Circulating influenza viruses and the effectiveness of seasonal influenza vaccine in Romania, season 2012-2013 / Virusurile gripale circulante și eficacitatea vaccinului gripal sezonier în România, în sezonul 2012-2013

D. Pițigoi, G. Necula, V. Alexandrescu, M. Mihai, C. Cherciu, C. Țecu, O. Popovici, R. Popescu, E. Lupulescu
{"title":"Circulating influenza viruses and the effectiveness of seasonal influenza vaccine in Romania, season 2012-2013 / Virusurile gripale circulante și eficacitatea vaccinului gripal sezonier în România, în sezonul 2012-2013","authors":"D. Pițigoi, G. Necula, V. Alexandrescu, M. Mihai, C. Cherciu, C. Țecu, O. Popovici, R. Popescu, E. Lupulescu","doi":"10.1515/rrlm-2015-0007","DOIUrl":null,"url":null,"abstract":"Abstract Backgound. Using influenza epidemiological and virological surveillance data, we aimed at investigating the profile of influenza viruses circulating in Romania during the season 2012-2013 and estimating the effectiveness (VE) of the seasonal vaccine. Methods. We tested all specimens collected from patients with influenza like illness (ILI) in the national surveillance system between week 40/2012 to week 20/2013. Influenza A/B positive specimens identified by molecular detection (RT-PCR) were further characterized. We used hemagglutination inhibition assay for antigenic characterization and chemiluminiscence assay for the antiviral susceptibility testing. Subsequently we conducted nucleotide sequencing of hemagglutinin and neuraminidase genes and phylogenetic tree analyses. We estimated influenza VE using the test negative case-control study design, as 1-odds ratio of vaccination among ILI cases positive for influenza and ILI negative controls. Results and Discussions. We tested 1087 specimens, and 537 cases were positive (56.2% influenza B, 40.6% A(H1N1)pdm09, 3.2% A(H3N2). Sixty-four influenza viruses were antigenically and/or genetically characterized. A(H1N1)pdm09 viruses were related to the vaccine strain A/ California/07/2009 and clustered with genetic group 6 similar to A/St. Petersburg/27/2011. Influenza B viruses belonged to clade 2 of type B/Yamagata lineage, related to B/Estonia/55669/2011 except one, B/Victoria lineage, representative strain B/Brisbane/60/2008. A(H3) viruses clustered with group 3C of the A/Victoria/208/2009 clade, similar to the vaccine strain A/Victoria/361/2011. All tested strains (57) demonstrated susceptibility to oseltamivir and zanamivir. The adjusted seasonal influenza vaccine effectiveness against influenza A(H1N1)pdm09 (N=119) was 76.9% (95% CI: -113.4, 98.5), suggesting a good protection, consistent with the good match between the vaccine and circulating strains. Rezumat Scopul studiului a fost de a investiga profilul virusurilor gripale care au circulat în România în sezonul 2012- 2013 și de a estima eficacitatea vaccinului gripal sezonier, pe baza datelor de supraveghere epidemiologică si virologică. Metodă. Am testat toate probele colectate din săptămâna 40/2012 până în săptămâna 20/2013, în cadrul sistemului national de supraveghere, de la pacientii cu simptomatologie compatibilă cu gripa. Probele pozitive de gripă A/B identificate prin detecție moleculară (RT-PCR) au fost apoi caracterizate. Am utilizat hemaglutino-inhibarea pentru caracterizare antigenică si chemiluminiscenta pentru testarea sensibilitătii la antivirale. Secventierea genelor codante pentru hemaglutinină si neuraminidază si analiza lor filogenetică a fost de asemenea efectuată. Am estimat eficacitatea vaccinului gripal ca 1-odds ratio folosind un studiu caz-martor cu design negativ. Rezultate și discuții. Am testat 1087 de probe din care 537 au fost pozitive (56.2% gripă B, 40.6% A(H1N1)pdm09, 3.2% A(H3N2). Saizeci si patru dintre acestea au fost caracterizate antigenic si / sau genetic. Virusurile A(H1N1)pdm09 au fost înrudite antigenic cu tulpina vaccinală A/California/07/2009 si au apartinut grupului genetic 6 similar cu A/St. Petersburg/27/2011. Virusurile gripale tip B au apartinut cladei 2 a liniei genetice B/Yamagata, asemănătoare cu B/Estonia/55669/2011, cu excepția unei tulpini care a apartinut liniei B/ Victoria, reprezentată de tulpina B/Brisbane/60/2008. Virusurile A(H3) au apartinut grupului genetic 3C al cladei tulpinii A/Victoria/208/2009, asemănătoare cu tulpina vaccinală A/Victoria/361/2011. Toate tulpinile testate (57) au fost sensibile la oseltamivir si zanamivir. Eficacitatea vaccinală ajustată pentru gripa A(H1N1)pdm09 (N=119) a fost de 76.9% (95% CI: -113.4, 98.5), sugerând o protectie bună, în concordantă cu suprapunerea antigenică dintre tulpinile sălbatice circulante si tulpinile incluse în vaccinul recomandat pentru sezonul 2012-2013.","PeriodicalId":288498,"journal":{"name":"Romanian Review of Laboratory Medicine","volume":"47 1","pages":"0"},"PeriodicalIF":0.0000,"publicationDate":"2015-03-01","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":"6","resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":null,"PeriodicalName":"Romanian Review of Laboratory Medicine","FirstCategoryId":"1085","ListUrlMain":"https://doi.org/10.1515/rrlm-2015-0007","RegionNum":0,"RegionCategory":null,"ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":null,"EPubDate":"","PubModel":"","JCR":"","JCRName":"","Score":null,"Total":0}
