Identification of tree species using a machine learning algorithm based on leaf shape and venation pattern

Y. Minowa, Raki Takami, M. Suguri, Moeko Ashida, Yuhsuke Yoshimura
{"title":"Identification of tree species using a machine learning algorithm based on leaf shape and venation pattern","authors":"Y. Minowa, Raki Takami, M. Suguri, Moeko Ashida, Yuhsuke Yoshimura","doi":"10.20659/jjfp.53.1_1","DOIUrl":null,"url":null,"abstract":"*連絡先(Corresponding author)E-mail : sharmy@uf.kpu.ac.jp 1 京都府立大学大学院生命環境科学研究科(606-8522 京都市左京区下鴨半木町1-5) Graduate School of Life and Environmental Sciences, Kyoto Prefectural University, 1-5 Shimogamo-hangi cho, Sakyo-ku, Kyoto 606-8522, Japan 2 京都府立大学生命環境学部(606-8522 京都市左京区下鴨半木町1-5) Faculty of Life and Environmental Sciences, Kyoto Prefectural University, 1-5 Shimogamo-hangi cho, Sakyo-ku, Kyoto 606-8522, Japan 3 京都大学大学院農学研究科(606-8502 京都市左京区北白川追分町) Graduate School of Agriculture, Kyoto University, Kitashirakawa-oiwake cho, Sakyo-ku, Kyoto 606-8502, Japan 4 京都大学大学農学部(606-8502 京都市左京区北白川追分町) Faculty of Agriculture, Kyoto University, Kitashirakawa-oiwake cho, Sakyo-ku, Kyoto 606-8502, Japan 美濃羽靖・高味楽生・村主勝彦・芦田萌子・吉村勇祐:葉の形状および葉脈情報を用いた機械学習による樹種 分類,森林計画誌53:1~14,2019 本研究は,葉から形状および葉脈情報を抽出し,機械学習を用いて樹種判 別を試みた。葉は京都大学構内に成立する樹木38種からそれぞれ10枚を採取した。形状情報には円形度,短径・ 長径比,周囲長・最適楕円軌道比を,葉脈情報にはHOG特徴量を用いた。また,葉の全体や部分についての フラクタル次元を算出した。機械学習には決定木(J48および RandomForest)およびニューラルネットワー ク(MultilayerPerceptorn)を用い,判別精度は正答率を用いた。汎化性(未知事例に対する判別精度)につ いては,交差検証法および検証用データ用いて検証した。未学習,過学習については,集団学習を用いて検証 した。その結果,訓練事例の判別精度は,フラクタル次元のみではどの学習モデルも正答率は低かったが,形 状情報を用いた場合は全体的に高い正答率が得られ,さらに,形状情報とフラクタル次元を同時に用いること により,判別精度は向上する傾向を示した。また,葉脈情報のみでも,全体的に高い正答率を示した。一方, 未知事例に対する判別精度は,形状情報およびフラクタル次元を同時に用いた場合では65.3%(J48)から 78.8%(RandomForest),葉脈情報のみを用いた場合では,12.5%(J48)から43.9%(MultilayerPerceptorn, 学習回数500回)となった。","PeriodicalId":234210,"journal":{"name":"Japanese Journal of Forest Planning","volume":"1 1","pages":"0"},"PeriodicalIF":0.0000,"publicationDate":"2019-11-25","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":"4","resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":null,"PeriodicalName":"Japanese Journal of Forest Planning","FirstCategoryId":"1085","ListUrlMain":"https://doi.org/10.20659/jjfp.53.1_1","RegionNum":0,"RegionCategory":null,"ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":null,"EPubDate":"","PubModel":"","JCR":"","JCRName":"","Score":null,"Total":0}
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Abstract

