来源期刊
自引率
0.00%
发文量
0
×
引用
GB/T 7714-2015
复制
MLA
复制
APA
复制
导出至
BibTeX EndNote RefMan NoteFirst NoteExpress
×
提示
您的信息不完整,为了账户安全,请先补充。
现在去补充
×
提示
您因"违规操作"
具体请查看互助需知
我知道了
×
提示
确定
请完成安全验证×
copy
已复制链接
快去分享给好友吧!
我知道了
右上角分享
点击右上角分享
0
联系我们:info@booksci.cn Book学术提供免费学术资源搜索服务,方便国内外学者检索中英文文献。致力于提供最便捷和优质的服务体验。 Copyright © 2023 布克学术 All rights reserved.
京ICP备2023020795号-1
ghs 京公网安备 11010802042870号
Book学术文献互助
Book学术文献互助群
群 号:604180095
Book学术官方微信