Interaksi Konstituen Kimia Lada Hitam (Piper nigrum L.) Terhadap Reseptor 5-HT1B Sebagai Antidepresan dengan Pendekatan In Silico

Nadia Adhani Sufi, Judith Nauroh, Neng Vera Nurani, Annida Adha Nurhaenifah, Jacko Abiwaqash Harmonis, S. Hidayat
{"title":"Interaksi Konstituen Kimia Lada Hitam (Piper nigrum L.) Terhadap Reseptor 5-HT1B Sebagai Antidepresan dengan Pendekatan In Silico","authors":"Nadia Adhani Sufi, Judith Nauroh, Neng Vera Nurani, Annida Adha Nurhaenifah, Jacko Abiwaqash Harmonis, S. Hidayat","doi":"10.24198/ijbp.v2i3.42965","DOIUrl":null,"url":null,"abstract":"Depresi merupakan penyakit yang mempengaruhi perasaan, cara berpikir, dan tindakan. Depresi menyebabkan perasaan sedih dan / hilangnya minat pada suatu aktivitas. Depresi dapat diobati menggunakan antidepresan. Piper nigrum L. atau Lada Hitam merupakan tanaman yang dapat digunakan sebagai antidepresan. Pada lada hitam terkandung senyawa metabolit sekunder yang dapat sebagai antidepresan dengan mekanisme terhadap 5-HT1B. Penelitian ini bertujuan untuk mempelajari interaksi antara senyawa yang terkandung pada lada hitam yang berpotensi sebagai antidepresan terhadap protein 5-HT1B menggunakan metode molecular docking secara in silico. Pengujian dilakukan menggunakan aplikasi Autodock 4.2 untuk simulasi penambatan molekuler, divisualisasi dengan  Biovia Discovery Studio 2020 Client, dan analisis hasil farmakokinetika serta toksisitas dari senyawa melalui situs pre-ADMET. Hasil penambatan diperoleh senyawa piperettin memiliki potensi paling besar menjadi kandidat obat antidepresan melalui mekanisme agonis 5-HT1B dibandingkan senyawa uji lainnya karena memiliki energi ikatan sebesar -8,84 kKal/mol dengan ikatan hidrogen pada residu asam amino THR134. Berdasarkan analisis hasil prediksi, Piperettin memiliki sifat farmakokinetika dengan nilai CaCo-2 54,6793; HIA 98,050270% ; PPB  92,408768%. Hasil pre-ADMET senyawa menunjukan adanya dugaan potensi karsinogen.Kata kunci: 5-HT1B, Antidepresan, Molecular Docking, Piperettin, Piper nigrum ","PeriodicalId":185156,"journal":{"name":"Indonesian Journal of Biological Pharmacy","volume":"14 1","pages":"0"},"PeriodicalIF":0.0000,"publicationDate":"2022-12-27","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":"0","resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":null,"PeriodicalName":"Indonesian Journal of Biological Pharmacy","FirstCategoryId":"1085","ListUrlMain":"https://doi.org/10.24198/ijbp.v2i3.42965","RegionNum":0,"RegionCategory":null,"ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":null,"EPubDate":"","PubModel":"","JCR":"","JCRName":"","Score":null,"Total":0}
引用次数: 0

Abstract

Depresi merupakan penyakit yang mempengaruhi perasaan, cara berpikir, dan tindakan. Depresi menyebabkan perasaan sedih dan / hilangnya minat pada suatu aktivitas. Depresi dapat diobati menggunakan antidepresan. Piper nigrum L. atau Lada Hitam merupakan tanaman yang dapat digunakan sebagai antidepresan. Pada lada hitam terkandung senyawa metabolit sekunder yang dapat sebagai antidepresan dengan mekanisme terhadap 5-HT1B. Penelitian ini bertujuan untuk mempelajari interaksi antara senyawa yang terkandung pada lada hitam yang berpotensi sebagai antidepresan terhadap protein 5-HT1B menggunakan metode molecular docking secara in silico. Pengujian dilakukan menggunakan aplikasi Autodock 4.2 untuk simulasi penambatan molekuler, divisualisasi dengan  Biovia Discovery Studio 2020 Client, dan analisis hasil farmakokinetika serta toksisitas dari senyawa melalui situs pre-ADMET. Hasil penambatan diperoleh senyawa piperettin memiliki potensi paling besar menjadi kandidat obat antidepresan melalui mekanisme agonis 5-HT1B dibandingkan senyawa uji lainnya karena memiliki energi ikatan sebesar -8,84 kKal/mol dengan ikatan hidrogen pada residu asam amino THR134. Berdasarkan analisis hasil prediksi, Piperettin memiliki sifat farmakokinetika dengan nilai CaCo-2 54,6793; HIA 98,050270% ; PPB  92,408768%. Hasil pre-ADMET senyawa menunjukan adanya dugaan potensi karsinogen.Kata kunci: 5-HT1B, Antidepresan, Molecular Docking, Piperettin, Piper nigrum 
黑胡椒化学成分的相互作用。5-HT1B受体作为一种抗抑郁剂在硅科的方法
抑郁症是一种影响感情、思维和行为的疾病。抑郁会导致对某些活动的悲伤和/失去兴趣。抑郁症可以用抗抑郁药治疗。黑胡椒是一种可以用作抗抑郁药的植物。黑胡椒中含有一种二级代谢化合物,可作为一种抗抑郁药,具有5-HT1B的机制。这项研究的目的是研究一种使用二氧化硅中的分子对接方法,研究黑胡椒中含有的可能抗抑郁的化合物之间的相互作用。测试使用Autodock 4.2应用程序进行分子增强模拟、通过2020年生物探索工作室进行分级分析、通过站点前广告分析和化合物毒性。采购的化合物piperettin通过激动剂5-HT1B比其他化合物更有可能成为抗抑郁药物的候选者,因为它有- 884 kKal/mol的能量键以及氨基酸残留的氢键。根据预测结果的分析,Piperettin具有CaCo-2 54.6793道德规范的性质;它是98.050270%;PPB 92,408768%。前期化合物显示可能存在致癌物质。关键词:5-HT1B,抗抑郁药,分子内化,Piperettin, Piper nigrum
本文章由计算机程序翻译,如有差异,请以英文原文为准。
求助全文
约1分钟内获得全文 求助全文
来源期刊
自引率
0.00%
发文量
0
×
引用
GB/T 7714-2015
复制
MLA
复制
APA
复制
导出至
BibTeX EndNote RefMan NoteFirst NoteExpress
×
提示
您的信息不完整,为了账户安全,请先补充。
现在去补充
×
提示
您因"违规操作"
具体请查看互助需知
我知道了
×
提示
确定
请完成安全验证×
copy
已复制链接
快去分享给好友吧!
我知道了
右上角分享
点击右上角分享
0
联系我们:info@booksci.cn Book学术提供免费学术资源搜索服务,方便国内外学者检索中英文文献。致力于提供最便捷和优质的服务体验。 Copyright © 2023 布克学术 All rights reserved.
京ICP备2023020795号-1
ghs 京公网安备 11010802042870号
Book学术文献互助
Book学术文献互助群
群 号:481959085
Book学术官方微信