引用次数: 6

Abstract

Abstract Backgound. Using influenza epidemiological and virological surveillance data, we aimed at investigating the profile of influenza viruses circulating in Romania during the season 2012-2013 and estimating the effectiveness (VE) of the seasonal vaccine. Methods. We tested all specimens collected from patients with influenza like illness (ILI) in the national surveillance system between week 40/2012 to week 20/2013. Influenza A/B positive specimens identified by molecular detection (RT-PCR) were further characterized. We used hemagglutination inhibition assay for antigenic characterization and chemiluminiscence assay for the antiviral susceptibility testing. Subsequently we conducted nucleotide sequencing of hemagglutinin and neuraminidase genes and phylogenetic tree analyses. We estimated influenza VE using the test negative case-control study design, as 1-odds ratio of vaccination among ILI cases positive for influenza and ILI negative controls. Results and Discussions. We tested 1087 specimens, and 537 cases were positive (56.2% influenza B, 40.6% A(H1N1)pdm09, 3.2% A(H3N2). Sixty-four influenza viruses were antigenically and/or genetically characterized. A(H1N1)pdm09 viruses were related to the vaccine strain A/ California/07/2009 and clustered with genetic group 6 similar to A/St. Petersburg/27/2011. Influenza B viruses belonged to clade 2 of type B/Yamagata lineage, related to B/Estonia/55669/2011 except one, B/Victoria lineage, representative strain B/Brisbane/60/2008. A(H3) viruses clustered with group 3C of the A/Victoria/208/2009 clade, similar to the vaccine strain A/Victoria/361/2011. All tested strains (57) demonstrated susceptibility to oseltamivir and zanamivir. The adjusted seasonal influenza vaccine effectiveness against influenza A(H1N1)pdm09 (N=119) was 76.9% (95% CI: -113.4, 98.5), suggesting a good protection, consistent with the good match between the vaccine and circulating strains. Rezumat Scopul studiului a fost de a investiga profilul virusurilor gripale care au circulat în România în sezonul 2012- 2013 și de a estima eficacitatea vaccinului gripal sezonier, pe baza datelor de supraveghere epidemiologică si virologică. Metodă. Am testat toate probele colectate din săptămâna 40/2012 până în săptămâna 20/2013, în cadrul sistemului national de supraveghere, de la pacientii cu simptomatologie compatibilă cu gripa. Probele pozitive de gripă A/B identificate prin detecție moleculară (RT-PCR) au fost apoi caracterizate. Am utilizat hemaglutino-inhibarea pentru caracterizare antigenică si chemiluminiscenta pentru testarea sensibilitătii la antivirale. Secventierea genelor codante pentru hemaglutinină si neuraminidază si analiza lor filogenetică a fost de asemenea efectuată. Am estimat eficacitatea vaccinului gripal ca 1-odds ratio folosind un studiu caz-martor cu design negativ. Rezultate și discuții. Am testat 1087 de probe din care 537 au fost pozitive (56.2% gripă B, 40.6% A(H1N1)pdm09, 3.2% A(H3N2). Saizeci si patru dintre acestea au fost caracterizate antigenic si / sau genetic. Virusurile A(H1N1)pdm09 au fost înrudite antigenic cu tulpina vaccinală A/California/07/2009 si au apartinut grupului genetic 6 similar cu A/St. Petersburg/27/2011. Virusurile gripale tip B au apartinut cladei 2 a liniei genetice B/Yamagata, asemănătoare cu B/Estonia/55669/2011, cu excepția unei tulpini care a apartinut liniei B/ Victoria, reprezentată de tulpina B/Brisbane/60/2008. Virusurile A(H3) au apartinut grupului genetic 3C al cladei tulpinii A/Victoria/208/2009, asemănătoare cu tulpina vaccinală A/Victoria/361/2011. Toate tulpinile testate (57) au fost sensibile la oseltamivir si zanamivir. Eficacitatea vaccinală ajustată pentru gripa A(H1N1)pdm09 (N=119) a fost de 76.9% (95% CI: -113.4, 98.5), sugerând o protectie bună, în concordantă cu suprapunerea antigenică dintre tulpinile sălbatice circulante si tulpinile incluse în vaccinul recomandat pentru sezonul 2012-2013.
