МОДЕЛИ МАКСИМАЛЬНОЙ ЭНТРОПИИ И ПРОСТРАНСТВЕННОЕ РАСПРЕДЕЛЕНИЕ ВИДОВ ДОННЫХ СООБЩЕСТВ НА ТЕРРИТОРИИ СРЕДНЕГО И НИЖНЕГО ПОВОЛЖЬЯ

В. К. Шитиков, Татьяна Дмитриевна Зинченко, Л. В. Головатюк
{"title":"МОДЕЛИ МАКСИМАЛЬНОЙ ЭНТРОПИИ И ПРОСТРАНСТВЕННОЕ РАСПРЕДЕЛЕНИЕ ВИДОВ ДОННЫХ СООБЩЕСТВ НА ТЕРРИТОРИИ СРЕДНЕГО И НИЖНЕГО ПОВОЛЖЬЯ","authors":"В. К. Шитиков, Татьяна Дмитриевна Зинченко, Л. В. Головатюк","doi":"10.24852/2411-7374.2021.2.10.16","DOIUrl":null,"url":null,"abstract":"Представлены результаты применения метода максимальной энтропии (MaxEnt) для моделирования пространственного распределения видов макрозообентоса на территории Среднего и Нижнего Поволжья. Использовались данные гидробиологического мониторинга многолетних (1990-2019 гг.) исследований донных сообществ в 108 средних и малых реках. В качестве независимых переменных, отражающих условия среды, построенные модели включали климатические и ландшафтные показатели растрового типа, загружаемые с сервера WorldClim (средние температуры, количество осадков, высота и вертикальная расчлененность рельефа). Приводятся результаты тестирования качества и прогнозирующей силы моделей, а также статистические показатели относительной важности каждого из использованных абиотических факторов. Обсуждаются проблемы использования различных алгоритмов построения моделей пространственного распределения видов применительно к данным гидробиологических наблюдений пресноводных лотических экосистем. \nБиблиографические ссылки \n1. Зинченко Т.Д. Эколого-фаунистическая характеристика хирономид (Diptera, Chhironomidae) малых рек бассейна Cредней и Нижней Волги (Атлас). Тольятти: Кассандра, 2011. 258 с. \n2. Лисовский А.А., Дудов С.В., Оболенская Е.В. Преимущества и ограничения использования методов экологического моделирования ареалов. 1. Общие подходы // Журнал общей биологии. 2020. Т. 81. №2. С. 123–134. \n3. Лисовский А.А., Дудов С.В. Преимущества и ограничения использования методов экологического моделирования ареалов. 2. MaxEnt // Журнал общей биологии. 2020а. Т. 81. №2. С. 135–146. \n4. Монаков А.В. Питание пресноводных беспозвоночных / Под ред. А.А. Стрелкова. М., 1998. 218 с. \n5. Шитиков В.К., Зинченко Т.Д. Статистический анализ структурной изменчивости донных сообществ и проверка гипотезы речного континуума // Водные ресурсы. 2014. Т. 41, №5. С. 530–540. \n6. Шитиков В.К., Мастицкий С.Э. Классификация, регрессия и другие алгоритмы Data Mining с использованием R. Электронная книга. 2017. 351 с. URL: https://stok1946.blogspot.com (Дата обращения 10.10.2020). \n7. Franklin J. Mapping Species distributions: spatial inference and prediction. Cambridge: Cambridge University Press, 2009. 320 p. \n8. García-Roselló E., Guisande C., Heine J., Pelayo-Villamil P., Manjarrés-Hernández A., González-Vilas L., González‐Dacosta J., Vaamonde A., Granado‐Lorencio C. Using MODESTR to download, import and clean species distribution records // Methods in ecology and evolution. 2014. V. 5. P. 703–713. DOI: 10.1111/2041-210X.12209 \n9. Golovatyuk L.V., Shitikov V.K., Zinchenko T.D. Estimation of the zonal distribution of species of bottom communities in lowland rivers of the middle and Lower Volga basin // Biology bulletin. 2018. V. 45 (10). Р. 1262–1268. \n10. González-Vilas L., Guisande C., Vari R., Pelayo-Villamil P., Manjarrés-Hernández A., García-Roselló E., González-Dacostae J., Heinee J., Pérez-Costasa E., Granado-Lorenciof C., Palau-Ibarsg A., Loboh J.M. Geospatial data of freshwater habitats for macroecological studies: an example with freshwater fishes // International journal of geographical information science. 2015. V.30, Iss.1, P. 126-141. DOI: 10.1080/13658816.2015.1072629 \n11. Guisan A., Thuiller W., Zimmermann N.E. Habitat suitability and distribution models: with applications in R. Cambridge: Cambridge University Press, 2017. 