Display of Molecular Dynamics Simulation Results by MXDORTO with Web Browser. Interactive and Simple Display Program with GUI.

Abstract

MXDORTOによる分子動力学シミュレーションによって得られる物質の構造を３次元グラフィックスとしてパソコン上で表示するため，MXDORTOによって得られた原子配置データからVRMLファイルを生成するプログラムを作成した．生成されたVRMLファイルはWebブラウザーとプラグインソフトを利用することにより，精細な３次元グラフィックスとして表示され，様々に視点を変えて構造を観察することが可能であった．本プログラムはWindows上で動作し，GUIを備えていることから，広く利用しやすいものとなっている．