抽象Backgound。利用流感流行病学和病毒学监测数据,我们旨在调查2012-2013年季节罗马尼亚流行的流感病毒概况,并估计季节性疫苗的有效性(VE)。方法。我们对2012年第40周至2013年第20周期间从国家监测系统中流感样疾病(ILI)患者采集的所有标本进行了检测。通过分子检测(RT-PCR)对流感A/B阳性标本进行进一步鉴定。我们用血凝抑制法进行抗原鉴定,用化学发光法进行抗病毒药敏试验。随后,我们进行了血凝素和神经氨酸酶基因的核苷酸测序和系统发育树分析。我们使用测试阴性病例对照研究设计来估计流感VE,在流感病毒阳性病例和流感病毒阴性对照中接种疫苗的比值比为1。结果和讨论。共检测标本1087份,阳性537例,其中B型流感56.2%,A(H1N1)pdm09 40.6%, A(H3N2) 3.2%。64种流感病毒具有抗原性和/或遗传学特征。A(H1N1)pdm09病毒与A/ California/07/2009疫苗株相关,属于与A/St相似的遗传群6。彼得堡/ 27/2011。B型流感病毒属于B型/山形谱系2支系,与B/爱沙尼亚/55669/2011相关,B/维多利亚谱系,代表株B/布里斯班/60/2008。A(H3)病毒聚集在A/Victoria/208/2009进化枝的3C组,与A/Victoria/361/2011疫苗株相似。所有检测的菌株(57株)均表现出对奥司他韦和扎那米韦的敏感性。经调整的季节性流感疫苗对甲型H1N1流感pdm09 (N=119)的有效性为76.9% (95% CI: -113.4, 98.5),表明疫苗具有良好的保护作用,与流行毒株的良好匹配一致。[中文][中文][中文][中文][中文][中文][中文][中文][中文][中文][中文][中文][中文][中文][中文][中文][中文][中文]。Metodă。在 神经网络中收集的神经问题的测试;在神经网络中收集的神经网络问题的测试;在神经网络中收集的神经网络问题的测试;可能阳性的猪瘟A/B鉴定蛋白detecție分子荧光定量pcr (RT-PCR)对猪瘟病毒进行了表征。利用血凝素抑制区渗透表征抗原性、化学发光区渗透试验区敏感性和抗病毒作用。7种常见的血凝素、血凝素、神经酰胺、丝状蛋白、丝状蛋白、丝状蛋白、丝状蛋白、丝状蛋白、丝状蛋白、丝状蛋白、丝状蛋白、丝状蛋白、丝状蛋白、丝状蛋白、丝状蛋白、丝状蛋白、丝状蛋白、丝状蛋白、丝状蛋白、丝状蛋白等。在一项研究中,我估计有效的疫苗接种可能导致1- 1的优势比为阴性。rezulate și discuții。在1087例病例中,537例阳性,其中甲型H1N1流感pdm09阳性56.2%,甲型H1N1流感pdm09阳性40.6%,甲型H3N2阳性3.2%。恙虫病是一种具有抗原性和高致病性的疾病。病毒A(H1N1)pdm09 au fost nruite抗原cu tulpina vaccinala /California/07/2009 si au apartinut grupului基因6相似cu A/St。彼得堡/ 27/2011。viruriile gripale tip B au apartinut cladei 2 a liniei gentice B/Yamagata, asemilecurintoare cu B/Estonia/55669/2011, cu excepția unei tulpini care a apartinut liniei B/ Victoria,代表de tulpina B/Brisbane/60/2008。virusile A(H3) au apartinut grupului genetic 3C al cladei tulpinii A/Victoria/208/2009, asemilecurtoare cu tulpina vaccinalei A/Victoria/361/2011。结果显示,对奥司他韦和扎那米韦最敏感。2012-2013年疫区推荐接种有效甲型H1N1流感疫苗pdm09 (N=119),接种率为76.9% (95% CI: -113.4, 98.5),接种保效疫苗、保效疫苗、保效疫苗、保效疫苗、保效疫苗、保效疫苗、保效疫苗、保效疫苗、保效疫苗。
本文章由计算机程序翻译,如有差异,请以英文原文为准。
求助全文
约1分钟内获得全文 求助全文
来源期刊
自引率
0.00%
发文量
0
×
引用
GB/T 7714-2015
复制
MLA
复制
APA
复制
导出至
BibTeX EndNote RefMan NoteFirst NoteExpress
×
提示
您的信息不完整,为了账户安全,请先补充。
现在去补充
×
提示
您因"违规操作"
具体请查看互助需知
我知道了
×
提示
确定
请完成安全验证×
copy
已复制链接
快去分享给好友吧!
我知道了
右上角分享
点击右上角分享
0
联系我们:info@booksci.cn Book学术提供免费学术资源搜索服务,方便国内外学者检索中英文文献。致力于提供最便捷和优质的服务体验。 Copyright © 2023 布克学术 All rights reserved.
京ICP备2023020795号-1
ghs 京公网安备 11010802042870号
Book学术文献互助
Book学术文献互助群
群 号:604180095
Book学术官方微信