478 p. \n12. Guisande C., Garcia-Rosello E., Heine J., Gonzalez-Dacosta J., Gonzalez-Vilas L., Garcia-Perez B., Lobo J.M. SPEDInstabR: an algorithm based on a fluctuation index for selecting predictors in species distribution modeling // Ecological Informatics. 2017. V. 37. P. 18–23. \n13. Harte J. Maximum entropy and ecology: a theory of abundance, distribution, and energetics. London: Oxford University Press, 2011. 257 p. \n14. Hastie T., Fithian W. Inference from controversy // Ecography. 2013. V. 36. P. 864–867. \n15. Hijmans R.J., Cameron S.E., Parra J.L., Jones P.G., JarvisA. Very high resolution interpolated climate surfaces for global land areas // International journal of climatology. 2005. V. 25. P. 1965‒1978. \n16. Johnson D.H. The Comparison of usage and availability measurements for evaluating resource preference // Ecology. 1980. V. 61, N 1. P. 65‒71. \n17. Koleff P., Gaston K.J. Latitudinal gradients in diversity: real patterns and random models // Ecography. 2001. V. 24. Р. 341–351. \n18. Manni F., Guerard E., Heyer E. Geographic patterns of (genetic, morphologic, linguistic) variation: how barriers can be detected by using Monmonier’s algorithm // Human biology. 2004. V. 76, №2. Р. 173‒190. \n19. Norberg A., Abrego N., Blanchet F.G., Adler F.R., Anderson B.J. et al. A comprehensive evaluation of predictive performance of 33 species distribution models at species and community levels // Ecological monographs. 2019. V. 89, №3. P. e01370. \n20. Peterson A.T., Soberón J., Pearson R.G., Anderson R.P., Martínez-Meyer E, Nakamura M., Araújo M.B. Ecological niches and geographic distributions (MPB-49). Princeton: Princeton Univ. Press, 2011. 328 p. \n21. Phillips S.J., Anderson R.P., Schapire R.E. Maximum entropy modeling of species geographic distributions // Ecological modelling. 2006. V. 190, №3–4. P. 231–259.","PeriodicalId":376874,"journal":{"name":"Российский журнал прикладной экологии","volume":"216 1","pages":"0"},"PeriodicalIF":0.0000,"publicationDate":"2021-06-25","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":"1","resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":null,"PeriodicalName":"Российский журнал прикладной экологии","FirstCategoryId":"1085","ListUrlMain":"https://doi.org/10.24852/2411-7374.2021.2.10.16","RegionNum":0,"RegionCategory":null,"ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":null,"EPubDate":"","PubModel":"","JCR":"","JCRName":"","Score":null,"Total":0}
引用次数: 1

Abstract

Представлены результаты применения метода максимальной энтропии (MaxEnt) для моделирования пространственного распределения видов макрозообентоса на территории Среднего и Нижнего Поволжья. Использовались данные гидробиологического мониторинга многолетних (1990-2019 гг.) исследований донных сообществ в 108 средних и малых реках. В качестве независимых переменных, отражающих условия среды, построенные модели включали климатические и ландшафтные показатели растрового типа, загружаемые с сервера WorldClim (средние температуры, количество осадков, высота и вертикальная расчлененность рельефа). Приводятся результаты тестирования качества и прогнозирующей силы моделей, а также статистические показатели относительной важности каждого из использованных абиотических факторов. Обсуждаются проблемы использования различных алгоритмов построения моделей пространственного распределения видов применительно к данным гидробиологических наблюдений пресноводных лотических экосистем. Библиографические ссылки 1. Зинченко Т.Д. Эколого-фаунистическая характеристика хирономид (Diptera, Chhironomidae) малых рек бассейна Cредней и Нижней Волги (Атлас). Тольятти: Кассандра, 2011. 258 с. 2. Лисовский А.А., Дудов С.В., Оболенская Е.В. Преимущества и ограничения использования методов экологического моделирования ареалов. 1. Общие подходы // Журнал общей биологии. 