*連絡先(Corresponding author)E-mail : sharmy@uf.kpu.ac.jp 1 京都府立大学大学院生命環境科学研究科(606-8522 京都市左京区下鴨半木町1-5) Graduate School of Life and Environmental Sciences, Kyoto Prefectural University, 1-5 Shimogamo-hangi cho, Sakyo-ku, Kyoto 606-8522, Japan 2 京都府立大学生命環境学部(606-8522 京都市左京区下鴨半木町1-5) Faculty of Life and Environmental Sciences, Kyoto Prefectural University, 1-5 Shimogamo-hangi cho, Sakyo-ku, Kyoto 606-8522, Japan 3 京都大学大学院農学研究科(606-8502 京都市左京区北白川追分町) Graduate School of Agriculture, Kyoto University, Kitashirakawa-oiwake cho, Sakyo-ku, Kyoto 606-8502, Japan 4 京都大学大学農学部(606-8502 京都市左京区北白川追分町) Faculty of Agriculture, Kyoto University, Kitashirakawa-oiwake cho, Sakyo-ku, Kyoto 606-8502, Japan 美濃羽靖・高味楽生・村主勝彦・芦田萌子・吉村勇祐:葉の形状および葉脈情報を用いた機械学習による樹種 分類,森林計画誌53:1~14,2019 本研究は,葉から形状および葉脈情報を抽出し,機械学習を用いて樹種判 別を試みた。葉は京都大学構内に成立する樹木38種からそれぞれ10枚を採取した。形状情報には円形度,短径・ 長径比,周囲長・最適楕円軌道比を,葉脈情報にはHOG特徴量を用いた。また,葉の全体や部分についての フラクタル次元を算出した。機械学習には決定木(J48および RandomForest)およびニューラルネットワー ク(MultilayerPerceptorn)を用い,判別精度は正答率を用いた。汎化性(未知事例に対する判別精度)につ いては,交差検証法および検証用データ用いて検証した。未学習,過学習については,集団学習を用いて検証 した。その結果,訓練事例の判別精度は,フラクタル次元のみではどの学習モデルも正答率は低かったが,形 状情報を用いた場合は全体的に高い正答率が得られ,さらに,形状情報とフラクタル次元を同時に用いること により,判別精度は向上する傾向を示した。また,葉脈情報のみでも,全体的に高い正答率を示した。一方, 未知事例に対する判別精度は,形状情報およびフラクタル次元を同時に用いた場合では65.3%(J48)から 78.8%(RandomForest),葉脈情報のみを用いた場合では,12.5%(J48)から43.9%(MultilayerPerceptorn, 学習回数500回)となった。
利用基于叶片形状和脉状模式的机器学习算法识别树种
联系方式(Corresponding author)电子邮箱:sharmy@uf.kpu.ac.jp 1京都府立大学大学院生命环境科学研究科(606-8522京都市左京区下鸭半木町1-5)Graduate School of Life and环境科学,Kyoto Prefectural University, 1-5 Shimogamo-hangi cho, Sakyo-ku,kyoto 606 -8522,Japan 2京都府立大学生命环境学部(606-8522京都市左京区下鸭半木町1-5)Faculty of Life and Environmental Sciences,Kyoto大学,1-5 Shimogamo-hangi cho, Sakyo-ku, Kyoto 606-8522,Japan 3京都大学大学院农学研究科(606-8502京都市左京区北白川追分町)Graduate School of Agriculture, Kyoto University,kashirakawa -oiwake cho, Kyoto 606-8502,Japan 4京都大学农学部(606-8502京都市左京区北白川追分町)Faculty of Agriculture, Kyoto University,kashirakawa -oiwake cho, Kyoto 606-8502,Japan美浓羽靖、高味乐生、村主胜彦、芦田萌子、吉村勇祐:利用叶子的形状和叶脉信息的机器学习树种分类,森林计划志53:1~ 14201本研究从叶子中提取形状及叶脉信息,并尝试使用机器学习辨别树种。树叶是从京都大学校内38种树木中分别采集的10枚。形状信息采用圆形度、短径和长径比、周长和最佳椭圆轨道比,叶脉信息采用HOG特征量。另外,计算出了叶子的整体和部分的分形维度。机器学习采用决策树(J48及RandomForest)及神经网络(MultilayerPerceptorn),判别精度采用正确率。关于泛化性(对未知案例的判别精度),使用交叉验证法及验证用数据进行了验证。对于未学习和过度学习,用集体学习进行了验证。结果显示,在训练案例的判断精度方面,仅使用分形维度时,任何学习模型的正确率都很低,但使用形状信息时,整体正确率很高。此外,同时使用形状信息和分形维度时由此显示出了提高判别精度的趋势。另外,仅叶脉信息也显示出了整体较高的正确率。另一方面,同时使用形状信息和分形维度时,对未知案例的判别精度为65.3%(J48)78.8%(RandomForest),仅使用叶脉信息的情况下,从12.5%(J48)提高到43.9%(MultilayerPerceptorn,学习次数500次)。
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