2020. Т. 81. №2. С. 123–134. 3. Лисовский А.А., Дудов С.В. Преимущества и ограничения использования методов экологического моделирования ареалов. 2. MaxEnt // Журнал общей биологии. 2020а. Т. 81. №2. С. 135–146. 4. Монаков А.В. Питание пресноводных беспозвоночных / Под ред. А.А. Стрелкова. М., 1998. 218 с. 5. Шитиков В.К., Зинченко Т.Д. Статистический анализ структурной изменчивости донных сообществ и проверка гипотезы речного континуума // Водные ресурсы. 2014. Т. 41, №5. С. 530–540. 6. Шитиков В.К., Мастицкий С.Э. Классификация, регрессия и другие алгоритмы Data Mining с использованием R. Электронная книга. 2017. 351 с. URL: https://stok1946.blogspot.com (Дата обращения 10.10.2020). 7. Franklin J. Mapping Species distributions: spatial inference and prediction. Cambridge: Cambridge University Press, 2009. 320 p. 8. García-Roselló E., Guisande C., Heine J., Pelayo-Villamil P., Manjarrés-Hernández A., González-Vilas L., González‐Dacosta J., Vaamonde A., Granado‐Lorencio C. Using MODESTR to download, import and clean species distribution records // Methods in ecology and evolution. 2014. V. 5. P. 703–713. DOI: 10.1111/2041-210X.12209 9. Golovatyuk L.V., Shitikov V.K., Zinchenko T.D. Estimation of the zonal distribution of species of bottom communities in lowland rivers of the middle and Lower Volga basin // Biology bulletin. 2018. V. 45 (10). Р. 1262–1268. 10. González-Vilas L., Guisande C., Vari R., Pelayo-Villamil P., Manjarrés-Hernández A., García-Roselló E., González-Dacostae J., Heinee J., Pérez-Costasa E., Granado-Lorenciof C., Palau-Ibarsg A., Loboh J.M. Geospatial data of freshwater habitats for macroecological studies: an example with freshwater fishes // International journal of geographical information science. 2015. V.30, Iss.1, P. 126-141. DOI: 10.1080/13658816.2015.1072629 11. Guisan A., Thuiller W., Zimmermann N.E. Habitat suitability and distribution models: with applications in R. Cambridge: Cambridge University Press, 2017. 478 p. 12. Guisande C., Garcia-Rosello E., Heine J., Gonzalez-Dacosta J., Gonzalez-Vilas L., Garcia-Perez B., Lobo J.M. SPEDInstabR: an algorithm based on a fluctuation index for selecting predictors in species distribution modeling // Ecological Informatics. 2017. V. 37. P. 18–23. 13. Harte J. Maximum entropy and ecology: a theory of abundance, distribution, and energetics. London: Oxford University Press, 2011. 257 p. 14. Hastie T., Fithian W. Inference from controversy // Ecography. 2013. V. 36. P. 864–867. 15. Hijmans R.J., Cameron S.E., Parra J.L., Jones P.G., JarvisA. Very high resolution interpolated climate surfaces for global land areas // International journal of climatology. 2005. V. 25. P. 1965‒1978. 16. Johnson D.H. The Comparison of usage and availability measurements for evaluating resource preference // Ecology. 1980. V. 61, N 1. P. 65‒71. 17. Koleff P., Gaston K.J. Latitudinal gradients in diversity: real patterns and random models // Ecography. 2001. V. 24. Р. 341–351. 18. Manni F., Guerard E., Heyer E. Geographic patterns of (genetic, morphologic, linguistic) variation: how barriers can be detected by using Monmonier’s algorithm // Human biology. 2004. V. 76, №2. Р. 173‒190. 19. Norberg A., Abrego N., Blanchet F.G., Adler F.R., Anderson B.J. et al. A comprehensive evaluation of predictive performance of 33 species distribution models at species and community levels // Ecological monographs. 2019. V. 89, №3. P. e01370. 20. Peterson A.T., Soberón J., Pearson R.G., Anderson R.P., Martínez-Meyer E, Nakamura M., Araújo M.B. Ecological niches and geographic distributions (MPB-49). Princeton: Princeton Univ. Press, 2011. 328 p. 21. Phillips S.J., Anderson R.P., Schapire R.E. Maximum entropy modeling of species geographic distributions // Ecological modelling. 2006. V. 190, №3–4. P. 231–259.
中伏尔和下伏尔地区最大熵和下伏尔社区物种的空间分布模型
在伏尔加河中下伏尔加河地区,最大熵(MaxEnt)模拟巨兽物种的空间分布的结果。在108条中小河流中,使用了对下游社区(1990-2019年)多年生(1990-2019年)研究的水生物监测数据。作为反映环境条件的独立变量,构建模型包括从WorldClim服务器下载的气候和景观指标(平均温度、降雨量、高度和垂直切割)。这些结果包括模型的质量测试和预测能力,以及每个非生物因素的相对重要性的统计指标。讨论使用不同的算法来构建物种空间分布模型,适用于淡水丰富生态系统的水生物观测数据。书目参考一喜琴科t . d .生态学特征(Diptera, Chhironomidae)小河床和下伏尔加河(阿特拉斯)。卡珊德拉2011年258秒lisovsky a ., doudov s ., obolena e .,利用环境建模方法的优势和局限性。1. 一般方法//一般生物学杂志。2020. t . 81。№2。c . 123 - 134。3. lisovsky a ., doudov s .,环境建模方法的优点和局限性。2. MaxEnt //一般生物学杂志。2020а。t . 81。№2。c . 135 - 146。4. a . v .僧侣们吃淡水无脊椎动物/红色食物。a.a.步枪。m, 1998。218秒shitik, zinchenko t .统计分析底部社区的结构波动,并检验河流连续体假设// /水。2014. t . 41,№5。c . 530 - 540。6. sitik、mastitsky s.e.分类、回归和其他使用R.电子书的数据挖掘算法。2017. 351和URL: 10.10.2020 https://stok1946.blogspot.com(流通)。7. 富兰克林·j·马匹斯特别斯:种族偏见和偏见。剑桥:剑桥大学出版社,2009年。320p . 8Garcia E, Guisande C, Heine J, Pelayo Villamil P, Gonzalez J, Gonzalez J, Vaamonde J, Gonzalez C。2014. v . 5。p . 703 - 713。DOI: 10.1111/2041 210X。12209 9。Golovatyuk L.V, Shitikov V.K, Zinchenko T.D.描述了在lowland河流中发现的bottom群体。2018. v45 (10)r . 1262 - 1268。10. 格纳兹·维勒斯·L,古兹兰C,瓦利·C,曼加雷·埃·罗塞洛·J,帕纳兹·科斯塔卡·E,帕拉萨·科斯塔卡,帕拉兹·科斯塔卡,帕拉兹·科斯塔卡,格拉兹·科斯塔卡,格罗萨·科斯塔卡,格洛斯·格洛斯·格洛斯·格洛斯·格洛斯·格洛斯·格洛斯·格洛斯·格洛斯·格洛斯·格洛斯·格洛斯·格洛斯·格洛斯·格洛斯·格洛斯·格洛斯·格洛斯·格洛斯·格洛斯·格洛斯·格洛斯·格洛斯·格洛斯·格洛斯·格洛斯·格洛斯·格洛斯·格洛斯·格洛斯·格洛斯·格洛斯·格洛斯·格洛斯·格洛斯·格洛斯·格洛斯·格洛斯·格尔·格尔斯沃特·格尔斯沃特的大工作室,2015. V.30, Iss.1, P. 126-141。DOI: 10.1080/13658816.2015.1072629 11。Guisan A, Thuiller W, Zimmermann n habitaty和分区模型:r Cambridge:剑桥大学出版社,2017。478 p 12Guisande C, Garcia C, Heine J, Gonzalez-Vilas L, Garcia J, Perez B, Lobo J. SPEDInstabR:v . 37。p . 18 - 23。13. Harte J. maximpy和ecology: abundance、分裂和能量理论。伦敦:牛津大学出版社,2011年。257 p 142013年,来自控制// Ecography的菲亚特v . Inference。v . 36。p . 864 - 867。15. Hijmans R.J, Cameron S.E, Parra J.L, Jones P.G, JarvisA。这是全球areas //国际统计杂志的高级重组。2005. v . 25。1965年p - 1978。16. 1980年,约翰逊·d·h·约翰逊和availability measurements。v61, N 1p . 65 - 71。17. Koleff P., Gaston K.J. Latitudinal gradients在多样化:真实的patterns和random模型// Ecography。v . 24。341 . 351。18. 《卫报》、《卫报》、《卫报》、《卫报》、《卫报》、《卫报》、《卫报》、《卫报》、《卫报》和《人类生物学》。2004. v . 76,№2。r . 173 - 190。19. 诺伯格,Abrego N, Blanchet F.G, Adler F.R, Anderson B.J.等。33种不同类型的模特儿和社区模式// Ecological monographs。2019. v . 89№3。p . e01370。20. 彼得森A.T,皮尔逊·r·p,马丁·r·p,纳克穆拉·M,阿奥乔·M·埃奥古斯特和地理分段(MPB-49)。普林斯顿:普林斯顿大学,2011年出版社。328 p 21
本文章由计算机程序翻译,如有差异,请以英文原文为准。
求助全文
约1分钟内获得全文 求助全文
来源期刊
自引率
0.00%
发文量
0
×
引用
GB/T 7714-2015
复制
MLA
复制
APA
复制
导出至
BibTeX EndNote RefMan NoteFirst NoteExpress
×
提示
您的信息不完整,为了账户安全,请先补充。
现在去补充
×
提示
您因"违规操作"
具体请查看互助需知
我知道了
×
提示
确定
请完成安全验证×
copy
已复制链接
快去分享给好友吧!
我知道了
右上角分享
点击右上角分享
0
联系我们:info@booksci.cn Book学术提供免费学术资源搜索服务,方便国内外学者检索中英文文献。致力于提供最便捷和优质的服务体验。 Copyright © 2023 布克学术 All rights reserved.
京ICP备2023020795号-1
ghs 京公网安备 11010802042870号
Book学术文献互助
Book学术文献互助群
群 号:604180095
Book学术官方微信
小红书